Biología

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Efecto de variables biológicas en perfiles de aminoácidos y acilcarnitinas de neonatos sanos de Cali

Arévalo Ramirez, Myriam | 2017

Los Errores Innatos del Metabolismo (EIM) son enfermedades de origen genético consideradas como raras debido a su baja prevalencia (<1:5000 recién nacidos vivos). El uso del espectrómetro de masas en tándem (MS/MS) para diagnosticar estas enfermedades es común en países desarrollados. Se ha reportado que las concentraciones de algunos marcadores bioquímicos de estas alteraciones, como aminoácidos y acilcarnitinas, varían con cada individuo debido a factores biológicos. Estas variaciones afectan el diagnóstico de algunos EIM con valores de referencia de marcadores cercanos al punto de corte de diagnóstico. Por lo anterior, el presente estudio tuvo como objetivo principal establecer la correlación de los factores de peso, talla, edad y sexo con los perfiles de aminoácidos y acilcarnitinas en 392 neonatos de la población de Cali. Se analizaron mediante pruebas estadísticas las concentraciones de ocho aminoácidos y 16 acilcarnitinas determinadas por MS/MS, calculándose el coeficiente de correlación de Pearson

Efecto de la minociclina en la expresión de metaloproteasa-9 en ratas con trauma craneoencefálico difuso

González Duque, Diana Marcela | 2018

El Trauma Craneoencefálico (TCE) representa un reto epidemiológico a nivel mundial debido a la elevada tasa de comorbilidades relacionadas con las lesiones a las que conduce. El papel que juegan las metaloproteasas (MMP) en la remodelación de la matriz extracelular es ampliamente conocido, pero hay poca información de su participación en el TCE. Una de las MMP que actua en el proceso de remodelación de la matriz extracelular es la MMP9, la cual se expresa en las diferentes fases del desarrollo del tejido cerebral en humanos, siendo fundamental en los procesos de aprendizaje dependientes del hipocampo. Además, se ha reportado en biomodelos murinos con TCE contuso en la fase aguda, la MMP9 se sobre-expresa y aumenta su actividad, lo cual podría ocasionar daños en el tejido cerebral post TCE. Por lo tanto, MMP9 podría ser un posible blanco farmacológico. En la presente investigación se evaluó la expresión de los ARN mensajeros del MMP9 en el hipocampo de ratas Wistar con TCE difuso de intensidad moderada tratadas con minociclina, en la fase subaguda y crónica de la lesión. En la cuantificación relativa de MMP9 se obtuvo que la expresión del gen disminuyo a los 7 y 14 días con respecto al grupo control, sin embargo, a los 30 días post trauma el efecto fue nulo. Estos resultados sugieren que el fármaco minociclina reduce la expresión expresión de MMP9 en la fase subaguda, lo cual podría ayudara reducirla inflamación y disminuir el daño en el tejido cerebral post TCE

Dinámica gremial de hormigas de suelo y hojarasca en un paisaje restaurado en Filandia – Quindío

Jimenez Carmona, Elizabeth | 2018

En el mundo existe un creciente interés en la restauración de los ecosistemas y la mitigación de daños ocasionados al ambiente, reconociendo que las perturbaciones disminuyen la diversidad, la estructura y la función que alteran, de esta manera, las dinámicas naturales. Uno de los aspectos más importantes al desarrollar un plan de restauración, es tener en cuenta cómo se monitorear a el avance de éste, tanto en la estructura y la función que hipotéticamente debería de alcanzar el sitio objetivo. Trabajar con agrupaciones de especies como los gremios, es una forma de lograrlo, ya que no se cae en las imprecisiones derivadas de trabajar con una sola especie indicadora y a través de estos se puede inferir la recuperación de las funciones. En este estudio se determinaron los gremios presentes en un ecosistema en proceso de restauración (i.e.: reforestados a partir de plantaciones forestales y de pastizales) con base a la ecología y morfología de las especies. En total se identificaron siete gremios y a partir de estos se pudo determinar que el proceso de restauración presentó un avance ocho años después de iniciado. Los principales gremios indicadores fueron el 5 diferentes especialistas, entre predadoras especializadas, especialistas de hábitat y cultivadoras de hongos) y 3 (omnívoras, con poblaciones grandes, de reclutamiento masivo y poseen comportamiento dominante) para bosque y pastizal, respectivamente. Se concluye que los gremios son unidades ecológicas efectivas para monitorear procesos de restauración y que las proporciones entre gremios con especies especializadas en diferentes recursos y aquellos con especies omnívoras pueden indicar adecuadamente su avance.

