Examinando por Materia "Fitopatógenos"

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    PublicaciónAcceso abierto
    Caracterización de fitopatógenes y evaluación de biocontroles en ají tabasco Capsicum Frutescens (solanaceae) en Rozo, Valle
    (Universidad del Valle, 2014) Rodríguez Salazar, Gustavo Adolfo; Torres González, Celina
    Capsicum frutescens es un arbusto perteneciente a la familia Solanaceae, de gran importancia alimenticia, industrial y medicinal debido a la capsaicina, metabolito de gran potencial para el tratamiento contra el cáncer. Esta planta presenta problemas fitosanitarios causados por hongos, con síntomas específicos de manchas cloróticas que se controlan generalmente con agentes químicos. Se tomaron muestras de hojas de ají Tabasco de la localidad de Rozo, y fueron procesadas y sembradas en papa-dextrosa-agar (PDA). De los microorganismos aislados y purificados en diferentes medios de cultivo (PDA, agar avena y agar V8), se identificaron Alternaria alternata, Alternaria tenuis, Alternaria solani, dos morfoespecies de Colletotrichum gloeosporioides, dos morfoespecies de Rhizoctonia solani y dos morfoespecies de Cercospora sp
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    PublicaciónAcceso abierto
    Caracterización morfológica y molecular de phytophthora en ají (Capsicum frutescens var.tabasco), Valle del Cauca
    (Universidad del Valle, 2014) Aristizábal Castillo, Natalia; Torres González, Celina
    El objetivo de este trabajo fue la búsqueda de posibles estados quiescentes de Phytophthora en un terreno que apenas comenzaría a ser usado para la producción de Ají Tabasco (Capsicum Frutescens Var. Tabasco) de calidad exportación en una zona productora del Valle del Cauca. Phytophthora es un Oomiceto fitopatógeno que ataca gran variedad de plantas, desde hortalizas hasta árboles maderables, y tiene varias especies que se han encontrado en estudios del tizón tardío, mildeo polvoso y pudrición de raíz del ají.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Evaluación, caracterización y control de fitopatógenos de curcuma longa (zingiberaceae) en Dagua, Valle del Cauca
    (Universidad del Valle, 2016) Giraldo Montezuma, Susana; Torres González, Celina
    Curcuma longa L. es una planta tropical, perteneciente a la familia Zingiberaceae. Es una especie promisoria para Colombia, en especial para el departamento del Valle del Cauca por las condiciones ambientales y climáticas de la zona. Sin embargo, esta especie es atacada por muchas enfermedades fitopatógenas causando daños severos como pudrición de raíz y predisposición a infección fungosa, razón por la cual es preponderante la identificación de estos microorganismos para su conocimiento y posterior control. De las muestras provenientes del cultivo de Curcuma longa de la finca Agroecol, ubicada en el municipio de Dagua, se aislaron y purificaron un total dieciséis hongos fitopatógenos: cuatro especies del género Alternaria, nueve especies del género Fusarium, una especie del genero Bipolaris, Thielaviopsis paradoxa y un total de 10 cepas bacterianas, entre las que se determinaron Agrobacterium larrymoorei, Acinetobacter oleivorans, Bacillus methylotrophicus, dos cepas del genero Bacillus y dos del genero Psudomonas. Se evaluaron dos cepas antagonistas Trichoderma harzanium y Bacillus subtilis provenientes de dos bioinsumos comerciales, para el control y posible manejo de diecinueve fitopatógenos de Curcuma longa, buscando mejorar las condiciones fitosanitarias del cultivo, tener una mayor productividad, bajos costos de producción y contribuir a una agricultura más limpia. El antagonista Trichoderma harzianum mostró ser más eficaz con respecto a Bacillus subtilis para controlar los microorganismos fúngicos con un 80 y 100 % de inhibición. Bacillus subtilis por su parte ejerció un efecto fungistático sobre los patógenos, lo que lo hace igualmente un antagonista prometedor para el control de fitopatógenos de esta especie
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    PublicaciónAcceso abierto
    Evaluación, diagnóstico y biocontrol de fitopatógenos de CAPSICUM FRUTESCENS (SOLANACEAE) en Guacarí, Valle del Cauca
    (Universidad del Valle, 2016) Zambrano Orozco, Leidy Mayerli; Torres González, Celina
