Examinando por Materia "Detección de enfermedades"

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    PublicaciónAcceso abierto
    Detección de presencia y ausencia de Parkinson en audios de voz
    (Universidad del Valle, 2025) Sandoval Ramírez, Juan David; Loaiza-Correa, Humberto
    El objetivo de este trabajo de grado es la clasificación de presencia y ausencia de Parkinson mediante grabaciones de audio, que fueron extraídas de la base de datos IPVVS con grabaciones de voz en italiano. Además, se realiza la investigación de antecedentes nacionales e internacionales que hayan implementado procesos similares a los previstos en este proyecto, así como la revisión de un marco teórico que provea una contextualización de la aplicación en cuestión. El sistema propuesto consta, primeramente, de la etapa de preprocesamiento a los audios de la base de datos, que incluyó eliminación de silencios, remuestreo de frecuencia, filtrado y aumento de datos, mediante ventanas. En segundo lugar, la etapa de extracción de características y de espectrogramas, basados en los antecedentes consultados, además se aplicaron técnicas como Wrappers y Feature Selection para la selección de las características más discriminantes y la posterior normalización de los datos. Luego, con esta información se implementaron las máquinas de aprendizaje superficial como Random Forest (RF), Decision Trees (DT), Suppor Vector Machines (SVM) y K-Nearest Neighboors (KNN), teniendo dos maneras de clasificación. Finalmente, se implementaron dos redes neuronales convolucionales (CNN), como ResNet 18 y EfficientNet-B0, que fueron previamente entrenadas con ImageNet y aplicadas en este proyecto por medio de TransferLearning, debido al tamaño de la base de datos. En cuanto a los resultados obtenidos a través del sistema descrito, las máquinas de aprendizaje superficial lograron un promedio de exactitud en clasificación de 93.60%, destacándose KNN como el mejor clasificador con 96.38%, mientras que para el caso de las máquinas CNN el mejor desempeño registrado fue 98.56% por parte de EfficientNet-B0. Finalmente, se realiza la discusión de los resultados obtenidos y se establecen conclusiones con base en estos.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Detección molecular de micrometástasis en el ganglio centinela en cáncer de mama estadio temprano: valor pronóstico [recurso electrónico]
    (2019-10-29) Sua Villegas, Luz Fernanda; Maestro de las Casas, María Luisa; Vidaurreta Lázaro, Marta; Macía Mejía, Carmenza
    La biopsia selectiva del ganglio centinela es el procedimiento de elección para la estadificación axilar del cáncer de mama y permite seleccionar un subgrupo de pacientes en las que la linfadenectomía no aporta ningún beneficio adicional. Se recomienda estudiar el ganglio centinela en su totalidad a fin de evitar sesgos de localización de las metástasis, por lo que la inclusión de técnicas moleculares para estudio, permite cumplir con esta meta. El objetivo de esta investigación fue desarrollar la metodología y técnica molecular requerida para el estudio de biopsias de ganglios centinela en cáncer de mama temprano (hasta 3 cm), empleando la expresión diferencial de los genes Mamaglobina y Citoqueratina 19 (CK19), mediante la RT-PCR (PCR transcriptasa reversa y qPCR (PCR en tiempo real). Durante el periodo de Octubre 2004 a Marzo 2010 se incluyeron en el estudio 301 pacientes del Hospital Clínico San Carlos de Madrid España (HCSC) en estadio I y II de cáncer de mama. A todas se les realizó la técnica quirúrgica del ganglio centinela, identificación de metástasis ganglionar por las técnicas histológicas convencionales, tales como: congelación, impronta, coloración de hematoxilina y eosina (H&E) e Inmunohistoquímica (IHQ). Se recolectaron muestras congeladas a -80°C para la extracción de RNA y el estudio molecular por RT-PCR y qPCR para los genes Mamaglobina y CK19. Los análisis estadísticos se realizaron empleando el software STATA 12.0. La asociación entre Mamaglobina y CK19 se determinó por la prueba exacta de Fisher. La validez diagnóstica: sensibilidad (S), especificidad (E), valor predictivo positivo (VPP) y valor predictivo negativo (VPN) se determinaron con un nivel de confianza del 95%, donde la pruebas Gold estándar fueron H&E y la combinación H&E+IHQ. El análisis de supervivencia para la expresión de Mamaglobina y CK19 (RT-PCR y qPCR), H&E y la combinación H&E+IHQ se estimo por la prueba de Kaplan-Meier y las diferencias entre estas por el test de Log-Rank.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Estudio piloto para la detección del virus del papiloma humano en niños menores de dos años y en sus madres [recurso electrónico]
    (2019-10-22) Zambrano Ríos, Diana Carolina; Herrera Castañeda, Enrique (Director de Tesis o Trabajo de Grado); Castillo Giraldo, Andrés Orlando (Director de Tesis o Trabajo de Grado)
    La presente propuesta fue un estudio piloto que evaluó la metodología para la detección del VPH en mucosa oral y los cofactores presentes para la infección en un grupo de niños menores de 2 años y sus madres residentes en la ciudad de Cali, Colombia, con o sin lesiones benignas en la cavidad oral; En este , se evaluó la posible correlación entre el genotipo del VPH en la mucosa oral de la madre y la de su hijo así como el posible contagio del virus de madre a hijo directo por autoinoculación o heteroinoculación y/o indirecta por fómites contaminados Se realizó extracción de ADN de las mues tras con el kit comercial pure gene bucal cell kit (Quiagen); La detección de VPH se realizó por PCR utilizando los primers generales MY09/MY11 y GP5+/Gp6+. Los resultados se analizaron empleado el programa estadístico SPSS, edición 15.0, aplicando un análisis estadístico descriptivo y de las distribuciones de frecuencia y de las medidas de tendencia central la presencia de VPH, se determinó empleando el test de ji cuadrado con un grado de significancia de 0.05 y un nivel de confiabilidad de 95%. Se incluyeron 76 participantes mujeres con edades comprendidas entre 22 y 25 años, de las cuales, el 61.8 pertenecía n al estrato social 1, el 69.7% vivían en unión libre, 2.6% manifestó el hábito del tabaco, 59.2% no consumió alcohol y el 86.8% no consumió sustancias sicoactivas , además de los 76 participantes niños menores de 2 años de edad, el 50% fue ron de sexo femenino s , 77.6 de ellos nació por parto natural, 23.7% asistió a la guardería y ninguno de ellos presentó verrugas corporales. Para los resultados obtenidos se puede concluir que la prevalencia de detección para el VPH en mucosa oral de madres fue de 6.6% (n=5) mientras que en la cavidad oral de los niños fue del 1,3% (n=1); Los genotipos identificados en la mucosa oral de las madres fueron: VPH11, VPH 43 y VPH 73; y el genotipo identificado en la cavidad oral del niño fue: VPH6. Finalmente, e n este trabajo no se logró determinar asociación entre la presencia del VPH en cavidad oral de las madres con respecto a los hijos.