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Publicación Acceso abierto Microbiota y microbioma endófito del tejido foliar y radicular de Rhizophora mangle L. (Rhizophoraceae) y Avicennia germinans L. (Acanthaceae) en la Bahía de Buenaventura, Colombia(Universidad del Valle, 2025) Cárdenas Hernández, Valentina; Toro-Perea, NelsonEn los ecosistemas de manglar, la comunidad vegetal presenta diferentes adaptaciones que le permiten afrontar las condiciones ambientales estresantes de la zona intermareal. La interacción de las plantas de mangle con sus microorganismos endófitos se suma a estas adaptaciones para contribuir en el desarrollo exitoso de las plantas de mangle. En la interacción planta-endófito, los microorganismos confieren diversas ventajas a las plantas, como el incremento de la resistencia a condiciones extremas y, además, la producción de diversos compuestos bioactivos que pueden ser importantes en aplicaciones biotecnológicas. El objetivo de esta investigación fue caracterizar a nivel taxonómico y funcional la comunidad de endófitos asociados al tejido foliar y radicular de las especies Rhizophora mangle L. (Rhizophoraceae) y Avicennia germinans L. (Acanthaceae) presentes en la bahía de Buenaventura, Colombia. Para responder a este objetivo se empleó la secuenciación de metagenomas completos (WMS, por sus siglas en inglés: Whole Metagenome Sequencing), que permitió secuenciar todo el ADN genómico presente en las muestras de tejido foliar y radicular. Posteriormente, mediante herramientas bioinformáticas, se realizó el análisis taxonómico y funcional de la comunidad de endófitos. Se identificó que la microbiota endófita se constituye principalmente de bacterias, y, en menor proporción, eucariotas, arqueas y virus. También, se determinó que la estructura de la comunidad no se ve influenciada por la planta hospedera, sino por el tipo de tejido, siendo más diversa la comunidad asociada a las raíces. En cuanto al microbioma, se identificaron secuencias codificantes (CDS, por sus siglas en inglés: Coding DNA Sequences) asociadas a funciones relevantes en la adaptación a un bosque de manglar con un alto nivel de intervención humana. Estas categorías funcionales fueron: Tolerancia a la salinidad, desintoxicación por metales pesados y compuestos xenobióticos, y resistencia al estrés por factores bióticos y abióticos. Asimismo, fue posible ensamblar a partir de los metagenomas 24 genomas bacterianos que corresponderían a especies nuevas. En conclusión, nuestros resultados sugieren que los microorganismos endófitos de R. mangle y A. germinans actúan en sinergia con las adaptaciones intrínsecas de los árboles de mangle, permitiendo afrontar los retos que implica establecerse en los bosques de manglar.Publicación Acceso abierto Variación estacional de las larvas de peces asociadas al golfo de Tribugá, Pacífico norte de Colombia(Universidad del Valle, 2025) Rondón Ramos, Mariana; Giraldo, Alan; Aceves Medina, GerardoLa fase larval es un período crítico en el ciclo de vida de los peces, pero su identificación taxonómica, abundancia y variación temporal en ambientes costeros tropicales aún presentan vacíos de conocimiento. Este estudio caracterizó el ensamblaje de larvas de peces en el Golfo de Tribugá, Pacífico norte colombiano, durante dos periodos oceanográficos contrastantes en 2022: aguas frías y cálidas. Las larvas fueron recolectadas mediante arrastres oblicuos desde 20 m de profundidad hasta la superficie, utilizando una red de plancton de 500 μm en 18 estaciones de muestreo. Se registraron parámetros ambientales como temperatura, salinidad, oxígeno disuelto y clorofila-a. En total, se recolectaron 539 larvas, pertenecientes a 98 especies de 31 familias. Se encontraron diferencias significativas en la composición del ensamblaje larval entre ambos periodos. Durante el periodo frío, las especies dominantes fueron Auxis rochei (39,50%), Anchoa spp. (9,31%) y Cubiceps pauciradiatus (8,37%), mientras que en el periodo cálido predominaron Gerreidae sp.5 (13,31%), Gobiesox sp.1 (8,14%) y Eucinostomus gracilis (6,28%). El periodo frío presentó una menor riqueza específica (número de especies), con un claro predominio de Auxis rochei (familia Scombridae), posiblemente favorecida por el aumento de la productividad primaria asociada al afloramiento estacional, lo cual fue evidenciado por los valores registrados de clorofila-a. Estos patrones coinciden con estudios realizados en otros ecosistemas tropicales, donde las fluctuaciones en la disponibilidad de nutrientes y la estabilidad de la columna de agua influyen significativamente en la estructura de los ensamblajes larvales. Los resultados sugieren que el Golfo de Tribugá actúa como un área de reclutamiento y crianza de larvas de peces, con diferencias marcadas entre especies de hábitos costeros y oceánicos. Se resalta la importancia de estrategias de manejo pesquero y monitoreo ambiental para la conservación de este ecosistema, dada su relevancia para la sostenibilidad de especies de importancia comercial.Publicación Acceso abierto Evaluación mediante SNP´S de regiones genómicas asociadas con la severidad de la anemia de células