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Publicación Acceso abierto Acción del tiametoxam y su potencial efecto en el ensamblaje de hormigas en un cultivo de maíz (ZEA MAYS L)(Universidad del Valle, 2024) Pereira Castañeda, Daniel Alberto; Montoya-Lerma, JamesExiste una creciente preocupación por la disminución de las poblaciones de insectos, un fenómeno que podría tener consecuencias devastadoras para los ecosistemas naturales y la seguridad alimentaria global. Una de las principales causas identificadas para este declive es el uso de insecticidas de amplio espectro, entre los cuales destacan los neonicotinoides. Estos insecticidas, como el tiametoxam, se utilizan de manera profiláctica para la protección de múltiples cultivos, especialmente como tratamiento de semillas en el cultivo de maíz. Sin embargo, su impacto sobre las comunidades de insectos benéficos, como las hormigas, importantes controladoras biológicas en cultivos tropicales, sigue siendo poco comprendido. Esta investigación doctoral tuvo como objetivo evaluar los efectos del uso profiláctico del tiametoxam en semillas de maíz sobre la mirmecofauna local, su actividad como agentes de control y las posibles consecuencias de la exposición sobre una especie no objetivo. En el primer capítulo, se evaluó el efecto del tiametoxam sobre la comunidad de hormigas y se investigó el posible impacto en su papel como controladoras biológicas mediante un experimento con presas centinelas utilizando larvas de Spodoptera frugiperda. No se encontraron diferencias significativas en la composición y abundancia de las comunidades de hormigas debido al tratamiento con tiametoxam; sin embargo, se observaron variaciones según el tiempo y la localidad. Se registraron diferencias significativas en el número de larvas de Spodoptera frugiperda depredadas (p = 0,003), siendo mayor en las parcelas no tratadas con tiametoxam. Según el análisis SIMPER, las especies de hormigas Ectatomma ruidum y Solenopsis geminata fueron las que más contribuyeron a las diferencias en la depredación de larvas de S. frugiperda entre parcelas tratadas y no tratadas. Entre las especies observadas depredando las larvas, E. ruidum y Odontomachus bauri se asociaron predominantemente con las parcelas sin tratamiento. En el segundo capítulo, se evaluaron los efectos del tiametoxam sobre el comportamiento y la supervivencia de colonias de la hormiga Ectatomma ruidum sp.2 mediante una exposición única a una solución azucarada con una concentración de 1,0 μg/mL de tiametoxam. Se encontraron diferencias en la proporción de obreras activas entre las colonias tratadas y no tratadas, observándose una mayor actividad en las colonias tratadas. Los movimientos involuntarios fueron casi exclusivos de las colonias tratadas. Finalmente, se encontraron diferencias significativas en la supervivencia de las colonias tratadas y no tratadas, tanto para larvas como para obreras, con una mortalidad total de los individuos expuestos en ambos casos. Los resultados de este estudio demuestran que el uso profiláctico de tiametoxam en semillas de maíz puede reducir la eficacia del control biológico de plagas proporcionado por las hormigas, como se evidencia en la menor depredación de larvas de S. frugiperda en parcelas tratadas. Además, la exposición de colonias de E. ruidum sp.2 al tiametoxam generó alteraciones significativas en el comportamiento y una mortalidad total de las larvas y obreras, sugiriendo efectos potencialmente perjudiciales para la mirmecofauna y su función ecológica en cultivos tropicales.Publicación Acceso abierto Actividad antioxidante y cuantificación de catecolaminas precursores de neurotransmisores en cascara de Musa Paradisiaca(Universidad de Valle, 2018) Cardona Rodríguez, Daissy Julieth; Isaza Martínez, José HipólitoLa cáscara de Musa paradisiaca tiene diversas aplicaciones en la medicina tradicional debido a su contenido de flavonoides, terpenos, fenoles, y catecolaminas. La investigación permitió la realización de extracciones usando agua, metanol, cloroformo y acetato de etilo; encontrando que en los extractos polares existe la presencia de compuestos de tipo fenil propanoides identificados por UV. Para el extracto clorofórmico se aisló un compuesto triterpénico cíclico del tipo Cicloabissinona o Cicloeuca-lenona. Se realizó la cuantificación de Dopa, Dopamina, Norepinefrina y Serotonina en extractos en medio ácido, básico y neutro para los estados de maduración verde, pintón y maduro por fluorescencia y HPLC; obteniéndose que el contenido de catecolaminas aumenta según lo hace el estado de maduración de la cáscara; el medio ácido arrojó mejores resultados. Los extractos con mayor actividad antioxidante según el estado de maduración y el medio de extracción corresponden a MppA con 4,54x10-4 ¿g/mL, MpvA 1,89 ¿g/mL y MpmA 5,12 ¿g/mL. Los extractos con mayor contenido de fenoles por Folin-Ciocalteu según el estado de maduración y