Examinando por Materia "Virus"

Mostrando 1 - 4 de 4
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Characterizing viruses mimicry mechanisms with protein-protein interactions and short linear motifs
    (Universidad del Valle, 2016) Becerra Sandoval, Andrés; Moreno Tovar, Pedro Antonio; Buchelli Guerrero, Victor A.
    Los virus son parásitos intracelulares obligados que predominan en todos los dominios de la vida. Las infecciones virales causan enfermedades y muertes a seres humanos y a organismos que sirven de alimento como plantas y ganado. Los cortos genomas virales codifican mecanismos de subversión de las células hospederas. Estos mecanismos están basados en interacciones proteína-proteína entre virus y hospedero. La disminución de los costos de la secuenciación de nueva generación ha impulsado un crecimiento exponencial del número de genomas virales en las bases de datos bioinformáticas. En contraste, el costo de las técnicas experimentales para la determinación de interacciones proteína-proteína entre virus y hospedero no está descendiendo a la misma velocidad. Aunque el número de interacciones proteína-proteína entre virus y hospedero ha crecido en las bases de datos, todavía es bajo para analizar los mecanismos de subversión viral con enfoques de biología de sistemas. Hay una necesidad de métodos computacionales de predicción de interacciones proteína-proteína entre virus y hospedero. Sin embargo, el número de estructuras 3D de proteínas virales y de hospederos es muy pequeño para realizar la predicción con métodos estructurales. La predicción de interacciones proteína-proteína entre virus y hospedero ha sido realizada principalmente con clasificadores basados en aprendizaje automático. No obstante, los clasificadores desarrollados no revelan en alto nivel por qué se infirieron las interacciones y son sensitivos a la calidad del conjunto de datos de aprendizaje. Para interacciones proteína-proteína entre virus y hospedero todavía no hay un conjunto de datos de validación de alta calidad. Esta tesis trata sobre la predicción de interacciones proteína-proteína entre virus y hospedero mediadas por motivos lineales cortos. Estas interacciones predominan más que las interacciones dominio-dominio entre virus y hospedero; además son usadas por varios virus. La inferencia de este tipo de interacciones se sustenta en hipótesis biológicas como la conservación de los motivos y su localización en regiones proteínicas desordenadas. El resultado de ésta tesis es un método y una plataforma computacional para predecir interacciones proteína-proteína entre virus y hospederos mediadas por motivos lineales. Las interacciones candidatas obtenidas son usadas para estudiar un subsistema particular humano, las proteínas que hacen síntesis de proteínas. Sin embargo, los métodos desarrollados pueden ser usados con cualquier otro subsistema como el interferon y el de apoptosis.
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    El diagnóstico viral por el laboratorio.
    (2014-01-30) Crespo, María del Pilar
    El diagnóstico de las entidades virales es uno de los mayores retos a los que se enfrenta la medicina actual, particularmente en países semejantes a Colombia donde el diagnóstico viral se hace de manera empírica. Durante las últimas décadas, el desarrollo progresivo de nuevas y mejores herramientas para evidenciar las causas de tipo viral, hace posible que estas entidades se puedan descubrir y estudiar no sólo a nivel de laboratorios especializados, sino también en los comunes. Las pruebas diagnósticas simples, rápidas y poco costosas para la demostración de antígenos han reemplazado las técnicas tradicionales, largas y dispendiosas y esto ha producido una mayor agilidad en la definición del diagnóstico. Por otro parte, descubrir anticuerpos es importante para documentar la prevalencia de una infección en individuos y poblaciones. Además, las pruebas de demostración molecular han mejorado la probabilidad de evidenciar los agentes virales pues se documenta la infección de modo categórico, y se estudian su progresión y seguimiento terapéutico. En Colombia es importante promover el manejo y ejecución adecuados y racionales de las técnicas disponibles, ya sean las tradicionales o las nuevas que mejoren los diagnósticos virales y diferenciales. Este artículo brinda un compendio sobre el tema, revisa las pruebas diagnósticas de mayor aplicabilidad en virología, lo que tiene utilidad como guía rápida, y además ofrece material de consulta tanto para profesionales como para estudiantes del área de la salud. Diagnosis in viral entities is an important challenge due to is difficulties, particularly in developing countries where, in most cases, empirical diagnoses and therapy are usually carried on. However, worldwide improvements and availability of new technologies now permit the study of viruses and viral diseases in many laboratories, not only in specialized research facilities. Tradicional tests used many years ago have been replaced by simple, rapid and often relatively inexpensive antigen detection test kits, that have revolutionized both clinical care and laboratory practice. The antibody test is useful to determine prevalence of viral infection and it is important to carry on epidemiological studies in local communities. On the other hand, molecular test have improved the ability for detecting viral agents and to document an infection, the disease progression and the follow up of the therapy more conclusively. It is important the development of new methodology and the implementation of new tests for a good viral diagnosis, also it is appropriate an adequate use of the available tests, in order to make more accurate diagnoses. The aim of this article is to discuss the new technology for viral diagnosis and how and when to apply it. The review is planned as a guide about the viral diagnostic tools for health-care workers and students.
  • Miniatura
    PublicaciónAcceso abierto
    Evaluation of the efficacy of novaluron 0.2 % GR for the control of Aedes (Stegomyia) aegypti (Diptera).
    (Universidad del Valle, 2019-08-30) Quimbayo F., Marcela; Pérez Pérez, Juliana; Rodríguez Gaviria, Paola A.; Amaya, Juan David; Rúa Uribe, Guillermo L; Sociedad Colombiana de Entomología - Socolen; Universidad del Valle; Montoya Lerma, James
    Aedes (Stegomyia) aegypti is the main vector of dengue, zika and chikungunya in the Americas. These diseases have a significant impact on public health. According to the World Health Organization (WHO), controlling these diseases requires a comprehensive approach, and the control of larvae is a part of that strategy. Insect growth regulator (IGR) insecticides stand out as an efficient alternative for facilitating the control of Ae. aegypti at immature stages. The main goal was to evaluate the effectiveness of IGR novaluron 0.2 % GR, in the 50, 90, 95 and 99 lethal concentrations (LC) for fourth-instar larvae of Ae. aegypti in the laboratory. In field conditions, the percentage of inhibition of emergence was estimated by using the LC levels obtained in the laboratory through two methods of water management with refill and without refill in 40 L recipients. The study was carried out in 30 homes in a neighborhood with a high incidence of dengue in Medellin (Antioquia, Colombia). The bioassays completed indicated that LC 50, 90, 95 and 99 corresponded to 0.019, 0.055, 0.065 and 0.084 mg/L, respectively. The field results indicated that novaluron 0.2 % GR efficiently inhibited the emergence of adult Ae. aegypti, suggesting that the product has potential as a population regulator at very low concentrations. The product is considered extremely useful for programs to prevent and control dengue, zika and chikungunya.