falciformes(Universidad del Valle, 2014) Lizarralde Iragorri, María Alejandra; Barreto Rodríguez, Guillermo; Fong Reales, Cristian JavierLos niveles altos de hemoglobina fetal (HbF) modulan de manera positiva los diferentes síntomas relacionados con la Anemia de Células Falciformes (enfermedad generada por una mutación en el sexto codón del gen de la β-globina), al inhibir la polimerización de la HbS, diluyendo su concentración intracelular, lo que disminuye la severidad de la enfermedad. El cómo es regulada este tipo de hemoglobina en edades adultas, ha sido el objetivo de muchas investigaciones en las cuáles se ha encontrado que la región promotora del gen γG, la región intergénica HBS1L-MYB y el gen BCL11A tienen marcadores genéticos asociados con la modulación de la HbF. Debido a la heterogeneidad de la población colombiana, se quiso establecer en el presente estudio cuáles de los marcadores genéticos reportados juegan un papel importante en la modulación de esta hemoglobina. Para ello se secuenció la región promotora del gen de γG, y se genotiparon siete SNPs (rs9399137, rs28384512, rs4895441, rs7776054, rs6929404, rs4671393 y rs11886868) ubicados en la región intergénica HBS1L-MYB y el gen BCL11A en población sana y enferma de las costas colombianas, por medio de técnicas como el SNapShot y la RT-PCR. Se encontró que en la región promotora de γG los SNP’s evaluados en los individuos con drepanocitosis no se relacionaron con los niveles de HbF, mientras que para los individuos sanos los SNP’s -309 y -16 si mostraron relación con los niveles de ésta hemoglobina. En cuanto a los SNPs evaluados en las otras dos regiones, sólo el rs28384512 se asoció con los niveles de HbF, siendo en los individuos sanos el alelo ancestral (A) y no el alterno (G) quien está modulando la asociación con los niveles de hemoglobina fetal alta, ocurriendo lo contrario con los individuos con anemia falciforme. Estos resultados indican que la población colombiana puede presentar una batería propia de SNPs implicados en la regulación de la hemoglobina fetal debido a la heterogeneidad de la población, sin embargo, se hace necesario ampliar el tamaño de la muestra para futuros estudios.Publicación Sólo datos Elaterididos de dosel (coleoptera: elateridae) de la cuenca Amazónica ecuatoriana : descripción taxonómica y evaluación de la diversidad espacial y temporal(Universidad del Valle, 2013) Aguirre Tapiero, María del Pilar; Carrejo Gironza, Nancy SorayaUtilizando como método de muestreo la nebulización o comúnmente conocido como “Fogging”, se estudió la diversidad y se identificaron los elateridae arbóreos presentes en la reserva Onkone-Gare (Parque Nacional Natural Yasuní) – Selva Amazónica Ecuatoriana. En el marco del proyecto “Diversidad de Artrópodos de dosel” dirigido por TL. Erwin, se muestrearon 100 sitios de 3 x 3 m dentro de un área de 100 x 1000m de bosque de terra firme (selva no inundable) en seis fechas de muestreo, desde enero de 1994 hasta octubre de 1996. Con la ayuda de claves dicotómicas y descripciones específicas, se identificaron 1327 especímenes, agrupados en 94 especies. Una redescripción de la especie Anchastus,boulardi Chassain es presentada, así como también los nuevos registros del género Physorhinus Eschscholtz ssp y del género Cardiorhinus Eschscholtz para Ecuador. En cuanto a la estimación de los patrones de diversidad (alfa, beta y gamma), las proporciones de las especies que estuvieron representadas por un solo individuo por fecha (singletons) tuvieron un rango de 38,2%. La estimación estadística de la riqueza de especies indicó la presencia de 8 a 67 especies en las fechas de muestreo. Las curvas de acumulación total no se estabilizaron a los largo de todo el estudio. Se observaron diferencias significativas en la composición de especies entre las fechas de muestreo. El ensamblaje de los elatéridos estuvo compuesto en su mayoría por especies de poca abundancia y la estimación de la riqueza para la zona fue alrededor de 150 morfoespecies. Entre los niveles de muestreo se encontraron diferencias significativas entre los meses y años para todas las variables ecológicas consideradas. Estas variables presentaron autocorrelación temporal positiva y significativa, pero la autocorrelación espacial no fue significativa. Para analizar los patrones de diversidad se utilizó una aproximación de partición multiplicativa. Esta aproximación reveló que existe un recambio alto entre los años y entre los meses de muestreo, pero en los transectos se obtuvo un recambio más bajo que el esperado; este recambio es mantenido entre las especies poco frecuentes, pero las especies comunes no varían su composición entre los niveles de muestreo considerados. En total, el alto porcentaje de especies no descritas, la falta de nivelación de las curvas de acumulación y la baja proporción de especies compartidas, indican que la diversidad de elatéridos de dosel es mucho más alta de lo pensado.Publicación Acceso abierto Integración, modularidad y desplazamiento de caracteres morfológicos en dos especies de murciélagos neotropicales(Universidad del Valle, 2024) Ferro Muñoz, Lineth Natalia; Giraldo, AlanEl