El presente trabajo estudia el impacto de la descentralización fiscal sobre la mejora en los indicadores de salud poblacional. Para esto, se realiza un ejercicio empírico en el que se definen las variables de descentralización fiscal como: los recursos de transferencias y los recursos propios generados por los entes territoriales y se analiza su relación con variables de salud poblacional como: la tasa de mortalidad infantil, la cobertura del régimen subsidiado y la tasa de vacunación para la vacuna DPT. Se realizan tres ejercicios econométricos de datos panel para una muestra de 22 departamentos en el periodo de tiempo 2000-2010 y se determina la especificación de efectos fijos para los tres modelos econométricos. Entre los principales resultados se encuentra que la descentralización fiscal tiene relación con la disminución de la tasa de mortalidad infantil y los aumentos en la cobertura del régimen subsidiado.