Examinando por Materia "Bacterias"

Mostrando 1 - 12 de 12
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Análisis molecular in-silico del mecanismo de acción de las enzimas depolimerasas de los bacteriófagos vB_KpnP_BaqKPR2 de K. pneumoniae y vB_SauS_BaqSau1 de S. aureus
    (Universidad del Valle, 2024) Lozano-Solano, Dayan Surig; Acosta-Hoyos, Antonio J
    El presente trabajo tiene como objetivo proponer mecanismos de acción de las enzimas depolimerasas de los bacteriófagos vB_KpnP_BaqKPR2 de K. pneumoniae y vB_SauS_BaqSau1 de S. aureus aislados de aguas residuales de la ciudad de Barranquilla y Sahagún Córdoba, respectivamente, por lo que se consideran fagos autóctonos. Mediante este trabajo se ha podido hacer una aproximación atomística del mecanismo de acción de las depolimerasas de los bacteriófagos BaqSau1 y BaqKPR2, este es el primer estudio que brinda información acerca de la especificidad de los dominios catalíticos de una endolisina nativa hacia otros componentes importantes de la pared bacteriana en S. aureus y de igual forma brinda información importante del rol de las TSP y del dominio depolimerasa sobre la cápsula y otros componentes importantes de la pared bacteriana de K. pneumoniae. Receptores de membrana como la transglicosidasa SaGMT en S. aureus y la osmoporina OMPK36 en K. penumoniae son importantes consideradas dianas terapéuticas. Este trabajo brinda un importante avance sobre el mecanismo de acción de dichas enzimas para ser usados como enzibióticos y para futuras investigaciones que conduzcan a realizar estudios in-vitro para poder confirmar los hallazgos. La comprensión molecular del mecanismo de acción de estas depolimerasas es fundamental aumentando nuestro conocimiento sobre la biología de los bacteriófagos y su posible aplicación en el control de infecciones causadas por K. pneumoniae y S. aureus resistentes a múltiples fármacos representando una estrategia prometedora para combatir estas infecciones.
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Antibioterapia de las enfermedades periodontales : un contexto moderno.
    (2011-10-18) Contreras, Adolfo
    La etiología microbiana de las enfermedades periodontales provee las bases racionales para el uso de los antibióticos en la terapia periodontal. Desde hace mas de un siglo, el tratamiento de las enfermedades periodontales se ha basado en la hipótesis de placa dental no especifica. Esta hipótesis propone que la acumulación de las placas dentales causan las enfermedades periodontales y que su eliminación previene las periodontitis. En esta hipótesis, los tratamientos periodontales se enfocan a la reducción/eliminación de los tejidos inflamados alrededor de los dientes para reducir la profundidad de la bolsa periodontal y facilitar la limpieza de la placa por parte del profesional o del paciente. En contraste con lo anterior, hace 30 años, se empezó a reconocer que las enfermedades periodontales son causadas por bacterias específicas y que los antibióticos pueden reducir o eliminar las infecciones periodontales. Esta nueva tendencia se conoce como la hipótesis de placa dental especifica, cuyo objetivo es el de reducir las bacterias especificas que causan la perdida de los aparatos de unión dento-gingival y dento-alveolar. Existe un claro contraste en el enfoque terapéutico periodontal entre estas dos hipótesis. El enfoque quirúrgico que acompaña la hipótesis de placa dental no específica propone como objetivo principal eliminar el resultado de la infección bacteriana (la bolsa periodontal), mientras la segunda hipótesis tiene como objetivo eliminar la causa (los microorganismos periodontopático). La hipótesis de placa dental específica tiene importantes implicaciones: l)Las enfermedades periodontales pueden ser prevenidas y tratadas sin la necesidad de usar métodos invasivos, costosos y menos predecibles. 2) Las recientes observaciones sobre una posible relación entre la enfermedad periodontal y la enfermedad cardiovascular estaría a favor de la eliminación de los patógenos periodontales.
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Assessment of the influence of Escherichia coli on the immature stages of Aedes aegypti (Diptera: Culicidae) in Girardot, Colombia.
