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Examinando por Materia "Biotecnología"

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    PublicaciónAcceso abierto
    El alegato de la re apropiación de la naturaleza : hacia las nuevas formas biotecnologizadas del capital.
    (2016-04-22) Valdebenito González, María Paz
    Este artículo se propone analizar la relación naturaleza-sociedad en el marco de las nuevas producciones biotecnológicas, mediante un examen crítico de las intervenciones de la moderna biotecnología en la naturaleza. La biotecnología permite la reinvención del Sistema Capitalista en el contexto de una fuerte globalización del ambiente y el requerimiento de un añorado equilibrio ecológico. Esta reinvención surge a partir de una reapropiación de la naturaleza basada en el conocimiento científico y en una operación simbólica que, mediante el discurso del desarrollo sostenible, resignifica el concepto de naturaleza para dar con su normalización, dominio y capitalización en virtud de las necesidades del mercado y el capital.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Alternativa biotecnológica al proceso fisicoquímico de fijación de nitrógeno a partir de consorcios microbianos
    (Universidad del Valle, 2023) Rodríguez Arias, Oscar Mauricio; Villegas-Torres, Maria Francisca
    El presente trabajo doctoral aborda alternativa biotecnológica a la problemática asociada al proceso fisicoquímico de fijación de nitrógeno. Se desarrolló una estrategia de bioprospección en donde usando reactores en batch y a partir de inóculos provenientes de suelos y lodos de sistemas de tratamientos de aguas residuales, se establecieron ecosistemas microbianos capaces de crecer sin nitrógeno reactivo. Se determinó que, con la estrategia implementada independientemente del inóculo empleado, se puede establecer un consorcio microbiano fijador de nitrógeno logrando hasta duplicar la concentración de nitrógeno en el medio. Estas comunidades microbianas fueron posteriormente utilizadas en dos procesos biotecnológicos. En el primer caso, se acopló a la producción de metano en la valorización integral de residuos lignocelulósicos con una alta relación carbono nitrógeno C/N, en donde se pudo determinar que adicionando un 10% consorcio microbiano fijador de nitrógeno a un lodo anaerobio con respecto a su concentración de sólidos volátiles, se pudo aumentar hasta en un 57.5% la cantidad de biogas producido empleando bagazo de caña de azúcar (Saccharum officinarum) como sustrato. En el segundo caso, se utilizó un consorcio proveniente de suelo agrícola como sustituto a una fracción comprendida entre el 33% y 66% de la fertilización nitrogenada para la producción de ají cayena (Capsicum annuum L.). Se pudo determinar que al reemplazar en un 33% la fertilización nitrogenada por consorcios microbianos fijadores de nitrógeno se puede aumentar el peso y cantidad de frutos por planta. Los resultados obtenidos en esta investigación pueden ser aplicados en futuros estudios a un modelo integral de biorrefinería en el campo agroindustrial, en donde mediante el aprovechamiento de residuos orgánicos se produzcan biofertilizantes in situ y energía, disminuyendo la huella de carbono y nitrógeno de los procesos.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Análisis conceptual y metodológico de la innovación tecnológica
    (2011-10-13) Carrillo, Alexander; Castellanos, Oscar; Castro, Fernando; Jiménez, Claudia
    Se presenta la evaluación del proceso de innovación tecnológica en algunas empresas biotecnológicas colombianas, realizada mediante la aplicación de instrumentos de consulta a sus directivos. El trabajo consta de dos partes: el estudio de la manera en que estas firmas asumen la innovación tecnológica y los diferentes aspectos que ésta involucra, y un análisis FODA que se tomó como característico para la totalidad de empresas del sector biotecnológico, complementado con el aporte de expertos en el tema a través de un análisis estructural, con el cual se obtuvo un conjunto de variables clave que sirvió de base para el desarrollo de la segunda parte, en donde, por medio de la aplicación del Benchmark, se estudió la forma en que la innovación se implementa en la organización. Finalmente se plantean estrategias a corto, mediano y largo plazo para las empresas analizadas, extrapolables al sector biotecnológico, y se propone su adaptación a otros sectores y organizaciones en donde la innovación es fundamental para su permanencia y competitividad
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    PublicaciónAcceso abierto
    Análisis molecular de hongos antagonistas aislados de plantaciones de cacao (Theobroma cacao) de Norte de Santander.