desplazamiento de caracteres es un patrón que describe cómo las especies emparentadas presentan una mayor similitud morfológica en condiciones de alopatría que en simpatría, y generalmente surge como respuesta a la competencia por recursos. Las comunidades de murciélagos neotropicales se destacan como ejemplos claros de coexistencia de especies abundantes en nichos ecológicos similares. Con el fin de entender los mecanismos que pueden estar promoviendo la coexistencia de especies en las comunidades tropicales, se evaluó la existencia de desplazamiento de caracteres en dos especies de Carollia. Para esto se caracterizó la forma del cráneo y la mandíbula en poblaciones simpátricas y alopátricas, por medio de morfometría geométrica. Se estimaron las distancias de Mahalanobis, para establecer si las poblaciones simpátricas se diferencian más en la forma de las estructuras que las poblaciones alopátricas. Además, se evaluaron diferentes hipótesis de modularidad y se determinó la fuerza de integración morfológica, para establecer si el cambio de la forma en las especies se correlaciona con estos atributos. Se encontró igual grado de similitud morfológica al comparar la forma entre las poblaciones simpátricas y alopátricas, indicando ausencia de desplazamiento de caracteres. Por otro lado, el cráneo y la mandíbula fueron estructuras integradas, presentando la mayoría de los cambios en los módulos relacionados con la alimentación. Además, la variación morfológica fue mayor en C. brevicauda que en C. perspicillata, indicando que la modularidad e integración no se relacionaron con las diferencias observadas entre las especies. Los resultados sugieren que el grado de diferencia morfológica de ambas especies es suficiente para permitir su coexistencia, la cual se puede ver favorecida también por un uso diferencial de los recursos alimenticios. Además, atributos diferentes a la modularidad e integración pueden facilitar la variación morfológica en el cráneo y la mandíbula de estos taxones.Publicación Acceso abierto Influencia de la fragmentación sobre las redes de interacción, la diversidad funcional y filogenética de murciélagos frugívoros en el bosque seco tropical(Universidad del Valle, 2024) Velásquez Roa, Leidy Tatiana; Murillo-García, Oscar EnriqueLa fragmentación reduce la riqueza y modifica la composición de las especies que habitan el interior del bosque, causando cambios significativos en las redes de interacción entre especies. Estas alteraciones pueden tener consecuencias directas en procesos críticos para la reproducción de las plantas y el mantenimiento de los bosques. Ante esta situación, es crucial examinar cómo la fragmentación afecta la estructura de las redes de interacción entre plantas y animales, especialmente en ecosistemas bajo amenaza como los Bosques Secos Tropicales (BsT). Para ello, se recolectó información sobre las interacciones entre especies de murciélagos y las plantas que consumen en 10 remanentes de BsT de Colombia. Adicionalmente, se realizó la caracterización de cada remanente a través de métricas del paisaje y se relacionó con propiedades estructurales de las redes de interacción (anidamiento, modularidad y robustez). Asimismo, con el fin de incluir el efecto de la variación espacial en las interacciones planta-murciélagos sobre la modularidad, se utilizó un enfoque de redes de interacción de múltiples capas. Finalmente, se calculó la diversidad beta de las interacciones entre los fragmentos y se descompuso en los componentes del recambio de especies y el recambio de interacciones, y se evaluó si estos están asociados con la distancia entre los fragmentos. En total se capturaron 1142 individuos de 36 especies de murciélagos de las cuales 28 especies pertenecen a la familia Phyllostomidae y 19 especies presentaron hábitos frugívoros, obteniendo de sus heces más de 19600 semillas. Se encontró que la fragmentación afecta el anidamiento y la robustez a las diferentes escalas evaluadas (fragmento, buffer de 2.5 km y buffer de 5 km). Se encontró que en los fragmentos más cercanos tiende a existir una composición similar de especies y de interacciones. Los resultados sugieren que, aunque la fragmentación afecta el anidamiento y la robustez de las redes de interacción de los remanentes, la alta flexibilidad de las interacciones de plantas y murciélagos enmascara un efecto de la disminución del hábitat y el aislamiento sobre la estructura modular.Publicación Acceso abierto Identificación de genes putativos de lacasas del metagenoma de suelo de bosque Alto Andino - Parque Nacional Natural "Los Nevados" - Colombia(Universidad del Valle, 2017) Bolaños Martinez, Ivon Andrea; Vélez Varela, Patricia E.; Moreno, Pedro A.A pesar de la amplia biodiversidad colombiana en todos sus aspectos, la bioprospección a partir de comunidades microbianas presentes en los diferentes ecosistemas del país es incipiente y una de las más importantes razones es debida al desconocimiento de las potencialidades de los metagenomas provenientes del suelo. La Metagenómica nos permite el estudio de comunidades enteras de microorganismos sin necesidad de aislarlas previamente, determinando su estructura