Examinando por Materia "Rhizophora mangle"

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    Evaluación del almacenamiento de carbono como servicio ecosistémico en bosques de manglar de la costa pacífica colombiana.
    (2019-10-30) Palacios Penaranda, Martha Lucia; Cantera Kintz, Jaime Ricardo
    Los manglares proporcionan servicios ecosistémicos a las comunidades locales. Se evaluó el almacenamiento de carbono como servicio ecosistémico (Provisión y de regulación) en bosques de manglar de la costa pacífica colombiana, en bahía Málaga: Quebrada Valencia (QV) y en la bahía de Buenaventura: San Pedro (SP) y Piangüita (P). La información se obtuvo a través de entrevistas con las comunidades locales examinando el impacto de la cosecha de manglares sobre la estructura del bosque. Se realizó, además, el análisis de la composición, estructura y abundancia de las especies de manglar en los diferentes tipos de bosques, usando parcelas circulares y en estas se examinó la variación de reservas de carbono en los compartimentos del sistema, y la diferencia en las reservas de carbono del ecosistema debido al tamaño y la estructura de la vegetación de mangle que se encuentra.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Microbiota y microbioma endófito del tejido foliar y radicular de Rhizophora mangle L. (Rhizophoraceae) y Avicennia germinans L. (Acanthaceae) en la Bahía de Buenaventura, Colombia
    (Universidad del Valle, 2025) Cárdenas Hernández, Valentina; Toro-Perea, Nelson
    En los ecosistemas de manglar, la comunidad vegetal presenta diferentes adaptaciones que le permiten afrontar las condiciones ambientales estresantes de la zona intermareal. La interacción de las plantas de mangle con sus microorganismos endófitos se suma a estas adaptaciones para contribuir en el desarrollo exitoso de las plantas de mangle. En la interacción planta-endófito, los microorganismos confieren diversas ventajas a las plantas, como el incremento de la resistencia a condiciones extremas y, además, la producción de diversos compuestos bioactivos que pueden ser importantes en aplicaciones biotecnológicas. El objetivo de esta investigación fue caracterizar a nivel taxonómico y funcional la comunidad de endófitos asociados al tejido foliar y radicular de las especies Rhizophora mangle L. (Rhizophoraceae) y Avicennia germinans L. (Acanthaceae) presentes en la bahía de Buenaventura, Colombia. Para responder a este objetivo se empleó la secuenciación de metagenomas completos (WMS, por sus siglas en inglés: Whole Metagenome Sequencing), que permitió secuenciar todo el ADN genómico presente en las muestras de tejido foliar y radicular. Posteriormente, mediante herramientas bioinformáticas, se realizó el análisis taxonómico y funcional de la comunidad de endófitos. Se identificó que la microbiota endófita se constituye principalmente de bacterias, y, en menor proporción, eucariotas, arqueas y virus. También, se determinó que la estructura de la comunidad no se ve influenciada por la planta hospedera, sino por el tipo de tejido, siendo más diversa la comunidad asociada a las raíces. En cuanto al microbioma, se identificaron secuencias codificantes (CDS, por sus siglas en inglés: Coding DNA Sequences) asociadas a funciones relevantes en la adaptación a un bosque de manglar con un alto nivel de intervención humana. Estas categorías funcionales fueron: Tolerancia a la salinidad, desintoxicación por metales pesados y compuestos xenobióticos, y resistencia al estrés por factores bióticos y abióticos. Asimismo, fue posible ensamblar a partir de los metagenomas 24 genomas bacterianos que corresponderían a especies nuevas. En conclusión, nuestros resultados sugieren que los microorganismos endófitos de R. mangle y A. germinans actúan en sinergia con las adaptaciones intrínsecas de los árboles de mangle, permitiendo afrontar los retos que implica establecerse en los bosques de manglar.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Viromas y plasmidomas asociados a tejido foliar y radicular de Rhizophora mangle L. (Rhizophoraceae) y Avicennia germinans L. (Acanthaceae) en la Bahía de Buenaventura, Colombia