medio de extracción corresponden a MpmA 1403,3 ¿Eq AG/gEH, MppA 169 ¿Eq AG/gEH y MpvA 92,7 ¿Eq AG/gEH.Publicación Acceso abierto Actividad biológica de complejos lantánidos con ligandos N,O-quelato derivados de bencimidazoles(Universidad del Valle, 2022) Aragón Muriel, Alberto; Polo Cerón, DorianLos bencimidazoles se consideran una clase prometedora de compuestos heterocíclicos bioactivos que muestran una amplia variedad de propiedades biológicas útiles debido a sus similitudes estructurales con bases nitrogenadas como las purinas. Cuando estos compuestos presentan grupos aminofenil como sustituyentes en el anillo imidazol, es posible obtener bases de Schiff que resultan adecuadas para mejorar en gran medida el efecto en su actividad biológica y farmacológica. Además de su importancia biológica, estos compuestos forman complejos estables con varios metales de transición, entre ellos, los lantánidos, que también han logrado demostrar un gran número de propiedades biológicas en diferentes estudios. Esta estabilidad aumenta cuando el ligando orgánico presenta más de un punto de coordinación al metal, lo cual es común en compuestos heterocíclicos con sistemas N,N-quelato, N,S-quelato o N,O-quelato. Con el interés de desarrollar nuevos complejos metálicos con potencial actividad biológica, y considerando la posible aplicación terapéutica de complejos lantánidos con ligandos N,Oquelato basados en 2-arilbencimidazoles, esta investigación describe la síntesis y caracterización de complejos lantánidos (La3+, Ce3+, Sm3+) que contienen ligandos tipo aminofenil-bencimidazol y bases de Schiff obtenidas a partir de salicilaldehído y 2,4- dihidroxibenzaldehído. La actividad antiproliferativa de los compuestos fue estudiada sobre células U251 (glioblastoma humano), PC-3 (cáncer de próstata), K562 (leucemia mielógena), HCT-15 (carcinoma colorrectal), MCF-7 (adenocarcinoma epitelial de mama) y células SKLU-1 (carcinoma de pulmón) empleando sulforodamina B (SRB) en un ensayo de microcultivo. La evaluación antibacteriana se realizó frente a las cepas ATCC de S. aureus, L. monocytogenes, P. aeruginosa y E. coli, por el método de microdilución, mientras que la actividad antiparasitaria se llevó a cabo por métodos fluorométricos y MTT frente a P. falciparum, L. braziliensis y T. cruzi. La actividad biológica fue complementada con estudios adicionales de interacción de los compuestos químicos con diferentes objetivos moleculares que incluyen modelos de membrana bacteriana, ADN de timo de ternera, docking molecular con los receptores PBP2A (S. aureus), Cruzaina, Leishmanina y Alfa-tubulina, así como la dinámica molecular para los sistemas de membrana DMPC-DMPG / POPE-POPG, y para la interacción con la superficie de Leishmanina. Los resultados muestran que los complejos lantánidos presentados en este trabajo son generalmente más activos con relación a sus ligandos libres, confirmando un efecto sinérgico, mientras que los estudios de interacción con diferentes objetivos moleculares indican que existe una clara relación estructura-actividad.Publicación Acceso abierto Actividad Catalítica de compuestos de Paladio (II) y Níquel (II) con ligando N-Heterocíclicos [recurso electrónico](2019-09-19) De La Vega Quintero, Gala Paulina; Galarza de Becerra, Esperanza (Director de Tesis o Trabajo de Grado); Cuenu Cabezas, Fernando (Director de Tesis o Trabajo de Grado)La química de coordinación representa un área muy estudiada de las ciencias naturales, sin embargo, la gran variedad de compuestos que pueden obtenerse hace que sigan siendo vigentes las diferentes investigaciones en este campo. Es por ello que en este trabajo se presentan los resultados de la investigación en química de coordinación de ligandos N-heterocíclicos derivados de B-dicetoiminatos, triazoles y bases de Schiff, con los metales de transición Níquel (II) y Paladio (II), adicional a esto se estudió la actividad catalítica de los compuestos de coordinación obtenidos en las reacciones de polimerización de etileno (con Ni) y el acople C-C Mizoroki-Heck (con Pd). Para los complejos de paladio se evaluó también su actividad antifúngica. Los resultados obtenidos demuestran la gran variabilidad de reacciones químicas que se pueden efectuar al comparar elementos que se encuentran en el mismo grupo de la tabla periódica, desde aspectos como la solubilidad hasta la forma de coordinación del ligando al metal, encontrándose en general en este trabajo, que los complejos de paladio son los más robustos, solubles y eficientes como catalizadores, llegando incluso a comportarse como catalizadores verdes ya que son activos en agua. La actividad biológica de algunos de los ligandos y complejos aquí obtenidos también fue estudiada, encontrando que, si bien la actividad biológica no es muy alta, debido entre otros aspectos a la solubilidad de los complejos, se pueden hacer observaciones interesantes respecto a la estructura de los compuestos