    (Universidad del Valle, 2021-05-18) López Barrera, German Luciano
    Las técnicas de biología molecular se han utilizado con el fin de obtener marcadores genéticos especie específicos, encontrar diferencias polimórficas y proporcionar la información necesaria para la identificación de secuencias nucleotídicas relacionadas con factores de patogenicidad en especies relacionadas con el control biológico. En la actualidad el control biológico se considera indispensable en las estrategias de agricultura sostenible con base agroecológica en los cultivos interés creciente en Colombia como el cacao (Theobroma cacao L.). Analizar molecularmente diferentes cepas de hongos antagonistas con potencial biotecnológico con el fin de dilucidar similitudes genómicas y la búsqueda de fragmentos de ADN relacionados con factores de patogenicidad. Se estandarizó la técnica de RAPDs, mediante el uso de 10 iniciadores, así mismo se amplificó el gen pr1 mediante la técnica de PCR usando 6 pares de iniciadores. Se logró una clasificación inicial de la población de hongos antagonistas y así mismo se demostró la diversidad de los aislados. Además, se logró amplificar tres genes de las cepas Beauveria bassiana, Trichoderma yunnanense y Purpureocillium lilacinus, que resultaron codificar para una familia de proteasas destinadas a ejercer actividad antagonista contra un amplio rango de hospederos. Se pudo inferir que las cepas en estudio son buenos candidatos iniciales para formulación de biopreparados destinados al control biológico de organismos plaga en cultivos de interés agrícola en la región, debido a que se encontraron rasgos y genes que permitirán ejercer una amplia acción antagónica.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Evaluación de la fermentación controlada con inoculación de levadura (Meyerozyma caribbica) de café sin despulpar mediante el beneficio vía seca y su efecto en la calidad del café (Coffea arabica)
    (Universidad del Valle, 2025) Escobar Ramírez, Valentina ; Torres Moreno, Juan David; Ramirez-Toro, Cristina; MICROBIOLOGÍA Y BIOTECNOLOGÍA APLICADA
    Investigaciones recientes han evidenciado el potencial de los cultivos iniciadores para mejorar la calidad del café. En este contexto, el presente estudio evaluó el efecto de la levadura Meyerozyma caribbica microencapsulada en un proceso de fermentación controlada por beneficio vía seca del café variedad Castillo, mediante un diseño factorial que consideró tiempos de fermentación de 48 y 72 horas, como concentraciones del cultivo iniciador de 3 %, 5 % y 8 %, incluyendo un tratamiento control para las respectivas comparaciones. La evaluación se realizó a partir del análisis de parámetros fisicoquímicos, microbiológicos y sensoriales. El análisis de varianza permitió identificar una interacción estadísticamente significativa (p < 0,05) entre el tiempo de fermentación y la concentración de inóculo sobre las variables de acidez titulable, pH, azúcares totales y sólidos solubles. La concentración de inóculo, considerada como factor independiente, no mostró un efecto estadísticamente significativo sobre las variables de pH y acidez titulable (p > 0,05). De manera similar, el tiempo de fermentación no presentó significancia estadística sobre la variable de sólidos solubles (p > 0,05). Por otro lado, el análisis microbiológico evidenció una interacción estadísticamente significativa (p < 0,05) entre los factores en cuestión sobre las poblaciones de levaduras y enterobacterias. Por su parte, la concentración de inóculo, considerada de forma independiente, no presentó un efecto significativo (p > 0,05) sobre las poblaciones de bacterias ácido-lácticas y mesófilos. Finalmente, el tiempo de fermentación se consolidó como un factor determinante en el comportamiento de las poblaciones microbianas. En los tratamientos inoculados no se detectaron coliformes totales, mientras que los hongos filamentosos estuvieron ausentes en todas las muestras. Los resultados reflejan mecanismos clave como la degradación de azúcares, una elevada actividad metabólica e interacciones entre poblaciones microbianas que modularon el proceso fermentativo. El tratamiento de escalamiento (5%, 48h) obtuvo 84,50 puntos según la SCA (Specialty Coffee Association), con atributos de fragancia a frutos rojos con sutil sensación de vino tinto, aroma a cereza y sabor a sandía con sensación a cereal con caña. Se obtuvieron valores de 2228,6 mg AG/100 g y 4072,5 mg trolox/100 g como de 1939,2 mg trolox/100 g para contenido fenólico y capacidad antioxidante por metodologías ABTS y DPPH, respectivamente.