Factores determinantes del movimiento de polinizadores entre las inflorescencias de una planta tropical

Murillo Garcia, Oscar Enrique | 2018

El comportamiento de forrajeo de los polinizadores es determinado por las características florales de las plantas, las cuales tienden a influenciar el comportamiento de los visitantes florales para mejorar la eficiencia de la polinización. Sin embargo, se conoce poco acerca del efecto de la distribución espacial de las plantas sobre los movimientos de los polinizadores y sus consecuentes tasas de visita floral; particularmente para los bosques tropicales. Por lo tanto, se evaluó la importancia relativa de la distribución espacial de la oferta floral, de las características florales y de factores ambientales sobre las tasas de visita de los polinizadores. Para lo cual se determinaron los movimientos de escarabajos del género Cyclocephala entre plantas de la especie Xanthosoma mafaffa (Araceae) en un bosque seco tropical.

Transformación del paisaje rural y relación del conflicto armado en la región del alto Naya (Valle-Cauca)

Armbrecht de Peñaranda, Inge | 2019

El presente estudio pretende describir algunos factores relacionadas con el conflicto armado que pudieron influir en las transformaciones ambientales en la región de El Naya, que comprende una parte limítrofe entre el norte del departamento Cauca y sur del departamento del Valle del Cauca. Para este fin se realizaron comparaciones en los mapas de Bosque/No-Bosque de la base de datos del Sistema de Información Ambiental de Colombia (SIAC); además de información sociológica de fuentes de tipo periodística, institucional, investigativa y de primera mano de las comunidades de la región y de excombatientes de las FARC-EP. Se obtuvieron datos sobre presencia y control territorial, intensidad del conflicto, actividades agrícolas y de cultivos, y normatividad ambiental propia del territorio. El análisis de los resultados permitió asociar algunas transformaciones ambientales con ciertas dinámicas poco estudiadas del conflicto y sus particularidades en la región. Se encontró una coincidencia entre la presencia de las FARC-EP en la región y la disminución de la pérdida de bosque, cuando ejerció control territorial total, a diferencia de cuando existieron confluencias y confrontaciones con otros grupos armados. De igual manera se evidenciaron condiciones que facilitaron la siembra de cultivos de uso ilícito, encontrando una relación entre la intensificación de estos y la pérdida de bosque. Este trabajo provee insumos para afrontar la etapa de terminación de la confrontación armada en la región del Alto Naya.

Aspectos biológicos de bagre pinnimaculatus y bagre panamensis provenientes de los desembarcos artesanales de la bahía de Buenaventura

Tavera Vargas, Jose Julián | 2019

Se estudiaron aspectos del crecimiento y estructura poblacional de las especies de Bagre pinnimaculatus y Bagre panamensis (Siluriformes: Ariidae) durante el periodo comprendido entre el mes de junio y noviembre de 2018, provenientes de los desembarcos pesqueros artesanales en la Bahia de Buenaventura. Se obtuvieron muestras de 204 individuos por especie. La especie Bagre pinnimaculatus (alguacil) presentó un crecimiento alométrico con un rango de tallas comprendido entre 33,1 y 86,7 cm de longitud total, encontrando dominancia del intervalo 76-80 cm representado en el 28% del total de capturas. Para el Bagre panamensis (barbinche) su crecimiento fue alométrico y los rangos de talla estuvieron comprendidos entre 28,6 y 46,1 cm de longitud, encontrando dominancia del intervalo de 31- 35 cm en el 38% del total de las capturas.