    (Universidad del Valle, 2017-06-30) Garay Gutiérrez, Lina Marcela; Pinilla Agudelo, Gabriel; García Sánchez, Diana Carolina; Quintero Espinosa, Juliana; Sociedad Colombiana de Entomología - Socolen; Universidad del Valle
    Bacterial populations are common in water, especially in ponds and sewage in urban and rural areas.Their abundance seems to affect the presence of some immature aquatic insects.This study aimed to establish the relationship between immature Aedes aegypti states and the presence of Escherichia coli in drinking water reservoirs in the city of Girardot, Colombia. Therefore, a random sampling of 30 water containers in different houses, half of them with the presence of different quantities of immature Ae. aegypti, was made. In all cases, samples were taken in order to make direct counts of E. coli in 3MTM PetrifilmTM Aqua. Nonparametric statistical tests were performed to determine differences and to correlate bacterial populations and vectors. It was found that there is a significant relationship between the number of CFU ml-1 of E. coli and the abundance of immature Ae. aegypti. It was established that there were differences in bacterial abundances between deposits with low, moderate, and high amounts of immature mosquitoes. It was verified that the increase in the number of larvae and pupae of the vector was higher as water samples had higher amounts of E. coli.
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Caracterización de fitopatógenos y su control en cucurbita moschata (Cucurbitacea) en Dagua, Valle del Cauca [recurso electrónico]
    (2019-11-25) Valencia Gómez, Jezir; Torres González, Celina
    Cucurbita moschata Duch., conocida comúnmente como zapallo, se destaca de manera especial, por su alto contenido nutricional; contiene almidones, azúcares, proteínas, vitaminas, carotenoides totales, minerales como calcio y fósforo, que le confieren propiedades nutricionales y medicinales, convirtiéndolo en un producto llamativo para el mercado internacional, especialmente en los países europeos y Norteamérica. Sin embargo existen pocos estudios en el departamento del Valle del Cauca sobre enfermedades del zapallo, por lo tanto se evaluó la presencia, incidencia y severidad de microorganismos fitopatógenos (hongos y bacterias), tomando muestras de tejido foliar de Cucurbita moschata Duch. en condiciones de campo en la vereda La Providencia, en Dagua, Valle del Cauca. De las muestras colectadas, se aislaron, purificaron, caracterizaron e identificaron microrganismos los cuales fueron sometidos a pruebas de patogenicidad en invernadero, por el método de inyección intervenal de disoluciones de 1 x 106 esporas (para hongos) o células (para bacterias) por mililitro sobre plantas sanas; resultando patógenos del zapallo el hongo Fusarium sp. y las bacterias Exiguobacterium indicum, Arthrobacter nicotinae y Pseudomonas sp., estas últimas se identificaron por análisis del gen del ARNr 16S. se realizaron pruebas de antagonismo con los insumos biológicos Bactox y Trichox para encontrar alternativas de control a estos patógenos, evidenciando que Bactox resultó ser un controlador ineficiente mientras que Trichox en todos los ensayos se comportó como un fungicida y bactericida eficiente.
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Construcción y caracterización de consorcios microbianos autoensamblados fijadores de N2 y CO2 atmosférico
    (Universidad del Valle, 2024) Suárez López, Eliana; Sanabria, Janneth; Castillo Giraldo, Andrés Orlando
    La fijación biológica de nitrógeno y dióxido de carbono, así como los mecanismos biológicos subyacentes a estos procesos han sido ampliamente estudiados; sin embargo, la exploración ecológica específica de comunidades bacterianas fuertemente seleccionadas para favorecer ambas capacidades metabólicas y sus posibles aplicaciones biotecnológicas constituye un área de investigación innovadora. La comprensión de la estructura y funcionamiento de estas comunidades puede sentar las bases para futuras aplicaciones, por ejemplo, en el campo de la agricultura, con la fabricación de biofertilizantes nitrogenados. En este estudio, se construyeron consorcios microbianos utilizando muestras de ecosistemas altamente contrastantes (suelo, lodo y materia fecal humana). Estos consorcios se autoensamblaron en un biorreactor alimentado con un medio de cultivo mineral líquido, sin adición de compuestos nitrogenados o fuentes de carbono. El sistema operó con un flujo continuo de aire atmosférico que aportó N2 y CO2 y un recambio semanal del 50% del volumen. Se realizaron mediciones de nitrógeno total, pH, densidad óptica; y análisis de diversidad bacteriana con base en secuenciación de las regiones V3 y V4 del gen 16S ribosomal, para las muestras iniciales y las comunidades autoensambladas. Además, se predijeron las funciones metabólicas para las comunidades utilizando el software PICRUSt2 y se compararon las funciones obtenidas entre las comunidades ensambladas y las iniciales. Los resultados sugieren una asociación y sintrofía entre los miembros de las comunidades como respuesta a las condiciones de selección con un favorecimiento esperado de la fijación de N2 y CO2, metabolismos altamente extendidos entre las bacterias. Entre los géneros más abundantes se encontraron Azospirillum, Gordonia, Burkholderia y Sphingobium.