y su potencial función biotecnológica. Este es el caso de las lacasas, enzimas oxidoreductasas que catalizan la oxidación de varios compuestos aromáticos y fenólicos, característica que les confiere algunas aplicaciones en biorremediación, decoloración y deslignificación, entre otras. El objetivo del actual estudio se enfocó en la identificación de genes putativos de lacasas a partir de librerías Metagenómicas de suelo de Bosque Alto Andino. Por medio de un tamizaje bioinformático preliminar se obtuvieron predicciones con dominios conservados característicos de las lacasas, que fueron evaluadas a nivel molecular. Se realizó la réplica y evaluación de la biblioteca de fósmidos del metagenoma de Bosque Alto Andino, logrando la identificación del gen de lacasa CueO procedente de la bacteria Escherichia coli con un porcentaje de identidad que va de 87-100% mediante el uso de cebadores degenerados diseñados en este estudio y de los cebadores reportados por (Ausec et al., 2011). El tamizaje de bibliotecas realizado en la actual investigación permite la identificación de enzimas de alto potencial industrial, constituyendo una excelente herramienta para considerar el ecosistema de páramo como un gran reservorio para la Bioprospección.Publicación Acceso abierto Aspectos ecológicos de Centrolene Savagei en las coordilleras central y occidental de Colombia(Universidad del Valle, 2016) Prado Sañudo, María Lucía; Giraldo López, AlanCentrolene savagei hace parte familia Centrolenidae y es una especie endémica de Colombia. Se caracteriza por ser una rana pequeña, de color verde pálido, con puntos azules, verdes y blancos en el dorso, por la ausencia de espina humeral, rostro redondeado y por la presencia de una línea labial blanca bastante visible. Esta especie presenta cuidado parental sobre las posturas, siendo protegidas por los machos los cuales se ubican directamente sobre ellas. Con el objetivo de cuantificar el estado de las poblaciones de Centrolene savagei y evaluar algunos aspectos ecológicos de esta especie en las Cordilleras Central y Occidental de Colombia, haciendo énfasis en las estrategias de cuidado parental de las posturas que exhiben los machos de esta especie y la tendencia de los individuos a perchar en alturas superiores a 2 m del suelo, se realizaron muestreos en 8 localidades donde se encuentra reportada la especie. Se utilizó la técnica de captura-recaptura para estimar el tamaño poblacional en cada una de las localidades, y se tomaron registros de sexo y estado reproductivo de los individuos, número de posturas y número de huevos por postura con el fin de estimar la fertilidad y éxito reproductivo de cada población. Se evaluó la presencia de cuidado parental durante diferentes horas del día y de la noche, con el fin de determinar la variación de dicho comportamiento en la especie; así mismo se registraron datos de temperatura, humedad relativa, precipitación, radiación y cobertura vegetal en los sitios de postura con el propósito de evaluar su relación con la presencia o ausencia del macho. Por último, se evaluó la selección vertical de hábitat por parte de esta especie. Se registró la presencia de la especie en 6 de las 8 localidades estudiadas, lográndose estimar el tamaño poblacional solo para 3 de ellas. Los machos de Centrolene savagei presentan una preferencia significativa por sitios de percha entre 0.1-2.0m de altura, y las posturas se encuentran principalmente a alturas entre 1.5-2.0m; las hembras por su parte permanecen a alturas superiores a los 6 metros y solo bajan para la reproducción. El tamaño de las posturas no guarda relación alguna con el sitio de ovoposición, por el contrario, puede estar asociado a otras variables no evaluadas. Se presenta una gran tendencia al cuidado de las posturas por parte del macho, sin embargo, el cuidado tiende a ser menor en las horas del día; pese a esto, la presencia o ausencia del macho, no está relacionada con las condiciones climáticas o ambientales de cada localidad.Publicación Acceso abierto Evaluación de los criterios implementados en la categorización del riesgo de extinción de aves de Colombia y la contribución de elementos filogenéticos al riesgo de amenaza en especies del género Coeligena (Aves:Throchilidae)(Universidad del Valle, 2018) Pérez Amaya, Natalia Juliet; Sedano Cruz, Raul ErnestoA través de la aplicación de modelos logísticos ordinales y probit ordinales para los libros rojos de aves de Colombia. Tan solo cinco de las 47 variables analizadas resultaron ser informativas en la categorización de acuerdo al riesgo de extinción para las aves en Colombia: endemismo, hábitat potencial, presencia en áreas protegidas, tamaño y límite superior en la distribución altitudinal. Variables que en conjunto presentan un poder de predicción de más del 51%. Se encontró que la información contenida en los libros rojos es insuficiente para la implementación de modelos predictivos del riesgo de amenaza, ya que, de estas cinco variables, tan solo una (hábitat potencial) hace parte de las variables tenidas en cuenta en el proceso de categorización de acuerdo al riesgo de extinción. La gran cantidad de atributos de la