y su actividad.Publicación Acceso abierto Actividad insecticida de extractos y antioxidante de derivados de ácido cafeico en Tithonia diversifolia, y actividad antibacteriana de los Regioisómeros sintéticos análogos de Achyrofurano en Achyrocline Satureoides(Universidad del Valle, 2018) Pantoja Pulido, Kriss Dayana; Colmenares de Vélez, Ana JuliaEn la presente tesis se describe la actividad biológica de derivados de ácido cinámico en Tithonia diversifolia y regioisómeros análogos de achyrofurano en Achyrocline satureoides. Con el fin de proporcionar un orden secuencial del trabajo de investigación, el documento se estructuró en dos capítulos. En la primera parte del capítulo 1, se describe la evaluación de diferentes extractos de hojas secas de T. diversifolia sobre obreras de colonias de laboratorio de Atta cephalotes mediante ingestión y contacto. Adicionalmente, se analizó la actividad biológica de los extractos como inhibidores de acetilcolinesterasa (AChE) y butirilcolinesterasa (BuChE). El extracto de diclorometano a 1000 ppm, mediante ingestión, presentó la mayor actividad insecticida, al causar 70 y 90% de mortalidad de hormigas obreras en solo cinco y siete días de tratamiento, respectivamente. Los valores de inhibición de la acetilcolinesterasa, mostraron que el extracto de diclorometano tuvo mejor IC50, en comparación a sus fracciones lo que demuestra que la actividad se potencializa al usar el extracto crudo. Estos resultados pueden asociarse a la existencia de terpenos y sesquiterpenlactonas presentes en T. diversifolia probablemente inhibidores de la AChE. En la segunda parte, se reporta el aislamiento de un nuevo derivado de ácido cafeico a partir del extracto butanólico de hojas de Tithonia diversifolia. La estructura se determinó como ácido (E)-3-(((3-(3,4-dihidroxifenil)acriloiloxi)metil)-2-metiloxirano-2-carboxílico (1). Además, se aislaron seis conocidos ácidos fenólicos, ácido 4,5-di-O-dicafeoilquínico (2), ácido 3,4-di-O-dicafeoilquínico (3), ácido 3,5-di-O-dicafeoilquínico (4), ácido 3-O-cafeoilquínico (5), ácido 4-O-cafeoilquínico (6) y ácido 5-O-cafeoilquiníco (7); los compuestos 1, 2 y 3 son reportados por primera vez en esta especie. Las estructuras de los compuestos se establecieron basándose en LC-MS y análisis espectroscópicos de RMN (1D) y (2D). La evaluación de la capacidad antioxidante, realizada en placas de 96 pozos, mostró que los derivados de ácido cafeico probados poseen fuerte capacidad captora de radicales DPPH y moderado poder antioxidante reductor de hierro (FRAP). Finalmente, en el capítulo 2 se describe la obtención de dos dibenzofuranos polioxigenados simétricos análogos de achyrofurano (39a-b) con restos 2-metilbutiroilo en C-4 y C-6 a partir de floroglucinol comercial, a través de una secuencia de reacciones que incluyen monoacilación, yodación, acoplamiento Suzuki-Miyaura, dimerización oxidativa y ciclación. Adicionalmente con esta ruta, se sintetizaron nuevos compuestos racémicos: un derivado de floroglucinol yodado (36), siete derivados de acilfloroglucinol (37a-g) y tres acilfloroglucinoles (38a-b, 46). Algunos de los compuestos obtenidos fueron activos contra bacterias Gram-positivas, incluyendo aislados clínicos multirresistentes de Staphylococcus aureus. El dibenzofurano 39b con cadenas de propilo en C-2 y C-8 exhibió la mejor actividad antibacteriana con valores comparables a los del dibenzofurano achyrofurano natural. Palabras claves: Botón de oro; Hormigas cortadoras de hojas; Actividad insecticida; Actividad inhibitoria de colinesterasa; Derivados de ácido cafeico; 2,2-difenil-1-picrilhidrazilo; Actividad captora de radicales libres; Poder antioxidante reductor de hierro; Contenido total de fenoles; Actividad antibacteriana; Dibenzofuranos; Derivados de floroglucinol.Publicación Acceso abierto Adaptación de la guía “safety reports series no.63”[6] del ICPR para el egreso de pacientes en tratamiento con I-131 en la Clínica Imbanaco Sas(Universidad del Valle, 2023) Lopez Muñoz, Deivid Orlando; Velasco Jaramillo, Johana Alexandra; Zamora, Ligia EdithLa terapia con I-131 en pacientes con cáncer de tiroides es efectiva, pero presenta riesgos por la radiación, para las personas del entorno. Para cuantificar estos riesgos se usaron distintos detectores, a los cuales se les realizó una serie de pruebas para confirmar su correcto funcionamiento, y una vez garantizado, se midió la tasa de dosis emitida tanto a un metro de distancia (altura cuello) como a cinco centímetros de la glándula tiroidea, de 26 pacientes cuyas dosis de I-131 fueron de 3700MBq o 100 mCi y 5550MBq o 150 mCi. Se calculó la tasa de dosis anual para las personas que pudiesen estar en contacto con ellos durante este periodo, tales como la pareja, hijos y otros en el transporte público; con base a estos cálculos, se establecieron recomendaciones para limitar la tasa de dosis anual de las personas a 1 mSv/año. Estas recomendaciones variaron