Examinando por Materia "Patógenos"
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Publicación Acceso abierto Comparación genómica de pseudomonas aeruginosa aislada del ambiente natural y hospitalario(Universidad del Valle, 2023) Aroca Molina, Kelly Johana; benitez campo, neyla; GUTIERREZ CEPEDA, SONIA JAKELINEPseudomonas aeruginosa es uno de los principales patógenos asociados a las infecciones en atención en salud (IAAS) a nivel mundial debido tanto a su capacidad para persistir en condiciones medioambientales adversas como a los mecanismos de patogenicidad que posee. Esta alta patogenicidad también se encuentra asociada a su gran plasticidad genética conferida por genes regulatorios, genes codificadores para resistencia intrínseca y adquirida, que propicia una mayor persistencia y diseminación. No es claro si los aislados ambientales poseen un alto potencial de patogenicidad, así como tampoco si codifican para fenotipos multidrogorresistentes a antibióticos, como en aislados clínicos. Por tanto, con el objetivo de comparar las características genéticas asociadas a virulencia y a resistencia en aislados clínicos y ambientales de Pseudomonas aeruginosa, se llevó a cabo el análisis bioinformático del genoma de 7 aislados hospitalarios y 7 aislados ambientales. Se obtuvieron 333 genes asociados a virulencia, de los cuales se encontró que aproximadamente el 62% de los genes se comparten entre todos los aislados. Este resultado permite afirmar que P. aeruginosa independientemente de su origen posee un alto potencial intrínseco para causar un amplio margen de infecciones a pesar de la baja probabilidad de encontrarse con un huésped vulnerable. En términos de resistencia antimicrobiana, se encontraron 135 genes de los cuales el 72,59% de ellos se comparten entre todos los aislados y difieren en el 27,41%. Estas diferencias son ocasionadas posiblemente por la presión selectiva que se ejerce en los ambientes hospitalarios por el constante uso de antibióticos.Publicación Acceso abierto Descripción del microbioma fecal de las aves columba livia y coragyps atratus de Cali, Colombia(Universidad del Valle, 2023) Calderón, Miguel Á; Castillo, Andrés; López-Alvarez, Diana CarolinaEl microbiota gastrointestinal es una de las comunidades más importantes de un organismo y dados los múltiples factores que lo influencian y su posible efecto en la salud pública es clave comprender su composición y los patógenos que pueden estar presentes. Por esto, se determinó la composición del microbioma gastrointestinal de C. livia y C. atratus a partir de muestras fecales recolectadas en Cali, así como de secuencias de C. livia de Países bajos y China, C. atratus de Estados Unidos y G. fulvus de Emiratos Árabes. Se identificaron 943 ASVs en las muestras de Cali y 2415 ASVs en todas las muestras. Para Cali, los phyla más abundantes fueron Proteobacteria (57%) y Firmicutes (42%). En general, para C. livia las familias más abundantes fueron Enterobacteriaceae (51,6%), Enterococcaceae (14,9%) y Clostridiaceae (6,3%), mientras que para C. atratus y G. fulvus fueron Fusobacteriaceae (4,2%), Micrococcaeae (4,1%), Peptostreptococcaceae (11,7%) y Moraxellaceae (3,1%). En las muestras de Cali se detectó la presencia de microorganismos con potencial patogénico pertenecientes a los géneros Streptococcus, Campylobacter, Chlamydia y Atopobium en C. livia y Clostridium, Klebsiella, Helicobacter y Fusobacterium en C. atratus. Las muestras de C. livia y C. atratus de Cali difirieron parcialmente en su composición con las muestras de los demás países, posiblemente por la ubicación geográfica, dieta u otros factores. Existen diferencias en la composición taxonómica de especies que comparten una ubicación, pero también entre organismos de una misma especie o nicho que habitan lugares distintos.
