Escuela de Bacteriología y Laboratorio Clínico
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Examinando Escuela de Bacteriología y Laboratorio Clínico por Autor "García Vallejo, Jesús Felipe"
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Publicación Acceso abierto "Construcción de un modelo sistémico del proceso de integración lentiviral".(2018-08-23) García Vallejo, Jesús Felipe; Sánchez, Adalberto; Domínguez, Martha Cecilia; Salcedo Cifuentes, Mercedes; Montoya, Julio CésarLa integración de los lentivirus en el genoma humano es uno de los procesos más complejos en el estudio de la dinámica estructural y funcional del virus durante la progresión de la enfermedad. Uno de los principales problemas en el estudio de la integración es la existencia de muchos sitios calientes (“hotspot”), de preferencia viral y la razón por la que el virus prefiere estas zonas es aún desconocida. La evidencia actual muestra que la integración de cADN lentivirus no es al azar, ya que algunas condiciones topológicas de la cromatina interfásica son importantes para determinar el "nicho" genómico para integrarse.Publicación Acceso abierto "Dinámica y significado de la integración simultánea de provirus del VIH-1 y del HTLV-I en linfocitos de sujetos doblemente infectados..".(2018-08-23) García Vallejo, Jesús Felipe; Domínguez, Martha C.; Salcedo Cifuentes, Mercedes; Flórez, Ofelia; Díaz, Diane; Soto, Juliana; Peña, Ángela VivianaEn este trabajo, por primera vez, a partir tanto de los datos de monointegración como de la simulación bioinformática de la cointegración VIH-1/HTLV-1 combinada y analizada en forma integral, se demostró la hipótesis de que una combinación específica de características de la cromatina para cada tipo de infección, facilitaría el proceso de integración simultánea de provirus VIH-1 y HTLV-I. En este contexto, caracterizamos el ambiente genómico para la integración de ambos retrovirus, como aquellas regiones del genoma hospedero donde la acción de diversas características de la cromatina interfásica asociada, remodelan de tal forma su estructura, que favorecerían la integración de los cADN virales, dependiente del tipo de retrovirus y de la interacción de ambos en procesos de cointegración. Los análisis de este estudio utilizaron modelos multivariados permitieron describir, en forma independiente en cada proceso integracional, el ambiente genómico y cromosómico preferido para su integración en el genoma humano. Un ambiente cromosómico en donde se obtuvieron los clúster de cromosomas con mayor número de integraciones y similares en la distribución de las características genómicas incluidas en el estudio y, un ambiente genómico en donde la colinealidad entre las variables juega un papel importante en la selección de aquellas regiones cromatínicas blanco de integración.
