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Metatranscriptoma de los endófitos de hojas y raíces de Rhizophora mangle y Avicennia germinans en la bahía de Buenaventura, Colombia

Resumen en español

El manglar es un ecosistema con una gran diversidad de organismos. En la bahía de Buenaventura la parte vegetal del ecosistema está compuesta principalmente por las especies Rhizophora mangle o mangle rojo, y Avicennia germinans o mangle negro. Una interacción poco estudiada pero muy importante, es la de las plantas con sus microorganismos endófitos. Esta relación es difícil de estudiar ya que la mayoría de los microorganismos endófitos no son cultivables mediante las técnicas actuales, sin embargo, el avance de las tecnologías de secuenciación ha generado la creación de herramientas ómicas de análisis de datos masivos, que permiten caracterizar las comunidades microscópicas presenten en una muestra. La metatranscriptómica nos confiere la capacidad de estudiar las funciones génicas que se encuentran activas en una comunidad, sin necesidad de realizar cultivos in vitro. Con el objetivo de estudiar las relaciones ecológicas, a nivel microscópico, que existen en los manglares, se realizó la caracterización del metatranscriptoma de los endófitos de hojas y raíces de R. mangle y A. germinans, en la bahía de Buenaventura, Colombia. Los resultados demostraron que existen diferencias significativas en la taxonomía y en las funciones encontradas en los metatranscriptomas analizados. Estas diferencias, se asociaron a la especie de planta hospedera y al tejido del que provenían las muestras. Además, se encontró que los microorganismos de ambas especies de mangle podrían aportar a la capacidad de sobrevivir de estas plantas en ambientes con altas temperaturas, presencia de metales pesados, xenobióticos y altos niveles de salinidad, además, de ayudar en la asimilación y almacenamiento de diversos nutrientes. Esta evidencia sugiera que la microbiota endofítica de A. germinans y R. mangle presenta un alto potencial biotecnológico y su estudio, a fondo, sería de gran utilidad para determinar su utilidad en el campo agrícola y de la bioprospección.