según la tasa de dosis emitida por el paciente en el momento del alta dosimétrica, siendo el límite máximo para el alta 70μSv/h. Para dichos pacientes que cumplan con el máximo establecido, se establecieron recomendaciones tales dormir a solas a partir del séptimo día, en cuanto al contacto diario con la pareja se establece en tres horas para el primer día, cinco para el segundo y 8 después del tercer día, por otro lado, evitar el contacto con niños(<2años) hasta nueve días después, para los infantes entre dos y cinco años se establecen ocho días y para aquellos que superen los once años llega a los seis días. En cuanto al transporte público, se establecen horas de transporte privado de dos horas y de 42 minutos para el caso de transporte público. De la misma manera, se realizan cálculos para tasas de dosis emitidas de 60μSv/h, 50μSv/h, 40μSv/h, 30μSv/h, 20μSv/h y 10μSv/h. Adicionalmente, se identificaron casos especiales que podrían requerir un análisis adicional debido a la velocidad de eliminación del I-131 de cada paciente, lo que puede generar que los pacientes de más alta dosis(5550MBq o 150 mCi), puedan estar internados hasta 48 horas.Publicación Acceso abierto Adquisición y procesamiento de datos con un sistema portable de espectroscopia de absorción diferencial para la detención de trazas de NO2, O3 y vapor de agua en la troposfera en la ciudad de Cali(Universidad de Valle, 2018) Naranjo Gómez, Francia Elena; Solarte Rodríguez, EfraínMedidas de las densidades de columna de gases traza de NO2, O3, vapor de agua y O4 en la tropósfera de la ciudad de Cali fueron realizadas usando un sistema de espectroscopia óptica diferencial multiaxial. Se empleó la huella espectral de estos elementos en el rango visible de la luz, estos gases traza son importantes indicadores de contaminación local debida a procesos de combustión interna. Se llevó a cabo durante los meses de marzo, abril y mayo de 2016, en el horario de 9:00 a.m a 11:00 a.m, en el punto GPS latitud: 3.374577, longitud: -76.532796 en dirección noroeste. Para obtener la información se utilizó la técnica multi-axial MAX-DOAS, que se basa en los principios clásicos de espectroscopia de absorción diferencial, a través de un análisis de la ley de Lambert-Beer, para detectar variaciones de intensidad muy pequeñas en los espectros absorción de la luz solar que atraviesa la atmósfera. Para realizar las mediciones se diseñó y se ensambló un sistema que básicamente consta de un telescopio, un computador y un espectrómetro óptico. Las mediciones se realizaron dirigiendo el telescopio primero en dirección nor-oeste de la ciudad de Cali hacia el horizonte (0°), y posteriormente el telescopio se mueve ascendiendo hacia la vertical (Cenit: 90°); se tomaron 35 espectros en cada barrido horizonte- cenit. Para garantizar la repetitividad y precisión del barrido vertical se empleó un sistema electro- mecánico controlado por computador. El montaje experimental, la calibración del sistema, el procedimiento de medición y el manejo del software para obtener los resultados, se describen en este trabajo. El presente documento puede ser empleado por futuros operarios y desarrolladores del sistema.Publicación Acceso abierto Afectación de la masa de las estrellas de neutrones por acoplamiento con el axión en gravedad modificada(Universidad del Valle, 2025) Moreno Chalacá, Sebastián; Granda Velasquez, Luis Norberto; GRAVITACIÓNEn este trabajo se investiga la estructura de estrellas de neutrones en el marco de una teoría escalar-tensorial axiónica. El modelo se define por un acoplamiento no mínimo entre el campo de axión y la curvatura, descrito por la función f(ϕ)=1+ξϕ², y se analiza en el régimen cosmológico post-inflacionario, donde el axión oscila en torno al mínimo de su potencial. Se derivan las ecuaciones de Tolman-Oppenheimer-Volkoff (TOV) modificadas en el marco de Einstein, las cuales se resuelven numéricamente para obtener la estructura interna y externa de la estrella. Para ello, se implementó un método de disparo bidimensional en Python. A partir de estas soluciones, se calcula la masa y el radio observables en el marco de Jordan. El análisis se lleva a cabo para tres ecuaciones de estado (EoS) nucleares realistas, aproximadas como politropos a trozos: Wiringa-Fiks-Fabrocini (WFF1), Skyrme-Lyon (SLy) y Akmal-Pandharipande-Ravenhall (APR). Los resultados demuestran que el acoplamiento del axión induce un fenómeno de escalarización espontánea, generando soluciones estelares con una masa máxima superior a la predicha por la Relatividad General. Se encontró que, si bien las curvas M-R son consistentes con ciertas cotas observacionales como los límites de compacidad de GW170817, presenta una tensión con las mediciones de radio de NICER. No obstante, el modelo, especialmente con la EoS APR, logra producir estrellas de neutrones con masas de hasta 2.22M⊙, posicionándolas en el umbral de la ``brecha de