biología de las especies (cuatro de cinco) que resultaron ser informativas en el proceso de categorización de especies, y la recuperación de una única variable que hace parte de los criterios utilizados en el proceso de categorización de acuerdo al riesgo de extinción para aves de Colombia, da cuenta de la importancia de la evaluación de los procedimientos y criterios usados históricamente en este proceso, además, señala el aporte que pueden llegar a tener otro tipo de atributos de la biología de las especies en este contexto.Publicación Acceso abierto Caracterización fisiológica y fitosanitaria de las semillas de Sacha inchi (Euphorbiaceae: Plukenetia volubilis)(Universidad del Valle, 2018) Acosta Ramírez, Cindy Juliana; Benitez Campo, Neyla; Torres González, Alba MarinaEl Sacha Inchi (Plukenetia volubilis L.) es una planta nativa de la Amazonía, conocida también como maní del monte, sacha inchik y maní del inca, es una especie de importancia para la agroindustria de aceites, ya que se ha encontrado gran producción de ácidos grasos polinsaturados tipo omega (3, 6 y 9) en sus semillas. Dada su potencial producción es primordial la caracterización fisiológica de las semillas y el análisis fitosanitario, que permita determinar el comportamiento germinativo, identificar y determinar la proporción de microorganismos asociados a las semillas. Los microorganismos pueden ser trasportados adheridos a la superficie de la semilla, en su interior o como parte del material inerte. Se midió la capacidad de germinación de P. volubilis, bajo diferentes condiciones de temperaturas (25/35 y 20/30° C), con o sin imbibición, con y sin escarificación, a diferentes intensidades de luz (luz blanca, oscuridad total, pulso de luz a baja y alta relación con rojo lejano), y se realizó una prueba de conservación ex situ de semillas. Se evaluó la sanidad de la semilla para lo cual se utilizaron cuatro tratamientos (con testa-con desinfección, con testa-sin desinfección, sin testa-con desinfección y sin testa-sin desinfección), en cajas de Petri con medio de cultivo PDA (Papa-Dextrosa-Agar), con el propósito de identificar microorganismos macro y microscópicamente.Publicación Acceso abierto Comunidades vegetales y ensamblaje arbóreo en un gradiente de intensificación de café en el suroccidente colombiano.(Universidad del Valle, 2016) Meneses Rengifo, Oscar Eduardo; Armbrecht, IngeLos bosques premontanos presentan un alto grado de deterioro por efecto de la intervención antrópica, donde las principales actividades son agrícolas y ganaderas. Dada la pérdida de conectividad entre los parches de bosque, es prioritario desarrollar propuestas agroecológicas que involucren un manejo sostenible de los recursos naturales en estos paisajes, pues una parte importante de la biodiversidad todavía se encuentra habitando estos agroecosistemas. Este estudio evaluó la intensificación agrícola (IA) en un gradiente de manejos de caficultura en la meseta de Popayán, Cauca, en una altitud entre 1600-1700m. Se midieron 13 variables estructurales de la vegetación como riqueza, densidad y estructura arbórea en 20 sitios de muestreo: ocho cafetales a plena exposición, ocho con sombrío y cuatro bosques de referencia. Se determinó que la diversidad florística disminuyó en función del IA, donde las variables relacionadas al componente arbóreo fueron las más sensibles al cambio. La composición vegetal estuvo conformada principalmente por especies pioneras y se vio fuerte y negativamente afectada con la transformación de los cafetales de sombra en cafetales de sol. Se concluye que el sombrío, por sí solo, no garantiza la conservación local o regional, ya que se deben realizar prácticas de manejo que involucren la diversificación con flora nativa dentro de los cafetales, la cual es de gran importancia en la conservación biológica regional como fuente de hábitat y de conectividad en los paisajes fragmentados, y además, puede aportar con plántulas y semillas en procesos de restauración que se desarrollen en la zona.Publicación Acceso abierto Diversidad y composición de hormigas y escarabajos carábidos del suelo en un paisaje cafetero del Cauca, Colombia.(Universidad del Valle, 2017) Arenas Clavijo, Anderson; Armbrecht de Peñaranda, IngeSe evalúa el efecto del tipo de manejo agrícola de los cafetales (sol y sombra) sobre la diversidad de hormigas y escarabajos carábidos del suelo, comparados con parches de vegetación natural, y teniendo en cuenta el avance de un proceso climático de gran escala, el fenómeno de El Niño. El estudio se realizó en dos veredas de Caldono- Cauca. Los especímenes se obtuvieron en dos sesiones de colecta con dos técnicas de muestreo: trampas de caída y extracción de hojarasca con sacos mini-Winkler, en ocho unidades de muestreo por cada uso del suelo. La acumulación de especies mostró que el muestreo de hormigas fue representativo. Por su parte, la representatividad de los carábidos fue baja. La riqueza esperada de hormigas fue mayor en los parches de vegetación natural que en los sistemas cultivados, mientras que los carábidos tuvieron una riqueza esperada similar entre los usos del suelo. La riqueza de hormigas en