    El cultivo de ají tabasco (Capsicum frutescens) en los últimos años ha comenzado a expandirse y cobrar gran importancia debido a su alta rentabilidad, producción y posibilidades para exportación; sin embargo en Colombia los graves problemas fitosanitarios presentados, han limitado la productividad afectando los rendimientos y elevando los costos de producción. En esta investigación se caracterizaron los microorganismos patógenos presentes en una plantación de ají tabasco en Guacari ¿ Valle, identificándose veintisiete especies fúngicas: seis de Alternaria}, ocho de Fusarium}, cuatro de Nigrospora, dos de Curvularia, Aspergillus sp., Cladosporium sp., Colletotrichum truncatum, Colletotrichum sp., Exserohilum sp. y dos morfoespecies. Ocho especies bacterianas: dos de Bacillus, Bacillus magaterium, Erwinia sp., Kocuria halotolerans, tres de Xanthomonas. Los microorganismos fueron sometidos a pruebas de patogenicidad, con el fin de determinar su carácter patógeno, llevándose a cabo la caracterización molecular de aquellos que produjeron a nivel de invernadero los mayores niveles de daño. Los géneros Curvularia, Exserohilum y las especies Kocuria halotolerans, Bacillus megaterium no reportadas como patógenos del genero Capsicum, dieron positiva la prueba de patogenicidad. Finalmente se llevaron a cabo pruebas de antagonismo de Bacillus subtilis y Trichoderma harzianum contra catorce especies de hongos patógenos y las ocho especies de bacterias patógenas. Se encontró que B. subtilis inhibió el crecimiento del genero Alternaria, Kocuria halotolerans y Bacillus sp.3, sin embargo T. harzianum presento los mejores resultados al inhibir todas las bacterias patógenas y los hongos patógenos excepto, Colletotrichum sp y Curvularia sp.1. La mayor inhibición se presentó en Colletotrichum truncatum con PICR de 84,1%.
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    PublicaciónRestringido
    Genome assembly, structural and functional annotation of orange rust (Puccinia kuehnii) and brown rust (Puccinia melanocephala), phytopathogens of sugarcane
    (Universidad del Valle, 2026) Quiñones Olaya, Angie Valeria; Trujillo Montenegro, Jhon Henry; Rodriguez Castillo, Nohra; BIOINFORMÁTICA Y BIOCOMPUTACIÓN
    BACKGROUND Puccinia melanocephala (brown rust) and Puccinia kuehnii (orange rust) are major biotrophic pathogens severely affecting sugarcane production worldwide. Despite their economic impact, genomic resources for these species remain limited due to challenges inherent to obligate biotrophy, contamination during field sampling, and highly repetitive, dikaryotic genomes. This study aimed to generate high-quality phased genome assemblies for Colombian isolates of both pathogens and to perform structural, functional, and repeat-content analyses to provide foundational genomic resources for comparative genomics and sugarcane breeding programs. RESULTS : PacBio HiFi sequencing combined with LongPlex library preparation and phased assembly using Hifiasm enabled the generation of high-quality haplotype-resolved assemblies for both species. GenomeScope profiles indicated complex dikaryotic architectures, while BlobToolKit analyses identified and removed environmental contaminants, resulting in curated assemblies of 322.68 Mb (P. melanocephala) and 267.89 Mb (P. kuehnii). Compleasm completeness values exceeded 86% in both genomes. Transposable elements dominated both genomes, accounting for 73.7% of P. melanocephala and 68.7% of P. kuehnii, with LTR retrotransposons (Gypsy, Copia) and TIR transposons (Mutator, CACTA) being the most abundant. BRAKER predicted 32,412 and 15,690 protein-coding genes in P. melanocephala and P. kuehnii, respectively, with BUSCO completeness above 80%. Functional annotation with EggNOGmapper identified over 9,000 unique GO terms per species, and enrichment analysis of 1,849 shared genes revealed significant overrepresentation of biological processes and cellular components related to nuclear organization, intracellular signaling, protein transport, and fungal-type cell wall organization. CONCLUSIONS : These genomic assemblies represent the first genomic resources for Colombian isolates of P. melanocephala and P. kuehnii. The strong TE-driven genome expansion, diverse gene repertoires, and enriched functional categories highlight the evolutionary dynamics underlying pathotype diversification and host adaptation. These genomic resources provide a foundation for effector discovery, comparative genomics, and molecular surveillance, and offer valuable tools for sugarcane breeding programs aimed at developing durable resistance against rust pathogens.