Examinando por Materia "Biología molecular"

Mostrando 1 - 4 de 4
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Análisis bioinformático de los eventos fractales relacionados con fenómenos epigenéticos del genoma humano en la integración de los lentivirus.
    (Universidad de Valle, 2014) Alzate Rincón, Lina Andrea; García Vallejo, Jesús Felipe; Moreno Tovar, Pedro Antonio
    La integración retroviral del VIH en el genoma humano es uno de los procesos más complejos en el estudio de la dinámica estructural y funcional del virus durante la progresión de la enfermedad. Uno de los principales problemas en el estudio de la integración es la existencia de muchos sitios calientes ("hotspot"), de preferencia viral y la razón por la que el virus prefiere estas zonas es aún desconocida. La evidencia actual muestra que la integración de cADN lentivirus no es al azar, ya que algunas condiciones topológicas de la cromatina interfásica son importantes para determinar el "nicho" genómico para integrarse. Estudios previos han demostrado que la multifractalidad a lo largo del genoma humano ésta relacionada con el contenido de elementos Alu y la estabilidad del genoma. Esto es debido que las regiones de baja y media multifractalidad, de baja estabilidad genómica, son más susceptibles de exhibir efectos epigenéticos-ambientales, mientras que las regiones de alta multifractalidad, más estables, estarían relacionadas con efectos genéticodeterministas. Dado que el VIH es un agente exógeno al genoma, se predice que los sitios de integración del VIH estarían relacionados con valores de baja y media multifractalidad y por ende de baja estabilidad genómica. El objetivo de la presente investigación es poner a prueba el modelo multifractal propuesto versus la integración del VIH.
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Las hélices paralelas : una visión crítica de la era genómica y postgenómica.
    (Universidad del Valle, 2020) Garcia Vallejo, Felipe; Domínguez G., Martha Cecilia
    El proyecto del Genoma Humano es, sin duda, en el área de la biología, la mayor empresa de investigación que ha emprendido el hombre en los últimos años. Los dos autores han entendido que esta es una poderosísima herramienta para comprender los diferentes fenómenos biológicos y los secretos de la evolución de las especies. Este libro es un intento brillante por actualizar toda la discusión que se adelanta en torno al Genoma Humano y las perspectivas que esta abre.
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Identificación de variantes genómicas del gen GBA en pacientes con patologías diferentes y no diagnosticados clínicamente con enfermedad de Gaucher en el suroccidente colombiano.
    (Universidad del Valle, 2021) Arturo Terranova, Daniela; Satizabal Soto, Jose Maria; Moreno Giraldo, Lina Johanna
    La Enfermedad de Gaucher (EG) es un trastorno genético autosómico recesivo, causado por la deficiencia de la enzima lisosomal B-Glucocerebrosidasa ácida (GBA). En Colombia se ha estimado una prevalencia de 1:266.441 habitantes. Sin embargo, el país no cuenta con datos exactos sobre frecuencia de variantes asociadas con la enfermedad. Con el objetivo de identificar las variantes del gen GBA, se realizó un estudio transversal, descriptivo, no experimental, con los resultados obtenidos de la secuenciación del exoma completo de 320 pacientes con patologías diferentes y sin sospecha clínica de EG. Se utilizaron softwares bioinformáticos para analizar la importancia clínica de las diferentes variantes. Se calculó la frecuencia poblacional de cada uno y se desarrolló una red de interacción del gen GBA. Como resultados, se encontraron 41 variantes asociadas al gen GBA; 21 de las variantes reportadas presentaron una significancia clínica benigna, 5 obtuvieron una clasificación patogénica o probablemente patogénica, con frecuencias que oscilaron entre 0,0062 y 0,0218 y 7 presentaron una significancia incierta. La variante más frecuente fue c.454+47G>A encontrándose en un 90% de las muestras con una significancia clínica benigna. 2 de las 5 variantes patogénicas se encontraron reportadas en asociación con enfermedad de Parkinson. La red de interacción de genes permitió observar asociaciones cercanas entre GBA y los genes PSAP, SCARB2, LAMP2, todos ellos asociados a funciones de localizaciones vacuolares, instrucciones de lumen lisosomal y vacuolar, membranas vacuolares y lisosomales. Nuestros resultados destacan el hecho de que el impacto en el fenotipo depende en gran medida de la patogenicidad de las variantes, por tal motivo es fundamental realizar estudios genómicos-bioinformáticos que permitan ampliar estos conocimientos. Además sugieren que las variantes en el gen GBA, incluso en individuos heterocigotos, podrían ser un factor de riesgo heredado para el desarrollo de parkinsonismo.
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Real time PCR. Application in dengue studies.
    (2011-11-09) Prada Arismendy, Jeanette; Castellanos, Jaime E.
    PCR (polymerase chain reaction) is a routinely used tool in every diagnostic and research laboratory. This technique has been used in detection of mutations and pathogens, forensic investigation, and even is the base tool for human genome sequencing. A modification of PCR technique, real time PCR, allows the quantification of nucleic acids with higher sensibility, specificity and reproducibility. This article is intended to clarify the foundations of real-time PCR, using an application model for virology. In the actual work, it was quantified the viral load of dengue virus serotype 2 produced from infected murine macrophages; the obtained results in this work established that murine strain BALB/c presents a greater susceptibility to dengue virus infection, which establishes BALB/c murine strain as a best model of study for investigation of dengue virus infection physiopathology. La reacción en cadena de la polimerasa (PCR) es una herramienta usada de rutina en todos los laboratorios de diagnóstico e investigación. Esta técnica se utiliza en detección de mutaciones y patógenos, investigación forense, e incluso es la base para la secuenciación del genoma humano. Una modificación de la PCR, la PCR en tiempo real, permite la cuantificación de ácidos nucléicos con mayor sensibilidad, especificidad y reproducibilidad. Este artículo pretende revisar los principios de PCR en tiempo real y exponer un modelo de aplicación en virología en el que se cuantificó el número de copias virales producido a partir de macrófagos murinos infectados con virus dengue 2; los resultados obtenidos establecieron que la cepa murina BALB/c presenta una mayor susceptibilidad a la infección por virus dengue, lo que permite establecer esta cepa de ratones como un mejor modelo de estudio para la investigación de la fisiopatología de la infección por virus dengue.