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Descripción del microbioma fecal de las aves columba livia y coragyps atratus de Cali, Colombia
    (Universidad del Valle, 2023) Calderón, Miguel Á; Castillo, Andrés; López-Alvarez, Diana Carolina
    El microbiota gastrointestinal es una de las comunidades más importantes de un organismo y dados los múltiples factores que lo influencian y su posible efecto en la salud pública es clave comprender su composición y los patógenos que pueden estar presentes. Por esto, se determinó la composición del microbioma gastrointestinal de C. livia y C. atratus a partir de muestras fecales recolectadas en Cali, así como de secuencias de C. livia de Países bajos y China, C. atratus de Estados Unidos y G. fulvus de Emiratos Árabes. Se identificaron 943 ASVs en las muestras de Cali y 2415 ASVs en todas las muestras. Para Cali, los phyla más abundantes fueron Proteobacteria (57%) y Firmicutes (42%). En general, para C. livia las familias más abundantes fueron Enterobacteriaceae (51,6%), Enterococcaceae (14,9%) y Clostridiaceae (6,3%), mientras que para C. atratus y G. fulvus fueron Fusobacteriaceae (4,2%), Micrococcaeae (4,1%), Peptostreptococcaceae (11,7%) y Moraxellaceae (3,1%). En las muestras de Cali se detectó la presencia de microorganismos con potencial patogénico pertenecientes a los géneros Streptococcus, Campylobacter, Chlamydia y Atopobium en C. livia y Clostridium, Klebsiella, Helicobacter y Fusobacterium en C. atratus. Las muestras de C. livia y C. atratus de Cali difirieron parcialmente en su composición con las muestras de los demás países, posiblemente por la ubicación geográfica, dieta u otros factores. Existen diferencias en la composición taxonómica de especies que comparten una ubicación, pero también entre organismos de una misma especie o nicho que habitan lugares distintos.
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Desinfección de E-coli K12 en una matriz de agua subterránea vía foto-fenton
    (Universidad del Valle, 2015) Alvear Daza, Jhon Jairo; Sanabria Gómez, Irma Janeth; Gutiérrez, Héctor Mario; Rengifo Herrera, Julián Andrés
    El agua subterránea constituye la fuente más grande de agua dulce disponible (aproximadamente el 96%), proporciona entre el 25 y 40% del agua potable en el mundo. El agua subterránea posee una buena calidad natural, generalmente libre de patógenos, color y turbiedad (National Academy of Sciences 2008). Un riesgo para los acuíferos libres superficiales es la inadecuada disposición de Excretas en sectores rurales, conllevando a la contaminación microbiológica. La desinfección con cloro es el tratamiento más usado para las aguas, sin embargo esta forma de desinfección representa riesgo para la salud humana debido a la generación de subproductos tóxicos cancerígenos denominados DBPS, (Desinfection by-products), como alternativa de control a estos riesgos se evalúan otros métodos de desinfección, siendo los más estudiados los procesos avanzados de oxidación - PAOX. El presente estudio propone la desinfección en agua subterránea a través del tratamiento foto-Fenton a pH neutro, usando hierro naturalmente presente en el agua subterránea. Se evaluó la influencia de los factores de la composición química del agua, en la desinfección vía foto-Fenton usando como indicador el microorganismo E. coli K12, adicionando a una muestra natural proveniente del corregimiento El Tiple. Para determinar la efectividad del proceso de desinfección en aguas subterráneas, se usó recuento directo de bacterias viables con el método de hibridación in-situ con sondas fluorescentes (FISH) combinado con el método de elongación celular en presencia de antibiótico. Los factores químicos evaluados fueron: (i) la interferencia de los iones presentes en la fuente de agua (HCO3-, Cl-, F-, SO4=, Mn+2, NO3-, PO4-3), así como (ii) las concentración adecuada de H2O2, Fe+3 e hipoclorito de calcio. Se determinó que la cinética de desinfección, la constante cinética k es igual a -7,56x10-5 min-1 y el tiempo de vida media de la desinfección durante el tratamiento es igual a 135 min. El tratamiento de cloración en agua subterránea mostró un tiempo medio de desinfección de 52,45 min, mostrando que requiere un menor tiempo de contacto para lograr la desinfección comparada con el tratamiento foto-Fenton a pH neutro. Palabras Clave: foto-Fenton, agua subterránea, inactivación microbiológica, E.coli K12, pH neutro, DVC-FISH, viabilidad celular, iones, energía solar.
