Examinando por Materia "Avicennia germinans"

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    PublicaciónAcceso abierto
    Metatranscriptoma de los endófitos de hojas y raíces de Rhizophora mangle y Avicennia germinans en la bahía de Buenaventura, Colombia
    (Universidad del Valle, 2025) Lemos Lucumi, Cesar Alejandro; Toro-Perea, Nelson
    El manglar es un ecosistema con una gran diversidad de organismos. En la bahía de Buenaventura la parte vegetal del ecosistema está compuesta principalmente por las especies Rhizophora mangle o mangle rojo, y Avicennia germinans o mangle negro. Una interacción poco estudiada pero muy importante, es la de las plantas con sus microorganismos endófitos. Esta relación es difícil de estudiar ya que la mayoría de los microorganismos endófitos no son cultivables mediante las técnicas actuales, sin embargo, el avance de las tecnologías de secuenciación ha generado la creación de herramientas ómicas de análisis de datos masivos, que permiten caracterizar las comunidades microscópicas presenten en una muestra. La metatranscriptómica nos confiere la capacidad de estudiar las funciones génicas que se encuentran activas en una comunidad, sin necesidad de realizar cultivos in vitro. Con el objetivo de estudiar las relaciones ecológicas, a nivel microscópico, que existen en los manglares, se realizó la caracterización del metatranscriptoma de los endófitos de hojas y raíces de R. mangle y A. germinans, en la bahía de Buenaventura, Colombia. Los resultados demostraron que existen diferencias significativas en la taxonomía y en las funciones encontradas en los metatranscriptomas analizados. Estas diferencias, se asociaron a la especie de planta hospedera y al tejido del que provenían las muestras. Además, se encontró que los microorganismos de ambas especies de mangle podrían aportar a la capacidad de sobrevivir de estas plantas en ambientes con altas temperaturas, presencia de metales pesados, xenobióticos y altos niveles de salinidad, además, de ayudar en la asimilación y almacenamiento de diversos nutrientes. Esta evidencia sugiera que la microbiota endofítica de A. germinans y R. mangle presenta un alto potencial biotecnológico y su estudio, a fondo, sería de gran utilidad para determinar su utilidad en el campo agrícola y de la bioprospección.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Microbiota y microbioma endófito del tejido foliar y radicular de Rhizophora mangle L. (Rhizophoraceae) y Avicennia germinans L. (Acanthaceae) en la Bahía de Buenaventura, Colombia
    (Universidad del Valle, 2025) Cárdenas Hernández, Valentina; Toro-Perea, Nelson
    En los ecosistemas de manglar, la comunidad vegetal presenta diferentes adaptaciones que le permiten afrontar las condiciones ambientales estresantes de la zona intermareal. La interacción de las plantas de mangle con sus microorganismos endófitos se suma a estas adaptaciones para contribuir en el desarrollo exitoso de las plantas de mangle. En la interacción planta-endófito, los microorganismos confieren diversas ventajas a las plantas, como el incremento de la resistencia a condiciones extremas y, además, la producción de diversos compuestos bioactivos que pueden ser importantes en aplicaciones biotecnológicas. El objetivo de esta investigación fue caracterizar a nivel taxonómico y funcional la comunidad de endófitos asociados al tejido foliar y radicular de las especies Rhizophora mangle L. (Rhizophoraceae) y Avicennia germinans L. (Acanthaceae) presentes en la bahía de Buenaventura, Colombia. Para responder a este objetivo se empleó la secuenciación de metagenomas completos (WMS, por sus siglas en inglés: Whole Metagenome Sequencing), que permitió secuenciar todo el ADN genómico presente en las muestras de tejido foliar y radicular. Posteriormente, mediante herramientas bioinformáticas, se realizó el análisis taxonómico y funcional de la comunidad de endófitos. Se identificó que la microbiota endófita se constituye principalmente de bacterias, y, en menor proporción, eucariotas, arqueas y virus. También, se determinó que la estructura de la comunidad no se ve influenciada por la planta hospedera, sino por el tipo de tejido, siendo más diversa la comunidad asociada a las raíces. En cuanto al microbioma, se identificaron secuencias codificantes (CDS, por sus siglas en inglés: Coding DNA Sequences) asociadas a funciones relevantes en la adaptación a un bosque de manglar con un alto nivel de intervención humana. Estas categorías funcionales fueron: Tolerancia a la salinidad, desintoxicación por metales pesados y compuestos xenobióticos, y resistencia al estrés por factores bióticos y abióticos. Asimismo, fue posible ensamblar a partir de los metagenomas 24 genomas bacterianos que corresponderían a especies nuevas. En conclusión, nuestros resultados sugieren que los microorganismos endófitos de R. mangle y A. germinans actúan en sinergia con las adaptaciones intrínsecas de los árboles de mangle, permitiendo afrontar los retos que implica establecerse en los bosques de manglar.