masa'' observacional. Esto confirma que la teoría estudiada es un mecanismo viable para la existencia de estrellas de neutrones supermasivas, aunque su compatibilidad fenomenológica completa depende fuertemente de la EoS nuclear subyacente y de los parámetros del modelo axiónico.Publicación Acceso abierto Agroecological causes of the mass death of peach palm (Bactris gasipaes, Arecaceae) In Colombia(Universidad del Valle, 2021) Vásquez-Ordóñez, Aymer Andrés; Lohr, Bernhard Leo; Montoya-Lerma, JamesLas nuevas interacciones entre cultivos y plagas son una oportunidad para entender el origen y mecanismos de la relación planta-plaga. La reciente e inexplicable muerte masiva de palmas de chontaduro (Bactris gasipaes) en agroecosistemas tropicales colombianos permite explorar las fuerzas ecológicas y evolutivas de la interacción de esta palma y sus picudos barrenadores del tallo. Para esto, los insectos y sus daños fueron examinados en 4098 palmas de chontaduro procedentes de 36 cultivos en las regiones de la Amazonia, Andes y Pacífico en Colombia. La identificación taxonómica de estas plagas requirió una descripción morfológica de las larvas y taxonomía molecular con el gen COI de los géneros Dynamis y Rhynchophorus. De los 419 picudos recolectados en 87 palmas de chontaduro dañadas, 51 fueron D. borassi y 368 R. palmarum. D. borassi fue la plaga inicial al atacar las inflorescencias sin abrir de la palma y barrenar el peciolo hacía el tallo, lo cual facilita el daño posterior de R. palmarum. En 32 de los cultivos se determine el nivel de infestación con un transecto de área variable. Los daños visibles estuvieron entre 0 a 70% de las palmas afectadas y estuvo más alto en la costa pacífica. Se realizaron nuevos reportes en el sur de la costa pacífica, los Andes y la Amazonía. Los niveles de infestación fueron relacionados con 109 variables agroecológicas en todos estos cultivos (ej., tipo de manejo, cobertura de bosque circundante, nutrientes del suelo, clima, etc.). La infestación de los picudos se relacionó con variables de paisaje en las tres regiones, particularmente con la densidad y forma de la cobertura no bosque, el cual es un indicador de la fragmentación del bosque. Los datos soportan la idea que la deforestación y el decrecimiento de recursos (inflorescencias de la palma natural como O. bataua) ocasiona que las poblaciones de D. borassi incremente la infestación de inflorescencias de palmas de chontaduro, la cual inicia el daño y causa finalmente su muerte masiva. Se midieron 17 partes del cuerpo de 23 adultos de D. borassi de palmas de chontaduro (22) y su palma hospedero nativa Oenocarpus bataua (1), y 107 R. palmarum de palmas de chontaduro (43), caña de azúcar (59) y la palma Bismarkia nobilis (5). La caña de azúcar es un nuevo hospedero en Colombia. Los 21 D. borassi de la palma de chontaduro y 59 de R. palmarum de caña de azúcar fueron más pequeños que aquellos de las plantas hospederas nativas. Las secuencias del gen COI de ocho muestras de R. palmarum de caña de azúcar fueron genéticamente diferentes de 149 secuencias (9 de ellas de palmas de chontaduro de este estudio y 138 de Brasil y dos de Costa Rica, procedentes de las bases de datos de GenBank y Bold). Esta investigación genera nuevas preguntas sobre el rol de las especies de palmas hospederas alternativas y su interacción con el paisaje en el origen de una nueva plaga de chontaduro.Publicación Acceso abierto Un algoritmo cuasi Newton inexacto global para problemas de complementariedad no lineal.(2019-09-17) Arias Torres, Carlos Andrés; Martínez Romero, Héctor Jairo; Pérez Mera, RosanaEn este trabajo de investigación proponemos y desarrollamos un método cuasi Newton inexacto global para resolver el problema de complementariedad no lineal (PCNL) de una manera indirecta: en primer lugar, reescribiremos el PCNL como un problema de Complementariedad Horizontal (PCH) y posteriormente, reescribiremos el PCH como un problema de minimización. Cabe destacar que abordar el PCNL de esta manera nos permitirá trabajar con reformulaciones diferenciales de la versión original del problema. De igual forma, proponemos una leve modificación al algoritmo para resolver problemas de complementariedad no lineal, con el fin de obtener un método que permita encontrar las raíces positivas de sistemas de ecuaciones no lineales de gran tamaño.Publicación Acceso abierto Análisis bioinformático de los eventos fractales relacionados con fenómenos epigenéticos del genoma humano en la integración de los lentivirus.