parches de vegetación natural disminuyó con el avance de la sequía, las hormigas y los carábidos omnívoros fueron más abundantes en cafetales de sol, los carábidos depredadores fueron más ricos y abundantes en parches de vegetación. La composición de hormigas de cafetales de sombra se asemejó a la de parches de vegetación natural, y los cafetales de sol tuvieron una comunidad de hormigas muy diferenciable; esto se reflejó en una relativamente alta cantidad de especies indicadoras. Pese a que los carábidos no fueron suficientemente abundantes para ser analizados en términos de la comunidad, presentaron una especie indicadora de uso del suelo, además, se registró una especie que no se reportaba desde su descubrimiento en 1878, y el primer registro de otra especie para el país. Se concluye que los cafetales de sol homogenizan la diversidad de hormigas, que los parches de vegetación mantienen una diversidad única de hormigas y carábidos, y que los cafetales de sombra contribuyen al mantenimiento de parte de esa diversidad.Publicación Acceso abierto Análisis cladístico de los grupos de especies del género Lachesilla westwood (Psocodea: psocomorpha: lachesillidae)(Universidad del Valle, 2016) Saenz Manchola, Oscar Fernándo; Gonzalez Obando, Ranulfo; García Aldrete, Alfonso NeriLachesilla es el género más grande de la familia Lachesillidae, cuenta con alrededor de 310 especies descritas, agrupadas fenéticamente en 20 grupos de especies. Con el objetivo de establecer las relaciones entre esos grupos, se realizó un análisis filogenético con 51 especies y 70 caracteres morfológicos, explorando las topologías más parsimoniosas bajo análisis de peso iguales (EW) e implícitos (IW). Como resultado de ambos análisis, el género Lachesilla no se recuperó como monofilético, dividiéndose en dos grandes clados; el clado A conformado por el grupo de especies Pedicularia + Nadleria, y el clado B conformado por los restantes 19 grupos de especies. El análisis de pesos implícitos (IW) logró una topología más corta y con mejor resolución, permitiendo establecer dentro del clado B, tres subclados con bajos valores de soporte de ramas. El subclado BI lo conformaron las especies de los grupos Rufa + Corona; el subclado BII incluye las especies de los grupos Riegeli + Patzunensis + Forcepeta, mientras que el subclado BIII está conformado por los grupos Andra + Cerorma + Mexica + Centralis + Sclera + Simojovelensis + Texcocana + Fuscipalpis + Q + Szirackii.Publicación Acceso abierto Evaluación experimental del impacto de la sedimentación en el coral Pocillopora damicornis en la Isla Gorgona(Universidad del Valle, 2016) Zambrano Franco, Valentina; Zapata Rivera, Fernando AlbertoLa sedimentación extrema en arrecifes coralinos puede causar acumulación de sedimento y enterrar colonias de coral. La tolerancia al enterramiento puede variar dependiendo de las condiciones ambientales y de las especies. En el arrecife de La Azufrada en la Isla Gorgona (Pacífico colombiano), es común observar coral enterrado en el límite del trasarrecife, y aunque P. damicornis (la especie dominante en este arrecife) es tolerante a alta sedimentación, se desconocen sus límites de tolerancia al enterramiento. Con el fin de evaluar los límites de tolerancia de P. damicornis y conocer los efectos del enterramiento sobre la supervivencia, pérdida de tejido vivo, crecimiento, fecundidad, capacidad autotrófica (basada en la densidad de zooxantelas) y producción de mucus (basada en densidad de mucocitos), se realizó un experimento en campo. Tres colonias adultas de P. damicornis fueron enterradas durante 1, 2, 4, 8, 10, 12, 14, 16, 22, 44, 66 o 90 horas (N total = 36 colonias). Las colonias de P. damicornis enterradas hasta 8 h sobrevivieron sin perder más del 5 % del tejido vivo y sin presentar blanqueamiento.Publicación Acceso abierto Efecto del distanciamiento geográfico y variación de hospedero en Prodiplosis longifila (Cecimomyidae), y análisis poblacional de Prodiplosis floricola (Diptera: Cecimomyidae)(Universidad del Valle, 2016) Duque Gamboa, Diana Nataly; Toro Perea, NelsonProdiplosis longifila (Gagné) (Diptera: Cecidomyiidae), se ha reportado como plaga de un amplio rango de hospederos en américa, incluyendo cítricos, solanáceas y asparagáceas. Las poblaciones norteamericanas y suramericanas de esta especie presentan rasgos comportamentales diferentes en cuanto a hábitos de ovoposición y alimentación de las larvas sobre estructuras específicas, dependiendo del hospedero. Sin embargo, hay carencia de información de historia natural de este insecto y no se cuenta con estudios biogeográficos, razón por la cual no se tiene certidumbre de si las poblaciones suramericanas son en realidad P. longifila. El objetivo central de esta investigación fue realizar un estudio filogenético y de genética de poblaciones en la especie, para definir si las poblaciones norteamericanas y suramericanas corresponden a la misma especie, o si se ha presentado un proceso de diferenciación por distanciamiento geográfico; como también determinar si en Suramérica la especie ha presentado diferenciación por especialización sobre cultivos hospederos. Los análisis