Examinando por Materia "Patogenesis"

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    PublicaciónAcceso abierto
    Comparación genómica de pseudomonas aeruginosa aislada del ambiente natural y hospitalario
    (Universidad del Valle, 2023) Aroca Molina, Kelly Johana; benitez campo, neyla; GUTIERREZ CEPEDA, SONIA JAKELINE
    Pseudomonas aeruginosa es uno de los principales patógenos asociados a las infecciones en atención en salud (IAAS) a nivel mundial debido tanto a su capacidad para persistir en condiciones medioambientales adversas como a los mecanismos de patogenicidad que posee. Esta alta patogenicidad también se encuentra asociada a su gran plasticidad genética conferida por genes regulatorios, genes codificadores para resistencia intrínseca y adquirida, que propicia una mayor persistencia y diseminación. No es claro si los aislados ambientales poseen un alto potencial de patogenicidad, así como tampoco si codifican para fenotipos multidrogorresistentes a antibióticos, como en aislados clínicos. Por tanto, con el objetivo de comparar las características genéticas asociadas a virulencia y a resistencia en aislados clínicos y ambientales de Pseudomonas aeruginosa, se llevó a cabo el análisis bioinformático del genoma de 7 aislados hospitalarios y 7 aislados ambientales. Se obtuvieron 333 genes asociados a virulencia, de los cuales se encontró que aproximadamente el 62% de los genes se comparten entre todos los aislados. Este resultado permite afirmar que P. aeruginosa independientemente de su origen posee un alto potencial intrínseco para causar un amplio margen de infecciones a pesar de la baja probabilidad de encontrarse con un huésped vulnerable. En términos de resistencia antimicrobiana, se encontraron 135 genes de los cuales el 72,59% de ellos se comparten entre todos los aislados y difieren en el 27,41%. Estas diferencias son ocasionadas posiblemente por la presión selectiva que se ejerce en los ambientes hospitalarios por el constante uso de antibióticos.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Construcción de un modelo de interacción genético-metabólico basado en análisis bioinformático y correlaciones clínico-moleculares para la preeclampsia.
    (2019-10-22) Satizábal Soto, José Maria; García Vallejo, Jesús Felipe; Sánchez Gómez, Adalberto
    La Preeclampsia es la principal causa de morbimortalidad materna en el país -causando más del 42% de muertes- y permanece como una de las principales mundialmente. Es por este gran impacto que genera la PE y por su carácter complejo, que se hace necesaria una visión bioquímica, molecular y genómica integral, que permita explicar la patogénesis de la enfermedad y provea herramientas para su diagnóstico precoz. En este trabajo se construyó un modelo genético-metabólico de PE, basado en una simulación computacional y correlaciones clínico-moleculares. Para validar este modelo se tomaron 100 muestras de sangre periférica de dos grupos de mujeres embarazadas que ingresaron al servicio de Obstetricia del HUV: el primer grupo, de 50 muestras correspondientes a mujeres diagnosticadas con PE de acuerdo con los criterios internacionales, y el segundo grupo, formado por 50 con embarazo normal como controles. Se midieron los niveles sanguíneos de HCy y folatos mediante inmunoensayo de fluorescencia polarizada, y el perfil lipídico, Ácido Úrico, PCR y ACA mediante espectrofotometría. Se determinaron diferencias estadísticamente significativas para los niveles de PCR, Ácido úrico y ACA, siendo mayores en el grupo de mujeres con PE. En el estudio genómico de PE, mediante una simulación computacional, se analizaron niveles de expresión en placenta, de genes asociados a PE utilizando el z-score y sus interacciones proteicas. Para ello se aplicaron las redes de interacción, empleando el programa Cytoscape 3.2. De ésta se extrajeron los procesos biológicos más probables de la red; además se comparó la cromatina asociada a estos genes empleando recursos del NCBI y del Genome Browser UCSC. De los resultados derivados de éste análisis, se lograron identificar las proteínas codificadas por los genes ENG, LEP, TGFB1, NDRG1 y BCL6 como posibles biomarcadores de expresión en PE, además de confirmarse la angiogénesis alterada y apoptosis incrementada como unos de los procesos biológicos más afectados en el desarrollo de la enfermedad. Desde el enfoque sistémico, se compararon 76 muestras de mujeres preeclámpsicas y 96 de controles, extraídas de los datos de transcripción global de 14 mil genes consignados en el GEO a partir de experimentos con micromatrices de DNA.