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Enriquecimiento de bacterias psicrófilas fijadoras de nitrógeno en reactores biológicos secuenciales (SBR)
    (Universidad del Valle, 2019) Ramos Gómez, María Camila; Sanabria, Janeth
    El presente trabajo tiene como finalidad de estudiar la fijación biológica de nitrógeno asimbiótica a bajas temperaturas, adaptando consorcios microbianos fijadores de nitrógeno a temperaturas entre 8ºC y 12ºC, haciendo uso de reactores SBR, teniendo en cuenta los bajos costos de las muestras y la adaptación de los inóculos a las temperaturas mencionadas. Se espera la existencia de bacterias fijadoras de nitrógeno en el lodo de lSTAR de la industria papelera y en el suelo de clima frío escogidos.Las condiciones en las que se encuentran los microorganismos provenientes de un lodo de PTAR supone su resistencia a ambientes extremos y la sobrevivencia en presencia de distintos compuestos. Adicionalmente se pretende generar una alternativa de selección de biofertilizante para climas fríos colombianos que funcione como estrategia para disminuir el uso de fertilizantes químicos nitrogenados.
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Estudio de la capacidad de biofijación de CO2 de una laguna algal de alta tasa en condiciones del trópico
    (2014-10-23) Cerón Hernández, Víctor Alfonso
    Se denominan sistemas de algal de alta tasa por la mejora en el rendimiento o productividad en la biomasa y en la capacidad de tratamiento de aguas residuales. En este, la fotosíntesis es un proceso fundamental, en donde las algas verdes y cianobacterias reducen el CO2 a expensas del agua con la energía solar capturada por los pigmentos clorofílicos. Con base a estos conceptos se diseñó y construyó un sistema algal de alta tasa que recibía una carga volumétrica de 6.5 gr m-3.d-1 y un caudal promedio de 0,1 m3d-1 provenientes de un acople tecnológico (Laguna anaerobia de alta tasa + Humedal de Flujo Sub-superficial) para el tratamiento de lixiviado de relleno sanitario. En este sistema se monitoreo variables fisicoquímicas como pH, Oxígeno Disuelto (OD), Conductividad Eléctrica (CE) y Potencial de Oxido-reducción (PotRedox) empleando una sonda multiparametrica WTW Modelo 340i. La Clorofila a se determinó empelando un Fluorometro AquaFluorTMTuner y de estableció la productividad en biomasa. Así mismo, semanalmente se determinó COD (Carbono Orgánico Disuelto), Alcalinidad, Fosfatos (PO4-P), DQO total y filtrada (Demanda Química de Oxigeno), NTK (Nitrógeno Total Kjeldahl), N-NH4 (Nitrógeno Amoniacal), N-NO3 (Nitratos) y Cromo IV (Cr+6) durante el periodo de Enero-Julio de 2013. El potencial de Fijación de CO2 de las algas se determinó mediante balances de masa. Por otro lado, se determinó hasta la taxa más específica posible las células algales establecidas, empleando técnicas de microscopia clásica (Taxonomía) y métodos moleculares (DGGE y Secuenciación). Para el análisis de los datos recolectados durante el periodo de muestreo se empleó un test de Friedman y el Test de Wilcoxon, para analizar los Flux de gas y las concentraciones de entrada y salida del Cromo VI. Según el análisis de las variables físicas, el sistema se comportó como un sistema aerobio, presentando todas las condiciones para que se genera un fotooxidación de los compuestos orgánicos e inorgánicos, alcanzando concentraciones de