Diversidad y redundancia funcional del ensamblaje de peces de los arrecifes coralinos de la isla Gorgona

Zapata Rivera, Fernando Alberto | 2019

Comprender las características de los ensamblajes considerando los papeles funcionales de sus especies es importante para estimar la resiliencia y estabilidad de los ecosistemas. En este estudio, se evaluó la diversidad y la redundancia funcional del ensamblaje de peces de tres arrecifes coralinos de Isla Gorgona, Pacífico Oriental Tropical. Con base en 120 censos visuales y seis rasgos de la historia de vida de las especies de peces,.este análisis reveló que el acervo local de especies ocupa un 83% del espacio funcional ocupado por el acervo de especies regional (Pacífico Oriental Tropical), indicando que la comunidad de peces de la isla desempeña un amplio rango de funciones ecológicas. El ensamblaje presentó un alto grado de diferenciación de nicho de las especies dominantes (Divergencia Funcional alta) y una distribución desigual de las funciones desempeñadas (Equidad Funcional baja). El índice de Redundancia Funcional R fue de 0,591 reflejando cierta vulnerabilidad funcional para las especies de peces depredadoras y de gran tamaño. Los resultados sugieren que, a pesar de la alta complementariedad de nicho en la comunidad de peces, las funciones no están homogéneamente representadas y, por lo tanto, algunas partes del nicho están siendo subutilizadas haciéndolas funcionalmente vulnerables. Por último, este estudio pone en consideración la importancia de involucrar los rasgos funcionales en los planes de monitoreo y manejo de los arrecifes coralinos.

Relación entre el éxito reproductivo y la concentración del néctar floral en Rodriguezia Granadensis (Orchidaceae)

Torres González, Alba Marina | 2019

Rodriguezia granadensis (Lindl.) Rchb.f. es una orquídea xenógama obligada polinizada por abejas euglosinas, la cual presenta un fenómeno de recompensa difusa. Para evaluar cómo influye la concentración del néctar en el éxito reproductivo de R. granadensis se seleccionó una población de flores en un bosque ripario subandino, se fijaron tres puntos y se suplementaron las flores en diferentes concentraciones de néctar (50%, 40% y 0%) desde Julio hasta Septiembre de 2018. Se cuantifico el número de visitas efectivas, y se hizo monitoreo semanal en cada uno de los puntos del bosque. Aunque altas concentraciones de néctar aumentaron el número de visitas efectivas masculinas, no hubo diferencias estadísticas significativas entre los tratamientos. Las visitas efectivas femeninas sólo se registraron para el tratamiento con concentración de néctar al 50%. Este resultado refleja el comportamiento de los polinizadores de orquídeas que tienden a permanecer en los parches gratificantes. El bajo éxito reproductivo femenino y masculino evidenciado en los tratamientos podría ser explicado por el robo de néctar. Durante las horas de monitoreo fueron observados visitantes de la familia Hesperiidae y a Pseudohaetera hypaesia, robando néctar sin producir daño a las flores. Este es el primer registro de robo de néctar en R. granadensis. Aún no es posible afirmar que altas concentraciones de néctar aumentan el éxito reproductivo en R. granadensis, se necesitan más estudios que controlen variables como el robo de néctar, además que reúnan varios periodos de floración, otras localidades y más horas de observación por estación, para una confirmación sólida.

Caracterización genética de A. Cephalotes para la isla Gorgona en el contexto del Pacífico oriental tropical

Sedano Cruz, Raul Ernesto | 2019

La variabilidad genética de Atta cephalotes en la Isla Gorgona y en general en el Pacífico colombiano ha sido poco estudiada, comparada con otras áreas de centro y sur América. En este estudio se caracterizó la variación genética de las hormigas cortadoras de hojas en la Isla Gorgona para ser estudiadas en el contexto del Pacífico Oriental Tropical. Se realizó la secuenciación de 414 pares de bases de la subunidad I del gen mitocondrial Citocromo Oxidasa. Con un análisis de varianza molecular se describió el patrón de estructura genética para una muestra de 33 individuos que se adjuntaron a 389 secuencias reportadas en la literatura.