(Universidad de Valle, 2014) Alzate Rincón, Lina Andrea; García Vallejo, Jesús Felipe; Moreno Tovar, Pedro AntonioLa integración retroviral del VIH en el genoma humano es uno de los procesos más complejos en el estudio de la dinámica estructural y funcional del virus durante la progresión de la enfermedad. Uno de los principales problemas en el estudio de la integración es la existencia de muchos sitios calientes ("hotspot"), de preferencia viral y la razón por la que el virus prefiere estas zonas es aún desconocida. La evidencia actual muestra que la integración de cADN lentivirus no es al azar, ya que algunas condiciones topológicas de la cromatina interfásica son importantes para determinar el "nicho" genómico para integrarse. Estudios previos han demostrado que la multifractalidad a lo largo del genoma humano ésta relacionada con el contenido de elementos Alu y la estabilidad del genoma. Esto es debido que las regiones de baja y media multifractalidad, de baja estabilidad genómica, son más susceptibles de exhibir efectos epigenéticos-ambientales, mientras que las regiones de alta multifractalidad, más estables, estarían relacionadas con efectos genéticodeterministas. Dado que el VIH es un agente exógeno al genoma, se predice que los sitios de integración del VIH estarían relacionados con valores de baja y media multifractalidad y por ende de baja estabilidad genómica. El objetivo de la presente investigación es poner a prueba el modelo multifractal propuesto versus la integración del VIH.Publicación Acceso abierto Análisis bioinformático de secuencias no codificantes en metagenomas : una revisión actualizada(Universidad del Valle, 2017) Cháves Garreta, César Iván; Moreno Tobar, Pedro AntonioLa metagenómica se apoya en la bioinformática para describir y clasificar un sin número de microorganismos. Muchos de los enfoques en esta área, centran su atención en las características funcionales derivadas de secuencias codificantes, descartando las secuencias no codificantes (NCS), aun conociendo su participación en la maquinaria regulatoria de los genes. Recientemente, un estudio desarrollado en la Universidad del Valle utiliza las NCS para caracterizar metagenomas y desarrollar un marco de trabajo bioinformático para el estudio de los microorganismos asociados a medioambientes.Publicación Acceso abierto Análisis cladístico de los grupos de especies del género Lachesilla westwood (Psocodea: psocomorpha: lachesillidae)(Universidad del Valle, 2016) Saenz Manchola, Oscar Fernándo; Gonzalez Obando, Ranulfo; García Aldrete, Alfonso NeriLachesilla es el género más grande de la familia Lachesillidae, cuenta con alrededor de 310 especies descritas, agrupadas fenéticamente en 20 grupos de especies. Con el objetivo de establecer las relaciones entre esos grupos, se realizó un análisis filogenético con 51 especies y 70 caracteres morfológicos, explorando las topologías más parsimoniosas bajo análisis de peso iguales (EW) e implícitos (IW). Como resultado de ambos análisis, el género Lachesilla no se recuperó como monofilético, dividiéndose en dos grandes clados; el clado A conformado por el grupo de especies Pedicularia + Nadleria, y el clado B conformado por los restantes 19 grupos de especies. El análisis de pesos implícitos (IW) logró una topología más corta y con mejor resolución, permitiendo establecer dentro del clado B, tres subclados con bajos valores de soporte de ramas. El subclado BI lo conformaron las especies de los grupos Rufa + Corona; el subclado BII incluye las especies de los grupos Riegeli + Patzunensis + Forcepeta, mientras que el subclado BIII está conformado por los grupos Andra + Cerorma + Mexica + Centralis + Sclera + Simojovelensis + Texcocana + Fuscipalpis + Q + Szirackii.Publicación Acceso abierto Análisis de composición y distribución de bacterias fijadoras de nitrógeno en ecosistemas del Valle del Cauca(Universidad del Valle, 2017) Asprilla Carabalí, Paola Andrea; Sanabria Gómez, Irma JanethGrupos taxonómicos de los dominios Archaea y Bacteria emplean el nitrógeno atmosférico y lo transforman en compuestos de gran importancia a nivel celular como las proteínas y los ácidos nucléicos. Existen varias rutas bioquímicas establecidas dentro de un proceso general denominado “Ciclo del Nitrógeno”. Las bacterias fijadoras de nitrógeno transforman el Nitrógeno molecular a Nitrógeno combinado. Estas bacterias son diversas metabólica y ecológicamente en relación a los ecosistemas en donde se encuentran. Este estudio tiene como objetivo analizar la composición y distribución de bacterias fijadoras de nitrógeno en ecosistemas naturales y construidos. Mediante el aislamiento de microorganismos diazótrofos a partir de muestras de suelo y lodos de aguas residuales domésticas e industriales en medios líquidos libres de nitrógeno. Se usaron diferentes fuentes de carbono y se recuperaron en agar RBA. Se estableció por medio de la prueba t-student pareada (t (15) = -2.40 p=0.03) que el medio RBA permitió la mayor recuperación de bacterias fijadoras en los diferentes ecosistemas. De acuerdo con el criterio de información de Akaike no se encontraron diferencias entre los medios con diferentes fuentes de carbono. Se logró aislar siete géneros asociados a la fijación de nitrógeno: Klebsiella, Enterobacter, Citrobacter, Azotobacter, Rhizobium, Bacillus y Escherichia. Géneros que han sido ampliamente estudiados por su alta capacidad de fijación. El uso de medios libres de nitrógeno permitió el aislamiento y cuantificación de bacterias fijadoras de nitrógeno y representa un avance relevante en el conocimiento de este tipo de microorganismos en ecosistemas de la regiónPublicación Acceso abierto Análisis de huellas metabólicas en muestras de pacientes enfermos del virus dengue por resonancia magnética nuclear.