Examinando por Materia "In silico"

Mostrando 1 - 2 de 2
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Caracterización de variantes genómicas asociadas a cardiopatía congénita en pacientes de la ciudad de Cali
    (Universidad del Valle, 2023) Grueso Cerón, Angie Lizeth; Satizabal Soto, José Maria; Arturo Terranova, Daniela
    Resumen Las cardiopatías congénitas, corresponden a errores durante la embriogénesis generando malformaciones estructurales y funcionales. Son las malformaciones congénitas más prevalentes y causantes de la mayor morbimortalidad infantil, 8% son debidas a variantes en genes asociados al desarrollo cardíaco. Para establecer la frecuencia poblacional de variantes genómicas causantes de cardiopatías congénitas, se realizó revisión de alcance de genes prevalentes,se utilizaron resultados de secuenciación exómica completa de 320 pacientes sin sospecha de cardiopatías congénitas,se realizó caracterización, clasificación de significancia clínica, y redes de interacción génica. La revisión de alcance permitió determinar que los genes NKX2-5, TBX20, GATA4, NOTCH1, PTPN11 son los más prevalentes, las variantes de mayorfrecuencia alélica fueron c.63A>G (0,2844), c.39T>C(0,3406), c.1132A>G (0,0406), c.1669+9T>C(0,3531) y c.854-30T>C(0,0875) respectivamente; se reclasificaron clínicamente las variantes del gen NKX2-5 c.335-311_335-303del de benigna a probablemente patogénica y del gen PTPN11, c.2354-24C>T y c.854-30T>C de benignas a patogénicas. Se identificaron 17% de variantes intrónicas y 4.8% de variantes missense; las redes de interacción permitieron determinar asociaciones entre moléculas pequeñas y genes cercanos con los que se comparten funciones del desarrollo cardiaco. Este trabajo contribuye al conocimiento sobre la frecuencia con la que las variantes genómicas asociadas a cardiopatías congénitas están presentes en la población, generando una herramienta para un diagnóstico temprano, un tratamiento precoz, disminuyendo así la morbimortalidad, con miras a un futuro tamizaje neonatal molecular universal de cardiopatías congénitas
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Reposicionamiento in silico y diseño estructural de nuevas moléculas para el tratamiento de la esquizofrenia
    (Universidad de Valle, 2020) Vasquez Paz, Bryan David; Mejía Gutierrez, Melissa Andrea; Fierro Pérez, Leonardo
    Se realizó un estudio de reposicionamiento in silico utilizando diferentes herramientas computacionales: Acoplamiento Molecular y Modelado del Farmacóforo. Se realizó acoplamiento molecular con tres dianas ampliamente estudiadas en el diseño de fármacos contra la Esquizofrenia, los receptores de dopamina: D2, D3 y D4. Se calculó la afinidad de setenta y siete fármacos que en estudios previos fueron reportados como prototipos a reposicionamiento para la esquizofrenia y se determinó que los fármacos que presentaron mayor acoplamiento y estabilidad a las dianas fueron: el Raloxifeno, la Linagliptina y la Flunarizina. Se analizaron las interacciones involucradas en el acoplamiento, donde se destacaron interacciones de tipo hidrofóbico. A partir de los resultados obtenidos se diseñaron cuatro nuevas subestructuras (R-06, L-09, R-52 y F-10), que presentaron mayor estabilidad. Las nuevas subestructuras tienen un radar de biodisponibilidad en los rangos aceptados para ser prototipos a fármacos. Finalmente, se propuso una síntesis química para las nuevas moléculas.