Evaluación de la capacidad de biodegradación de diésel y de factores de virulencia en dos cepas bacterianas hidrocarburoclásticas

Benitez Campo, Neyla | 2019

El uso de bacterias degradadoras de petróleo, conocidas como hidrocarburoclásticas, ha venido en aumento, sin embargo, no basta con una alta capacidad biodegradativa, sino que adicionalmente posean baja patogenicidad para ser utilizadas en procesos de biorremediación. Con el propósito de evaluar la capacidad de biodegradación de diésel y algunos factores de virulencia presentes en cepas autóctonas de Acinetobacter sp. DC-84 y P. eruginosa DC-95, se determinó la tolerancia al diésel por concentración mínima inhibitoria (CMI), posteriormente se evaluó el porcentaje de degradación de fracciones de n-alcanos C15-C20 y C22, al cabo de 21 días, con inóculos individuales y en cultivo mixto, mediante bioensayos en medio mínimo de sales (MMS) al 5% de diésel, usando cromatografía de gases acoplada a espectrofotometría de masas (GC-MS). Como factores de virulencia se evaluó la movilidad swarming, swimming y twiching, biopelículas, esporas, cápsula y producción de piocianina. Acinetobacter sp., degradó el 100% de las fracciones de n-alcanos C16, C18-C20, y el 60, 74 y 24% para C15, C17 y C22 respectivamente. Contrariamente, P. aeruginosa incrementó las fracciones de C16-C20, C15 y C22 en un 9, 40 y 80% respectivamente.

Heredabilidad en Capsicum (Solanaceae) usando parentesco estimado con marcadores moleculares

Cárdenas Henao, Heiber | 2019

Con el objetivo de determinar la heredabilidad de rasgos vegetativos y de interés comercial en tres variedades comerciales de ají empleando marcadores moleculares microsatélites, se evaluaron los rasgos y se realizó la genotipificación de los individuos por medio de curvas de disociación de alta resolución (HRM). La heredabilidad para cada rasgo en cada variedad comercial se estimó a partir de una matriz de relaciones de parentesco, obtenida empleando el método Triadic IBD y una matriz de similitud fenotípica. Los rasgos evaluados presentaron valores de heredabilidad cercanos a cero, indicando que presentan una fuerte influencia ambiental, y que no es recomendable realizar procesos de selección debido a la poca varianza aditiva con respecto a la fenotípica. Sin embargo, se podrían emplear estas tres variedades comerciales en estudios de rendimiento genotipo-ambiente. Empleando la metodología propuesta se reducen los tiempos de ejecución de los estudios mejoramiento y se posibilita la investigación de parámetros genéticos en poblaciones con parentesco desconocido.

Relación entre riqueza de especies y la diversidad funcional en ensamblajes de anuros

Murillo Garcia, Oscar Enrique | 2019

La riqueza de especies es un atributo importante, pero no está relacionada con las funciones de las especies en los ecosistemas. Por otro lado, la diversidad funcional permite cuantificar el papel de los ensamblajes sobre los procesos de los ecosistemas. Sin embargo, existe mucha controversia sobre la relación entre la riqueza de especies y la diversidad funcional. Los anuros son un grupo biológico ideal para estudiar esta relación pues sus ensamblajes son localmente diversos y presentan mucha variación en las características morfológicas y ecológicas. En este estudio se evaluó la relación entre diversidad funcional y riqueza de especies, para lo cual se recopiló información sobre la composición de especies y los rasgos funcionales de anuros de diferentes localidades de Colombia. Se cuantificó la riqueza funcional de los ensamblajes, la cual se corrigió por medio del tamaño de efecto estandarizado con el fin de evitar su dependencia con respecto al número de especies.