filogenéticos y poblacionales basados en el código de barras del ADN y una región de ADNr permitieron evidenciar clados divergentes atribuibles a distanciamiento geográfico y especialización por hospedero. Fue posible corroborar que los especímenes norteamericanos y suramericanos de P. longifila, no son idénticos genéticamente debido a un proceso de diferenciación por distanciamiento geográfico, las distancias genéticas encontradas indican la formación de especies crípticas entre dichos grupos. La composición haplotípica de P. longifila proveniente de los cultivos analizados, tomate y pimentón (solanáceas); y limón tahití y limón pajarito (cítricos), evidencia diferenciación genética entre los haplogrupos asociados a hospedero, lo que indica que se ha presentado la formación de especies crípticas asociadas a hospederos. Adicionalmente, los análisis moleculares basados en COI, determinaron la presencia de una especie congenérica en simpatría con P. longifila, cuyo nombre es Prodiplosis floricola (Felt), la cual no fue detectada inicialmente por la taxonomía morfológica. Esta especie se encontró restringida a limón tahití y limón pajarito, lo que constituye su primer reporte para Colombia; y se caracterizó molecularmente las poblaciones encontradas.Publicación Acceso abierto Características estructurales y funcionales de la red trófica marina costera de la zona central del Pacífico colombiano(Universidad del Valle, 2015) López García, Juliana; Navia López, Andrés Felipe; Giraldo López, AlanMediante una representación topológica, se construyó la red trófica de la zona central del Pacífico colombiano, utilizando una matriz de presencia ausencia, con información de dietas de 286 especies o grupos funcionales, colectada para la zona entre 1990 y 2014 y complementada con información bibliográfica. Se realizó la descripción general de la red obteniendo un total de 1725 conexiones. La densidad acumulada de dichas conexiones sugirió que la red presenta una distribución tipo ley de potencia y una baja conectancia (0.02). Además, se encontró que las proporciones depredadores: presas y tope: basales fueron menores a uno (0.89 y 0.24 respectivamente) y que la red tiene mayor aporte de especies de niveles tróficos intermedios (82.16%).Publicación Acceso abierto Efectos de microorganismos entomopatógenos y antagónicos como potenciales agentes de control biológicos de hormiga arriera Atta cephalotes (Hymenoptera: Myrmicinae)(Universidad del Valle, 2014) Valencia, Sandra Milena; Montoya Lerma, JamesAtta cephalotes (L.) (Hymenoptera: Myrmicinae) es la más abundante de las hormigas cortadoras de hojas en Colombia. Sus altas poblaciones, consecuencia del incremento de áreas fragmentadas, ocasionan pérdidas en cultivos de importancia agrícola y forestal. El control con insecticidas químicos, es poco efectivo y sus efectos ambientales muy controvertidos. Como alternativa, se busca promover el control natural. En esta dirección, se evaluó la capacidad antagónica de nueve aislados nativos de hongos y nueve de bacterias sobre L. gongylophorus y Serratia marcescens, simbiontes de esta especie de hormiga. Además, se evaluó la actividad insecticida de los mismos aislados, mediante contacto e ingestión. Aquellos microorganismos que demostraron tener actividad antagónica y/o entomopatógena, fueron enfrentados para establecer el grado de coexistencia.Publicación Acceso abierto Aplicación de técnicas de morfometría geométrica en la diferenciación del tamaño y la forma de conchas de caracoles marinos Plicopurpura pansa (Gould 1953) y Plicopurpura patula (Linneo 1758)(Universidad del Valle, 2013) Parra Carrillo, Diego Fernando; Cantera Kintz, Jaime RicardoPor medio de técnicas de morfometría geométrica se obtuvieron variables asociadas al tamaño y la forma de las conchas de los caracoles marinos Plicopurpura pansa y Plicopurpura patula. La finalidad del estudio fue validar o descartar diferencias en el tamaño y la forma de las conchas de dichas especies. En total se analizaron 385 individuos correspondientes a dos localidades del Pacífico y cuatro del Caribe Colombiano. La morfometría geométrica resultó ser una técnica accesible y efectiva para encontrar diferencias estadísticas significativas en el tamaño y la forma de las conchas de las dos especies. Se encontró que las conchas de P. pansa son significativamente más grandes que las de P. patula, la causa podría ser el fenómeno de surgencia que ocurre con mayor intensidad en la cuenca del Pacífico y que conlleva a una mayor productividad. Sin embargo, se requieren estudios para validar esta hipótesis. En relación con la forma de las conchas, también se encontraron diferencias significativas entre las dos especies. Sin embargo, estás diferencias no se pueden identificar a simple vista, se necesitó de un análisis canónico multivariado, acompañado de técnicas morfogeométricas. Este resultado coincide con la definición de especies gemelas o crípticas. En ambas especies se encontró una relación directa entre la forma y el tamaño de las conchas (Alometría) y dos morfotipos posiblemente asociados con el grado de exposición al oleaje. Se sugiere realizar comparaciones a nivel