Secuencias proteicas cortas y sus estructuras secundarias: análisis informático e inferencia biólogica
| dc.contributor.advisor | Tischer, Irene | |
| dc.contributor.author | Mejia Carmona, Diego Fernando | |
| dc.date.accessioned | 2020-04-07T19:22:13Z | |
| dc.date.available | 2020-04-07T19:22:13Z | |
| dc.date.issued | 2013 | |
| dc.description.abstract | La vida como se conoce, no se podría concebir sin las funciones proteicas, que dependen de una estructura tridimensional particular para ser funcionales. La estructura a su vez, depende esencialmente de la secuencia de aminoácidos. Con esto, comprender la vida implica entonces comprender la forma como la secuencia proteica determina la estructura, y a su vez, la función. El conocimiento sobre estructura y función de proteínas es fundamental en las ciencias de la vida, y da origen a campos nuevos como Ingeniería de Proteínas y Nanotecnología Biológica, industrialmente prometedores. La determinación experimental de la estructura es costosa en tiempo, dinero, infraestructura y recurso humano. Con los proyectos genoma y la gran cantidad de información que éstos producen, hay una creciente brecha entre la aparición de secuencias y el conocimiento de la estructura y función proteicas. Los esfuerzos se dirigen entonces a dilucidar computacionalmente la estructura y función proteicas, desde de la secuencia de sus aminoácidos. En este trabajo analizamos datos experimentales de estructuras proteicas enfocándonos en aminoácidos individuales y tripletas de ellos, y su aparición en las estructuras secundarias de las proteínas almacenadas en el Banco de Datos de Estructuras de Proteínas (PDB). A partir de las frecuencias de aminoácidos y tripletas, y de su aparición en estructuras secundarias, se dedujo información en términos de la composición de aminoácidos, estructura secundaria de diferentes grupos de proteínas, su estabilidad estructural y su tendencia a adquirir ó no, otra estructura secundaria, con lo que se identifican combinaciones de residuos que le confieren particularidades estructurales a una proteína, para ser usadas en el rediseño de proteínas. Por otro lado, se reconstruyeron computacionalmente, Proteínas Morfogenéticas de Hueso (BMPs) y enzimas Beta-Lactamasas ancestrales, que luego se resucitaron en el laboratorio. Las Beta-Lactamasas ancestrales se caracterizaron en términos de su actividad enzimática y estabilidad térmica, encontrando que las enzimas reconstruidas presentan mayor promiscuidad de sustrato y mayor termoestabilidad, que sus equivalentes actuales. Las BMPs ancestrales recosntruidas muestran hasta el momento, mayor actividad en la regeneración ósea en cultivo y en huesos de animales pequeños, y se perfilan como candidatas para su uso en cirugías ortopédicas y maxilofaciales. | spa |
| dc.description.degreelevel | Doctorado | spa |
| dc.description.degreename | DOCTOR(A) EN CIENCIAS BIOMÉDICAS | spa |
| dc.format.extent | 1 recurso en linea (258 páginas) | spa |
| dc.format.mimetype | application/pdf | spa |
| dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/10893/14889 | |
| dc.language.iso | spa | spa |
| dc.publisher | Universidad de Valle | spa |
| dc.publisher.faculty | FACULTAD DE SALUD | spa |
| dc.publisher.place | Colombia | spa |
| dc.publisher.program | DOCTORADO EN CIENCIAS BIOMÉDICAS | spa |
| dc.rights.accessrights | info:eu-repo/semantics/openAccess | spa |
| dc.subject.decs | Proteínas | |
| dc.subject.decs | Inferencia | |
| dc.subject.decs | Nanotecnología | |
| dc.subject.decs | Regeneración ósea | |
| dc.subject.decs | Biotecnología-ingeniería genética | |
| dc.title | Secuencias proteicas cortas y sus estructuras secundarias: análisis informático e inferencia biólogica | spa |
| dc.type | Trabajo de grado - Doctorado | spa |
| dc.type.coar | http://purl.org/coar/resource_type/c_db06 | spa |
| dc.type.content | Text | spa |
| dc.type.driver | info:eu-repo/semantics/doctoralThesis | spa |
| dc.type.redcol | https://purl.org/redcol/resource_type/TD | spa |
| dc.type.version | info:eu-repo/semantics/publishedVersion | spa |
| dspace.entity.type | Publication | |
| oaire.accessrights | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | spa |
| oaire.version | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | spa |
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