Caracterización molecular de las variantes del virus Epstein-Barr detectadas en cavidad oral de adolescentes colombianos

Castillo Giraldo, Andrés Orlando | 2019

El virus de Epstein-Barr (VEB) es un virus ubicuo y oncogénico, asociado con el desarrollo de enfermedades como la mononucleosis infecciosa, el linfoma de Burkitt, el carcinoma nasofaríngeo y otras neoplasias. Actualmente, se reconocen dos subtipos: VEB-1 y VEB- 2, distinguidos según las diferencias genéticas de sus antígenos nucleares EBNA. Así mismo, debido al alto grado de heterogeneidad y variabilidad encontrado en la proteína LMP1 del virus, se han descrito variantes asociadas a patogenias o a regiones geográficas específicas. Con el objetivo de identificar y caracterizar molecularmente las variantes del VEB detectadas en la cavidad oral de 100 adolescentes de la ciudad de Cali, Colombia, se realizó la amplificación por PCR convencional del gen EBNA3C para tipificar el virus y la amplificación, , purificación y secuenciación del dominio C-Ter de la proteína LMP1 para identificar variantes; se realizó un análisis filogenético y de mutaciones de las secuencias obtenidas comparándolas con variantes patogénicas o geográficas reportadas en GenBank-NCBI. El subtipo viral predominante fue el VEB-1(78 %); además, un 72,6% de aislados agruparon con la variante patogénica Raji, derivada de linfocitos B de un paciente con Linfoma de Burkitt, 13,7% se relacionó con variante de origen geográfico Mediterráneo y otro 13,7% no agrupó con ninguna de las variantes de referencia. Esta es la primera vez que se identifican variantes de LMP1-VEB en Colombia, por lo que estudios adicionales serán necesarios para caracterizar la variante sin identificar, y reconocer si es patogénica o es un aislado geográfico propio, presente en Cali.

Caracterización de tres endosimbiontes de la mosca blanca: Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae) de Colombia

Montoya Lerma, James | 2016

Muchas especies de insectos albergan bacterias simbiontes intracelulares y su interacción puede ser parásita, neutral o mutualista. A este último tipo parece pertenecer la asociación de la mosca blanca, B. tabaci y sus endosimbiontes, quienes le proporcionan nutrientes esenciales y facultan con características como tolerancia a altas temperaturas. En este estudio se identificoó la presencia de los endosimbiontes de B. tabaci: Portiera, Hamiltonella y Rickettsia en poblaciones provenientes de diferentes regiones de Colombia. Se encontró que la co-infección por los tres endosimbiontes fue más común que la infección por un solo endosimbionte, para la cual el endosimbionte m´as frecuente fue Hamiltonella, per o este no se presentó en todas las localidades. Por su parte Portiera no fue el más frecuente pero se encontró en todas las localidades con una ocurrencia del 100% seguido por Hamiltonella (92%) y Rickettsia (88%). No se observó asociación de alguno de los endosimbiontes o combinaciones de estos con la región, localidad o cultivo de procedencia de su hospedero. Al observar los análisis filogenéticos en base al gen 16S rRNA se obtuvo que las secuencias de Rickettsia fueron todas idénticas, mientras que en Hamiltonella y Portiera se observaron diferencias para la secuencia de Natagaima para ambos endosimbiontes y la de Mariquita para Portiera, aunque en general son muy similares independientemente de la región.

Ensamble de algas bentónicas en territorios de Stegastes acapulcoensis (Pomacentridae) en la Isla Gorgona, Pacífico colombiano

Gavio, Brigitte | 2016

Los peces damisela del género Stegastes, abundantes en el Pacífico Oriental Tropical (POT), protegen "jardines de algas" de los cuales se alimentan y que presentan una mayor diversidad de flora que sus alrededores. Este estudio describe por primera vez la composición de la comunidad de algas bentónicas en territorios de Stegastes acapulcoensis, y la compara entre un arrecife rocoso (El Laberinto) y uno coralino (La Azufrada) en Isla Gorgona, Pacífico colombiano. En total se registraron 74 taxa, superando el número de taxa registrado en estudios anteriores, especialmente por la diversidad de cianobacterias y algas epífitas flamentosas. Dos especies fueron nuevos registros para la Isla Gorgona, 27 lo fueron para el Pacífico colombiano y 12 para el POT, aumentando la diversidad de algas conocida de la isla en un 38% y del Pacífico colombiano en un 3 0%.