(2016-11-21) Mena Ramírez, Leidy Vanessa; Wist, JulienEl dengue es una enfermedad viral, transmitida por mosquitos Aedes aegypti, el vector más importante en términos de morbilidad, mortalidad y afectación económica. En Colombia, ésta enfermedad tropical representa un pro-blema prioritario en Salud Pública, manifestando variables signos y síntomas que no son característicos, por lo cual se pueden confundir con patologías dentro de los síndromes febriles, presentando un cuadro clínico indefinido. Mediante la implementación de nuevas herramientas que permitan identificar las perturbaciones de los procesos metabólicos y revelar la variedad de rasgos de la infección, es posible la creación de modelos de diagnóstico en etapas tempranas. El análisis de huellas metabólicas, obtenidas por RMN, con estadística multivariada; PCA y OPLS-DA, revelaron diferencias en muestras de suero y plasma de pacientes infectados con el virus dengue (n = 92), que permitieron distinguir entre la fase aguda y la fase de recuperación. Tres metabolitos fueron identificados; lactato, lípidos y un metabolito no identificado, mediante OPLS-DA (R2x = 0.678 y Q2 = 0.592).Publicación Acceso abierto Análisis de la complejidad de los sistemas de producción de cacao (Theobroma) en el Tolima utilizando métodos de inteligencia artificial(Universidad del Valle, 2022) Mora-Herrera, Denys Yohana; Zuñiga Escobar, OrlandoLa incertidumbre, la complementariedad entre elementos y la no linealidad son características de los sistemas de producción de cacao y por tanto se definen como sistemas complejos. Esta investigación se propone modelar un índice de complejidad para los sistemas de producción de cacao utilizando herramientas de inteligencia artificial, específicamente lógica difusa y modelación basada en agentes, para las cuales es indispensable conocer cómo se configuran y cómo se comportan los sistemas de producción a fin de que la modelación y simulación retraten la realidad que en estos ocurre. En campo fueron georreferenciados los lotes del cultivo, se aplicaron encuestas y entrevistas estructuradas para recopilar información socioeconómica y de prácticas de beneficio, asimismo muestras de suelos y de grano seco fueron colectados para posteriormente enviarlos a análisis de laboratorio. Para el modelado de lógica difusa se empleó el software GeoFIS y para la modelación basada en agentes se usó Netlogo, ambas plataformas son de acceso libre. Los datos de 10 fincas se utilizaron para calibrar y ajustar el modelo que posteriormente fue validado con los datos de otras 20 fincas, todas ubicadas en tres municipios del Tolima en Colombia. Los resultados son fáciles de interpretar y consistentes con las observaciones de campo. Además, los resultados fueron validados con los productores de cacao que participaron en la investigación. Dado que las salidas intermedias de los modelos también son interpretables es posible identificar los factores que limitan la variable de salida final así como simular el comportamiento de los sistemas para evaluar estrategias de adaptación propuestas. Estos resultados pueden apoyar procesos de toma de decisiones para mejorar algunos componentes de los sistemas de producción a escala de finca, municipio o país.Publicación Acceso abierto Análisis de la dinámica del dengue a partir de un modelo meta-poblacional(Universidad del Valle, 2017) Llanos Andrade, Aarom Marcell; Arias Castro, Juddy HelianaEn este trabajo de grado, planteamos un modelo metapoblacional tipo SIR-SI para analizar la propagación del virus del dengue en dos zonas, teniendo en cuenta el tiempo de permanencia de los humanos en cada una de ellas. Para este propósito, consideramos que la tasa de natalidad, mortalidad y recuperación de los humanos son las mismas en ambas zonas; esta consideración también fue hecha para la tasa de natalidad y mortalidad de los mosquitos. Para dicho análisis, primero, calculamos algebraicamente el punto de equilibrio libre de enfermedad, demostramos la existencia del punto de equilibrio endémico y hallamos el numero reproductivo básico R0; con este _ultimo, establecemos la estabilidad de los puntos de equilibrio. Luego, hacemos un análisis de sensibilidad de R0 respecto a los parámetros del modelo. Por _ultimo, realizamos simulaciones numéricas utilizando los valores estimados de los parámetros del modelo SIR-SI de [16] obtenidos al ajustar los casos de dengue reportados a la Secretaria Municipal de Salud de Santiago de Cali en el año 2010.Publicación