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    PublicaciónRestringido
    Genome assembly, structural and functional annotation of orange rust (Puccinia kuehnii) and brown rust (Puccinia melanocephala), phytopathogens of sugarcane
    (Universidad del Valle, 2026) Quiñones Olaya, Angie Valeria; Trujillo Montenegro, Jhon Henry; Rodriguez Castillo, Nohra; BIOINFORMÁTICA Y BIOCOMPUTACIÓN
    BACKGROUND Puccinia melanocephala (brown rust) and Puccinia kuehnii (orange rust) are major biotrophic pathogens severely affecting sugarcane production worldwide. Despite their economic impact, genomic resources for these species remain limited due to challenges inherent to obligate biotrophy, contamination during field sampling, and highly repetitive, dikaryotic genomes. This study aimed to generate high-quality phased genome assemblies for Colombian isolates of both pathogens and to perform structural, functional, and repeat-content analyses to provide foundational genomic resources for comparative genomics and sugarcane breeding programs. RESULTS : PacBio HiFi sequencing combined with LongPlex library preparation and phased assembly using Hifiasm enabled the generation of high-quality haplotype-resolved assemblies for both species. GenomeScope profiles indicated complex dikaryotic architectures, while BlobToolKit analyses identified and removed environmental contaminants, resulting in curated assemblies of 322.68 Mb (P. melanocephala) and 267.89 Mb (P. kuehnii). Compleasm completeness values exceeded 86% in both genomes. Transposable elements dominated both genomes, accounting for 73.7% of P. melanocephala and 68.7% of P. kuehnii, with LTR retrotransposons (Gypsy, Copia) and TIR transposons (Mutator, CACTA) being the most abundant. BRAKER predicted 32,412 and 15,690 protein-coding genes in P. melanocephala and P. kuehnii, respectively, with BUSCO completeness above 80%. Functional annotation with EggNOGmapper identified over 9,000 unique GO terms per species, and enrichment analysis of 1,849 shared genes revealed significant overrepresentation of biological processes and cellular components related to nuclear organization, intracellular signaling, protein transport, and fungal-type cell wall organization. CONCLUSIONS : These genomic assemblies represent the first genomic resources for Colombian isolates of P. melanocephala and P. kuehnii. The strong TE-driven genome expansion, diverse gene repertoires, and enriched functional categories highlight the evolutionary dynamics underlying pathotype diversification and host adaptation. These genomic resources provide a foundation for effector discovery, comparative genomics, and molecular surveillance, and offer valuable tools for sugarcane breeding programs aimed at developing durable resistance against rust pathogens.