Bivalvos endolíticos y bioerosión en acantilados terciarios en dos bahías de la costa pacífica colombiana

Cantera Kintz, Jaime Ricardo | 2016

Los bivalvos endolíticos contribuyen en la erosión de acantilados rocosos, generando progresivamente el retroceso de la línea costera. Esto los convierte en importantes modificadores de las geoformas litorales, que afectan las dinámicas poblacionales de muchas especies que dependen del intermareal rocoso. En este trabajo se caracterizó la abundancia, diversidad y distribución de bivalvos endolíticos en acantilados con baja, mediana y alta exposición al oleaje en Bahía Málaga y Buenaventura.

Distribución conocida y potencial de los ácaros depredadores de la familia Phytoseiidae (Acari: Mesostigmata) en la yuca Manihot esculenta (Euphorbiaceae)

Montoya Lerma, James | 2016

Los ácaros fitoseidos se han destacado como buenos ejemplos de control biológico en los cultivos de yuca (Manihot esculenta), es especial contra los ácaros fitófagos. Este trabajo busca mostrar la distribución conocida y potencial de estas cinco especies (Amblydromalus manihoti, Galendromus annectens, G.floridanus, Neoseiulus anonymus y Typhlodromalus aripo), basadas en la máxima entropía, con el uso de Maxent. Estos datos fueron adquiridos del museo CIAT Arthropod Reference Colletion (CIATARC) y datos de literatura. En total se digitalizaron 2.245 registros de 57 especies de fitoseidos, principalmente de Suramérica y Centroamérica. Posteriormente se utilizó WorldClim para las variables bioclimáticas de cada especie. Se depuraron los datos para corregir sesgo de muestreo y luego se procesaron basados en la distribución geográfica Neotropical conocida, para finalmentne ser proyectada en la zona ecuatorial mundial, la cual presenta los mayores riesgos de invasión por plagas.

Divergencia de caracteres e historia natural de especies de Bangsia (Thraupidae) endémica de Colombia

Guerrero Londoño, Gustavo Adolfo | 2017

La evaluación de la divergencia de caracteres entre poblaciones de especies amenazadas es importante para la conservación. Bangsia aureocincta y Bangsia melanochlamys tienen distribuciones restringidas en los Andes del Norte donde se superponen en una pequeña área. No hay información sobre variación de rasgos entre las poblaciones simpátricas y alopátricas. El objetivo de este estudio fue determinar si existe divergencia en caracteres morfológicos o comportamentales entre poblaciones simpátricas y alopátricas de estas dos especies, exploramos tres hipótesis: Separación de nichos, Divergencia de caracteres y Exclusión competitiva.

Análisis bioinformático de secuencias no codificantes en metagenomas : una revisión actualizada

Moreno Tobar, Pedro Antonio | 2017

La metagenómica se apoya en la bioinformática para describir y clasificar un sin número de microorganismos. Muchos de los enfoques en esta área, centran su atención en las características funcionales derivadas de secuencias codificantes, descartando las secuencias no codificantes (NCS), aun conociendo su participación en la maquinaria regulatoria de los genes. Recientemente, un estudio desarrollado en la Universidad del Valle utiliza las NCS para caracterizar metagenomas y desarrollar un marco de trabajo bioinformático para el estudio de los microorganismos asociados a medioambientes.

Producción primaria fitoplantónica en tres esteros de Bahía Málaga y Buenaventura, Pacífico oriental colombiano

Peña Salamanca, Enrique Javier | 2017

Se evaluaron las variaciones espaciales y temporales de la producción primaria fitoplanctónica neta en tres esteros en la bahía de Málaga y Buenaventura, Pacífico Oriental Tropical Colombiano, utilizando el método de botellas claras y oscuras, en julio y noviembre de 2015 y abril de 2016. Se realizaron tres monitoreos en los esteros principales de cada localidad, registrando la temperatura, salinidad, clorofila-a profundidad y transparencia del agua en tres puntos de la marea.