Maestría en Ciencias Biomédicas

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https://hdl.handle.net/10893/4062

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Examinando Maestría en Ciencias Biomédicas por Autor "Castaño Valencia, Rafael Santiago"

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    PublicaciónAcceso abierto
    Análisis estructural del canal de sodio dependiente de voltaje y de sitio receptor de anestésicos locales en dendrobátidos
    (Universidad del Valle, 2018) Mosquera Gil, Claudia Lorena; Castaño Valencia, Rafael Santiago; Sanchez Gomez, Adalberto
    En este proyecto se expone la obtención de siete nuevas secuencias completas (nunca reportadas en bancos de genes) de la subunidad) del canal de sodio dependiente de voltaje de músculo esquelético (Nav1.4) de seis ranas venenosas de la familia Dendrobatidae y de una rana de la familia Eleutherodactylidae, Eleutherodactylus johnstonei. El propósito principal del proyecto consistió en comparar las secuencias a nivel de dominios y estructuras secundarias con énfasis en residuos reportados como importantes en los procesos de inactivación rápida y lenta y residuos implicados en la unión de anestésicos locales (AL) y batracotoxina (BTX) al canal. Las secuencias que codifican para la subunidad a de los Nav1.4 de cada una de las especies de estudio, presentan una longitud aproximada 1820 aminoácidos y muestran un alto grado de conservación, compartiendo una similitud del 69,1% con la secuencia de Nav1.4 de Rattus norvegicus. Tanto el extremo amino como el extremo carboxilo terminal se encuentran altamente conservados, pero el extremo carboxilo terminal de la secuencia Nav1.4 de Phyllobates aurotaenia presenta motivos sin predicción de plegamientos de estructura secundaria beta que contrasta con la presencia de esta estructura en las otras especies de estudio.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Análisis transcriptómico de la glándula de veneno de tityus asthenes (escorpionida: buthidae) del municipio de Buenaventura, Colombia
    (Universidad de Valle, 2019) Muriel Triana, Natalia; Castaño Valencia, Rafael Santiago
    El escorpión Tityus asthenes, es la especie más común que puede afectar la salud humana en la Región del Pacífico Colombiano. Para conocer el transcriptoma de la glándula de veneno se construyó una librería de cDNA, el cual presentó un total de 19.359.053 reads, de los cuales se ensamblaron y se contaron 44.047 transcriptos. En el proceso de identificación, conteo y anotación funcional, se revelaron 218 transcriptos putativos del escorpión T. asthenes, homólogos a secuencias de especies del género Tityus. Estos transcriptos se organizaron en nueve diferentes categorías, donde el transcripto con mayor conteo fue un potenciador de bradiquinina (730.742 reads) y la categoría más abundante fue metaloproteinasas (37%). Las toxinas moduladoras de canales iónicos estuvieron representadas por sodiotoxinas (15%) y potasiotoxinas (10%), lo que se corresponde con lo reportado para especies de la familia Buthidae que afectan la salud de los humanos. Se realizó test de Irwin en ratones expuestos a la DL50 reportada por Gómez y colaboradores (2010) para la misma especie en la localidad de Mutatá-Antioquia (6,1 mg de veneno/kg ratón). Se observaron efectos en doce variables relacionadas al sistema autónomo, periférico y sistema nervioso central, sin ocurrir muerte en ninguno de los animales. Esto confirma que las neurotoxinas encontradas en el transcriptoma están siendo traducidas en péptidos en el veneno entero del escorpión, por lo cual se propone en el futuro adelantar estudios de proteómica, que permitan detallar la estructura de estos péptidos y sus actividades biológicas potenciales.
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    PublicaciónAcceso abierto
    "Estudio in silico e in vivo de la actividad farmacológica de nuevos compuestos de tipo pirazolopiridinas"
    (Universidad de Valle, 2019) Mejía Gutierrez, Melissa Andrea; Castaño Valencia, Rafael Santiago
    El presente el trabajo de investigación constituye un diseño metodológico que permite vincular diferentes herramientas in silico e in vivo en la búsqueda de la actividad farmacológica de nuevos compuestos sintéticos. Se identifican que modificaciones estructurales serían las más recomendables en orden de mejorar parámetros predictivos en su farmacocinética y farmacodinamica, que fragmentos interactúan en los farmacóforos establecidos y se candidatiza dos nuevos compuestos como posibles prototipos a fármacos. El desarrollo de esta investigación comprende tres fases in silico: 1) Monitoreo de diferentes propiedades de interés de los nuevos 21 compuestos de tipo pirazolopiridinas con su respectivos radares de biodisponibilidad. 2) Cálculos de acoplamiento molecular automatizado (Docking Molecular) con 975 proteínas reportadas en diferentes enfermedades y desbalances bioquímicos y modelado de los farmacóforos con menores energías de interacción. 3) Recopilación de dianas farmacológicas con mayor afinidad para cada compuesto y diseño de interactomas funcionales proteína-proteína monitoreando diferentes vías metabólicas involucradas. Y una fase in vivo 4) Estudios preclínicos para determinar el porcentaje de letalidad y afectación del sistema motor de siete compuestos representativos en el biomodelo Caenorhabditis elegans. Se encontró que todos los compuestos pasaron los primeros filtros estructurales, resaltándose los compuestos PRV-8 y 13-G, donde el primero fue el que presentó mayor flexibilidad y el segundo tuvo todas sus propiedades estructurales en los rangos óptimos del radar de biodisponibilidad. Los compuestos ensayados tuvieron una letalidad menor al 10% y no promovieron cambios significativos en su locomoción. En su mayoría estuvieron involucrados en la vía de señalización de estrógeno modulando la proteína AKT.