molecular y pruebas de cruzamiento para validar aislamiento reproductivo y afirmar con certeza que P. pansa y P. patula son dos especies biológicas reales.Publicación Acceso abierto Ecología poblacional de la tortuga de río chocoana (Rhinoclemmys nasuta, Boulenger 1902) en tres localidades de la Costa Pacífica del Valle Del Cauca(Universidad del Valle, 2013) Garcés Restrepo, Mario Fernando; Giraldo, Alan; Carr, John LLa Tortuga de río chocoana (Rhinoclemmys nasuta) se considera endémica del Chocó Biogeográfico, casi amenazada (NT) mundialmente y de datos deficientes (DD) en Colombia. Justificados por su grado de amenaza y desconocimiento, se realizó una investigación para conocer como varían aspectos demográficos de esta especie en localidades con diferentes grados de aislamiento natural y perturbación humana, en localidades costeras de la región central del Pacifico colombiano (Isla Palma, San Pedro y Playa Chucheros). Se calcularon la densidad, tamaño y estructura poblacional, así como las probabilidades de supervivencia y de captura para machos, hembras y juveniles. Adicionalmente, se relacionó la densidad poblacional con características abióticas (profundidad, accesos a tierra; número de escondites, sustrato) y bióticas (cobertura vegetal y porcentaje de parasitismo) del hábitat a dos escalas (localidad y riachuelos). La mayor densidad poblacional y la mayor probabilidad de supervivencia se registraron en la localidad insular de Isla Palma, posiblemente como consecuencia de una menor cantidad de depredadores presentes en esta localidad y una menor tasa de infestación por ectoparásitos. En la localidad insular la población estuvo dominada por la clase etaria de juveniles, mientras que en las localidades continentales la población estuvo dominada por adultos. En todas las localidades la proporción de sexos fue dominada por hembras, es posible que esta condición esté relacionada con la temperatura de determinación entre sexos. La especie prefirió riachuelos con menor cobertura vegetal, muchos escondites, baja profundidad y dominados por roca. Aunque se puede considerar que la especie es tolerante a ambientes alterados, la perturbación humana afecta la distribución por edades de las poblaciones, lo que con el tiempo puede llegar a generar reducciones poblacionales. Adicionalmente, para conocer cambios demográficos en el tiempo de esta especie se utilizó información recopilada entre el 2005 y el 2012 en la localidad de Isla Palma. Para ello se calculó el tamaño poblacional con el método Jolly-Seber en cuatro periodos (2005-06, 2007, 2011 y 2012), y se comparó la estructura poblacional. Se estimó la probabilidad de supervivencia y probabilidad de captura para machos, hembras y juveniles utilizando el modelo Cormarck-Jolly-Seber, y la tasa de crecimiento poblacional con el modelo POPAN. Se estableció un leve aumento en el tamaño poblacional en el periodo de 2005–06 a 2007 y posteriormente una disminución en el tamaño poblacional y la probabilidades de recaptura para todas las categorías etarias entre el periodo de 2011 a 2012. Se evidenció un aumento significativo del porcentaje de juveniles que hacen parte de la población durante el periodo de estudio. De estos resultados se sugiere que para mantener la persistencia de esta especie se requiere mantener la complejidad de los riachuelos donde habita, así como continuar con el monitoreo constante para evidenciar cambios en el tiempo de los parámetros demográficos de la especie en localidades continentales.Publicación Acceso abierto Termitas en cultivos de cítricos de la región Caribe de Colombia : distribución, incidencia, influencia del manejo del cultivo y del ambiente.(Universidad del Valle, 2012) Abadía Lozano, Juan Carlos; Chacón de Ulloa, Patricia; Arcila Cardona, Ángela MaríaLos cítricos son el segundo producto frutícola de importancia económica en Colombia, sin embargo, en la costa Caribe se presentan algunos problemas que han afectado su producción y entre dichos inconvenientes se ha mencionado a las termitas. El presente trabajo, el cual se encuentra dividido en dos capítulos, tuvo como finalidad establecer la identidad y distribución de las termitas asociadas a los principales cítricos cultivados en la región Caribe colombiana. Igualmente, analizar el efecto del manejo de la finca y de cinco variables abióticas (altitud, temperatura, precipitación, textura y pH del suelo), sobre la ocurrencia de termitas en cultivos de naranja. La zona de estudio correspondió a 17 municipios distribuidos en cinco departamentos, donde en total se muestrearon 61 fincas recolectándose 869 muestras de termitas. Tres especies (Microcerotermes cf. arboreus, Heterotermes convexinotatus y Heterotermes tenuis) fueron relevantes por su abundancia, distribución y por ser reportadas como problema fotosanitario en otros cultivos en Colombia. La modificación que ha sufrido el paisaje caribeño ha facilitado la dispersión de algunos grupos de termitas, principalmente de aquellas especies que se alimentan de madera y tienen anidación subterránea, por lo cual no se encontró una asociación significativa entre el manejo de la finca y la incidencia de termitas.