oxígeno disuelto superiores a 20 mgL-1, niveles de pH superiores a 8 y potenciales redox superiores a 300 mV. Estas condiciones, permitieron un crecimiento algal similar a lo reportado por otros sistemas. Alcanzando una productividad de 7.2 g.m-2.día-1 de biomasa algal, valor que puede considerarse alto considerando que la unidad estaba tratando lixiviado de relleno sanitario. Por otro lado el sistema alga de alta tasa, presentó una buena eliminación de NTK filtrado, N-NH4 Filtrada y Nitratos con 38.4 %, 36.7 % y 25 % en carga aplicada, respectivamente. El ortofosfato (P-PO4-2) por su parte, presentó una eliminación del 8,2 % siendo alta según los reportes para esta clase de sistemas. En términos de materia orgánica el bioreactor obtuvo una eficiencia de eliminación de 71 % en DBO5 y 31.5 % de DOQ filtrada. La cantidad de carbono fijado por la las algas a través de la Fotosíntesis en el reactor durante el tiempo de la experimentación, fue de 26.1 g de C d-1 y -18.1 g de C. d-1.m-2, valores similar a lo reportado por en otros estudios. Mediante el Test de Friedman se encontraron diferencias significativas en las variables como materia orgánica (COD, DQOF) y nitrógenos (NTK, NTKF, N-NH4, N-NO3) dado que el valor-p es menor que 0.05, siendo la entrada la que más diferencias tenía con respecto a los demás puntos de muestreo, comprobando así que el sistema algal de alta tasa realizó una transformación de los contaminantes. Así mimo, se encontraron diferencias significativas (p-valor < 0.05) en los flux diurnos y nocturnos, demostrando estadísticamente que el sistema tiene dos comportamientos en términos del CO2, el cual depende de la luz solar. Respecto al Cromo hexavalente, la laguna alcanzó una eliminación superior al 80 % y diferencias significativas (p-valor < 0.05) en las concentraciones de este metal en la entrada y salida del sistema. Al presentarse una mayor concentración a la entrada del sistema. Esta eliminación o retención del Cromo hexavalente, se pudo haber presentado por procesos mediados por la actividad fotosintética y microorganismos presentes mediante adsorción física, intercambio de iones y quimiosorción, precipitación química, reacciones redox o cristalización en la superficie celular, entre otros mecanismos. En lo relacionado a la identificación de organismos algales y bacterias del sistema, se encontraron 16 especies algales diferentes, de estos 10 pertenecen a la Clase Chlorophyceae, dos a la Chlamydophyceae y dos a la Cryptophyceae. De estas especies, se encontró que para Chilomonas insignis y Chroomonas coeruelea no existen reportes científicos de la presencia de estos organismos en este tipo de unidades tratando aguas residuales. Por otro lado, se determinó la presencia de bacterias pertenecientes a consorcios de oxidadoras de Nitritos y Amonio, quienes guardan una posible relación comensalista con los grupos algales en el sistema. En conclusión a pesar de que se trató de un residuo muy complejo y heterogéneo como lo es el lixiviado de relleno sanitario, el sistema algal de alta tasa operó durante el periodo del estudio sin grandes inconvenientes, presentado unas adecuadas eficiencias de eliminación de contaminantes (materia orgánica, nutrientes, Cr VI) y aportando grandes beneficios con la bio-fijación de CO2.
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Goma de mascar con efecto anticaries.