Acceso abierto Análisis de la variación fenotípica de manchas costales de Anopheles (Nyssorhynchus) en Colombia(Universidad del Valle, 2018) Cárdenas Henao, Heiber; Muñoz Flórez, Jaime Eduardo; González Obando, RanulfoSe estudiaron los patrones de manchas costales alares y su variación métrica en poblaciones de siete especies de Anopheles (Nyssorhynchus) de importancia médica en Colombia, usando morfología tradicional. Adicionalmente, se estudió en An. benarrochi B la variación en la conformación y el tamaño del ala utilizando morfología geométrica. Con base en las progenies de hembras recolectadas en campo e isofamilias de especímenes conservados en la colección del Laboratorio de Entomología Médica-Universidad del Valle, se estimaron los componentes VG-CovG y VE de estas características, usando los modelos de Becker (1984), Kempthorne (1969) y Falconer (1989). La asignación de las manchas costales se hizo según Wilkerson y Peyton (1990). Se realizaron comparaciones entre lados del ala, sexos y localidades. Se observó dimorfismo sexual en las frecuencias de los patrones alares y en las longitudes de las manchas costales. Los componentes genéticos de VP: VG, CovG, rG, H2 y Co-H2 fueron altos y significativos en la mayoría de características. Los análisis de morfología geométrica se realizaron siguiendo a Calle et al. (2008). El tamaño y conformación del ala en An. benarrochi B, mostraron alometría residual, asimetría fluctuante, efecto del recipiente de crianza significativas y heredabilidades promedio bajas. Las bajas h2 del tamaño y conformación del ala indican que son mayormente afectadas por el ambiente, con altos niveles de estabilidad en el desarrollo expresado en el porcentaje bajo de los componentes de varianza de asimetría fluctunte y asimetría direccional. Se puede deducir que, posiblemente incluyen interacciones génicas reflejadas en las altas estimaciones de heredabilidad en sentido amplio. En esta investigación se probó la utilidad del modelo Anopheles en estudios de caracteres longitudinales asociados funcionalmente. Se evaluó que tan heredables fueron las manchas costales, la conformación del ala y el tamaño, características utiles en la identificación taxonómica de especies de este género.Publicación Acceso abierto Análisis de las series de tiempo del IPC en la predicción de la inflación en Colombia(Universidad de Valle, 2018) Caicedo Palacio, Mauricio; Ortega Montero, Elmer; Arango, JaimeEn este trabajo se analizó la serie de tiempo de alimentos junto con sus sub-grupos, para los cuales se hallaron las componentes principales. Con la serie de tiempo de alimentos del DANE se ajustó un modelo Ar (2), que se uso para hacer predicciones de los meses Octubre y Noviembre para los cuales se hallaron los valores de -0,21 y 2,26 respectivamente, posteriormente con la serie de organización BTG Pactual Traiding Financial Group, se ajustó para estas un modelo Var(1), el cual nos dio una predicción de -0.65 para Octubre y -0.11 para Noviembre.Publicación Acceso abierto Análisis de poblaciones de prodiplosis longifila (diptera: cecidomyiisae) separadas altitudinalmente, mediante secuencias de ADN mitocondrial [recurso electrónico](Universidad del Valle, 2013) Velasco Cuervo, Sandra; Toro Perea, NelsonProdiplosis longifila (Gagné) es una de las principales plagas del tomate en Colombia, una de las hortalizas m´as importantes de consumo y comercialización en el país. P. longifila presenta un amplio rango de distribución en Colombia, sin embargo, es posible que algunas variables asociadas al cambio en el gradiente altitudinal, podrían causar diferenciación entre poblaciones, como ocurre en otras especies de insectos terrestres, lo cual podr´ıa detectarse usando códigos de barras de ADN. Con el objetivo de detectar posibles haplogrupos atribuidos al gradiente altitudinal, se analizaron siete pares de localidades cercanas geográficamente, pero separadas altitudinalmente. El análisis del gen COI en especímenes de P. longifila mostró mediante el Análisis de Varianza Molecular que la mayor proporción de la varianza se debe a la variación intrapoblacional, y los valores de FST cercanos a cero (P > 0,05) indican que no existe una estructura genética significativa entre poblaciones separadas altitudinalmente. Los an´alisis de distancia genética (K2P), mostraron valores interpoblacionales bajos entre 0,09% y 0,69% similares a los encontrados dentro de poblaciones. Finalmente, los análisis de agrupamiento confirman que no existen grupos atribuibles a regiones altas o bajas. En conclusión, los datos revelan que la altitud no tiene un efecto sobre la diferenciación poblacional de P. longifila, las cuales pueden mantener un alto flujo génico a pesar de la variación ambiental. Lo anterior explicaría porque este insecto-plaga tiene un amplio rango de distribución que podría estar asociado con la actividad antropogénica y probablemente con su alta capacidad adaptativa.