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    PublicaciónRestringido
    Kojic acid as an emerging biotechnological product: advances in production, applications, and optimization based on scientific output analysis
    (Universidad del Valle, 2026) Arteaga Muñoz, Laura Daniela; Gómez Martinez, Laura Marcela; Gomez Rios, David Andres; Ramirez-Malule, Howard
    Kojic acid (KA) is a fungal secondary metabolite with recognized applications in cosmetics, pharmaceuticals, and food due to its antioxidant, antimicrobial, and depigmenting properties. However, industrial production remains limited by low fermentation yields and high costs. To assess the research landscape, a bibliometric analysis was performed using the Scopus database (1993– 2025), focusing on original research articles with the keywords “kojic acid” and “production.” Findings reveal a sustained rise in publications since 2010, with marked growth after 2017, led by Asian countries such as South Korea, China, and Japan. Network and cluster analyses identify two main axes of research: process optimization through microbial fermentation and genetic engineering, and biomedical applications related to tyrosinase inhibition. This study consolidates fragmented knowledge, highlights key contributors and trends, and points to future directions such as hybrid bioprocesses and synthetic biology, which are critical to achieving competitive industrial-scale production and expanding KA’s market potential.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Modelado en hardware de sistemas biológicos e implementación con diferentes métodos numéricos
    (Universidad del Valle, 2012) Mejía Duque, Lorena; Velasco-Medina, Jaime
    La biología de sistemas se basa en el modelado de los sistemas biológicos, se enfoca en las interacciones de los componentes del sistema y cómo estos dan lugar a una función que escriba su comportamiento. Los sistemas biológicos desde el punto de vista de la biología no se describen cuantitativamente (usando modelos matemáticos), pero si se caracterizan por seguir algunos principios como la continuidad, la evolución, la diversidad, la homeostasis y la universalidad. Por otro lado, la biosimulación (simulación de sistemas biológicos) emplea las Matemáticas para representar cuantitativamente la dinámica de los sistemas biológicos, los cuales son complejos debido a que cambian en el tiempo y a que están conformados por diferentes elementos interconectados entre sí. Debido a su complejidad, la biosimulación consume muchos recursos computacionales y mucho tiempo de procesamiento. En estas simulaciones, el tiempo es proporcional a la complejidad y la precisión de los resultados sistema. Por ello es necesario tener en cuenta alternativas como la implementación en hardware para mitigar los problemas anteriores.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Technological alternative to enhance biological nitrogen fixation in the rhizosphere of non-leguminous plants
    (Universidad del Valle, 2021) Gutierrez Landázuri, Carlos Fernando; Sanabria Gómez, Irma Janeth; Oyserman, Ben
    Esta tesis explora la fijación biológica de nitrógeno (FBN) realizada por microorganismos del suelo como alternativa a los fertilizantes químicos nitrogenados en plantas no leguminosas. En primer lugar, se destacan los profundos impactos ambientales provocados por la producción y aplicación de fertilizantes nitrrogenados, el último en la agricultura. Se expone la necesidad de alimentar a la humanidad y cómo esto depende de una fertilización adecuada. Luego se propone un enfoque ecológico basado en comunidades microbianas fijadores de nitrógeno para resolver este desafío. En segundo lugar, se revisa el estado del arte para restaurar las funciones microbianas del suelo a través del aislamiento, selección, formulación y aplicación de inoculantes microbianos y consorcios sintéticos. Aquí, se identifican dos deficiencias clave: la dificultad de diseñar biofertilizantes complejos de múltiples especies y el cuello de botella en la ampliación de su producción. Para abordar este desafío se propone fusionar la teoría ecológica con la ingeniería de bioprocesos para producir “comunidades auto ensambladas” enriquecidas, seleccionando gremios particulares y adaptados producir “comunidades auto ensambladas” enriquecidas, seleccionando gremios particulares y adaptados a un suelo objetivo y una planta huésped específica, utilizando el problema del nitrógeno como ancla. En tercer lugar, se presenta la construcción de tres reactores de biopelícula de lecho compacto aireado a escala de laboratorio, inoculados con una comunidad microbiana previamente previamente adaptada, derivada de suelo restaurado naturalmente y alimentada con solución modificada de Hoagland. El nitrógeno solo es proporcionado por aire. Los reactores comunitarios fijan nitrógeno y producen más biomasa que el reactor de cultivo puro del fijador de Nitrógeno Azotobacter vinelandii. Se obtienen y analizan muestras de ADN, resultando 1616 OTUs, que asignan bacterias con un predominio a nivel de filo o familiar que varia entre las muestras, pero similares después que los reactores comunitarios alcanzan el estado estacionario. Finalmente, plantas de tomate son fertilizadas con la solución modificada de Hoagland, con N suministrado solo por biomasa microbiana, a tres concentraciones diferente. Esto permitió que las plantas crecieran significativamente. Además, los análisis de ADN reflejan una comunidad microbiana compleja fijadora de nitrógeno en las rizosferas en cada caso. Los tratamientos N1 y N2 Parecen similares entre sí y con el Inóculo. El suelo original con la diversidad más baja y el N3 con la más alta fueron similares en términos de la ecología funcional. El siguiente paso en futuros estudios será evaluar el nivel de colonización y la interacción entre el microbioma que viene con las semillas y el proporcionado por el tratamiento
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