    (2011-10-14) Daza, Edward Geovanny; Benavides, Oscar Fernando
    Con el propósito de impulsar una nueva línea de investigación y de comprobar el efecto anticariogenénico de un producto natural con poder antimicrobiano comprobado, se desarrolló un estudio piloto cuasi experimental en jóvenes de 18 25 años matriculados en los tres últimos semestres del Programa de Odontología de la Universidad del Valle a un subgrupo de los cuales se les suministró el producto incorporado a una gomas de mascar comercial. El estudio fue aprobado por el Comité de Ética en Humanos de la Facultad de Salud de la Universidad del Valle que lo catalogó como ®sin riesgo» de acuerdo a la resolución 8430 de 1.993 emitida por el Ministerio de Salud de Colombia. En el grupo experimental los resultados del estudio mostraron una reducción significativa en el contenido de Streptococo Mutans en la saliva recolectada después del uso de goma de mascar comercial adicionada con propoleo. El estrptococo Mutans es la bacteria que genera el mayor riesgo de desarrollar caries dental Se considera necesario realizar un estudio similar que involucre grupos mayores de población con el fin de validar el resultado obtenido.
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Identificación de bacterias periodontopáticas en cepillos dentales.
    (2018-04-25) García, Lina María; Jaramillo, Adriana; Aragón, Natalia
    La biopelícula dental es uno de los factores etiológicos de la caries dental y la enfermedad periodontal, que constituyen la causa de cerca del 95% de las pérdidas dentales. Por esta razón, uno de los principales métodos de prevención es la remoción mecánica de la biopelícula por medios mecánicos como el cepillado dental. La translocación de los microorganismos periodontopaticos puede ocurrir y re-infectar sitios que han sido tratados previamente, siendo el cepillo dental uno de los reservorios que propicia la translocación, así como la transmisión de entre individuos por contacto indirecto a través de este elemento de higiene oral. Se ha demostrado que los microorganismos periodontopáticos y superinfectantes pueden mantenerse viables en cepillos dentales de pacientes con periodontitis. No obstante, dado el reciente desarrollo de los cepillos con antibacteriales en sus cerdas, no existe suficiente evidencia para determinar si existen diferencias significativas en la contaminación de cepillos dentales convencionales y aquellos con antibacterianos. Por lo tanto, este estudio presende determinar el nivel de contaminación por bacterias periodontopatógenas en dos tipos de cepillos dentales, con y sin antibacteriano en sus cerdas.
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Inoculación con microorganismos rizosféricos para restauración de bosque seco tropical: metabarcoding y diversidad
    (Universidad del Valle, 2022) Castillo Bautista, Mónica Patricia; Armbrecht, Inge; Rugeles Silva, Paula Andrea
    El bosque seco tropical (Bs-T) del valle geográfico de río Cauca está reducido a unos pocos relictos rodeados por pastos y cultivos. Los pastos introducidos para forraje ganadero tienen características que afectan las funciones del ecosistema, incluidos los microorganismos. En un proceso de restauración se deben tener en cuenta también los microorganismos del suelo, que a su vez pueden servir como indicadores de la calidad del suelo. Dentro de los microorganismos se encuentran unos catalogados como promotores de crecimiento vegetal. La inoculación de la rizosfera de las plantas con microorganismos puede mejorar el crecimiento y supervivencia de las plantas, técnica que ha sido mayormente estudiada en el mejoramiento de cultivos, más poco se sabe en procesos de restauración de bosque seco de la región. En este estudio se evaluó el efecto de la inoculación con microorganismos rizosféricos de Bs-T sobre el crecimiento de plantas jóvenes de Inga densiflora, y sobre la diversidad de bacterias y hongos promotores del crecimiento asociados en la rizósfera, en el marco de un proceso de restauración ecológica para una zona invadida por pasto guinea, Panicum máximum, y usando la herramienta de metabarcoding, en la evaluación de la diversidad de bacterias y hongos. Después de cinco meses, se encontró mayor diversidad de microorganismos en los suelos de las plantas inoculadas, pero no un efecto estadístico en el crecimiento de éstas. La evidencia sugiere que la inoculación con microorganismos directamente de bosque favorece la diversidad de bacterias y posiblemente de hongos, por lo cual debería ser más estudiada y tenida en cuenta en procesos de restauración ecológica.