    (Universidad del Valle, 2025) Becerra Casierra, Carlo; Toro-Perea, Nelson
    El ecosistema del manglar, caracterizado por el predominio de vegetación arbórea, se encuentra expuesto a condiciones fisicoquímicas de alta variabilidad espacio-temporal, propias de los estuarios. Este ecosistema se distingue por la provisión de servicios ecosistémicos y su considerable impacto ecológico, que contribuye a la regulación de los ciclos biogeoquímicos, por lo cual, resulta relevante comprender las dinámicas ecológicas que gobiernan su establecimiento y supervivencia. La interacción planta-microorganismo desempeña un papel crucial en la modulación de diversos parámetros de la capacidad adaptativa vegetal. Dichas interacciones se pueden ver afectadas por elementos genéticos móviles (MGEs), tales como virus y plásmidos, que participan en la regulación de la composición del microbioma y le confieren genes que amplían su capacidad metabólica. No obstante, hasta ahora, no se han documentado estudios sobre estos MGEs en microorganismos endófitos de manglar. Esta investigación tuvo como objetivo caracterizar el viroma y plasmidoma en tejidos foliares y radiculares de Rhizophora mangle y Avicennia germinans, dos especies de mangle muy importantes en la Bahía de Buenaventura, Colombia, utilizando un enfoque metagenómico. El análisis de la comunidad viral reveló 2137 especies virales, pertenecientes a 166 familias. Los géneros Andhravirus y Valbvirus fueron predominantes en la comunidad viral de ambos tejidos y especies, mientras que el género Mementomorivirus fue exclusivo de los tejidos foliares de A. germinans. Los tejidos radiculares mostraron mayor riqueza y diversidad viral en comparación con los tejidos foliares, lo que sugiere un efecto significativo del tipo de tejido en la composición viral. Por otra parte, se identificaron genomas virales reconstruidos con genes auxiliares metabólicos (AMGs) asociados a funciones como colonización vegetal, exclusión competitiva y respuesta al estrés abiótico. Estos AMGs codifican enzimas relacionadas con el metabolismo de carbohidratos (CAZimas), proteínas de choque térmico, sistemas toxina-antitoxina y enzimas asociadas al metabolismo de nucleósidos, lo que indica un potencial rol de los virus en la modulación de la capacidad adaptativa de comunidades bacterianas endófitas. El plasmidoma mostró una alta abundancia de plásmidos asociados a géneros bacterianos como Chlamydia, Bacillus, Lactiplantibacillus y Streptomyces. Los plásmidos de Azospirillum y Rhizobium se detectaron exclusivamente en tejidos radiculares, lo que refleja el papel de los plásmidos en la interacción planta-microorganismo en entornos rizosféricos. Se reconstruyeron 5 plásmidos parcialmente reconstruidos y un plásmido completo. El plásmido completo pZW5A de Lactiplantibacillus, contenía genes funcionales como integrasas, sistemas toxina-antitoxina y enzimas asociadas al metabolismo de carbohidratos. Por su parte, los plásmidos reconstruidos portaban genes relacionados con la homeostasis del hierro, halotolerancia y biosíntesis de vitaminas, lo que sugiere su contribución a la adaptación bacteriana y a la interacción planta-bacteria. La diversidad del plasmidoma también estuvo influenciada por el tipo de tejido, destacando la importancia de las condiciones ambientales locales en la composición de estos MGEs. Este estudio demostró que el tipo de tejido es un factor clave en la composición y diversidad del viroma y plasmidoma endófitos en R. mangle y A. germinans, superando incluso las diferencias entre especies. Los virus y plásmidos identificados actúan como reservorios de genes funcionales que facilitan la adaptación de las plantas y su microbiota a condiciones estresantes. Los hallazgos resaltan el potencial biotecnológico de estos MGEs, especialmente en aplicaciones agrícolas sostenibles, como el desarrollo de inoculantes microbianos y estrategias de control biológico.