Las infecciones respiratorias agudas (IRA) son la primera causa infecciosa de morbimortalidad infantil a nivel mundial. La etiología viral es la más frecuente asociada a las IRA, el virus sincitial respiratorio (RSV) y metapneumovirus humano (HMPV) suelen ser los principales virus en las infecciones del tracto respiratorio inferior causando bronquiolitis y neumonía en niños menores de 5 años, con una mayor prevalencia de mortalidad en los menores de 1 año. En Colombia, según la OMS, las IRA ha causado 22.331 muertes infantiles desde el 2000 hasta el 2015. Tal mortandad representa el 17.5% de muertes por causas infecciosas en niños entre 1 y 59 meses, seguida por la diarrea con un 4.5% de muertes infantiles. En los últimos años se han reconocido virus no tradicionales como posibles agentes etiológicos de las IRA, uno de los más importantes es el HMPV descrito desde el 2001 en Los Países Bajos causando IRA en menores de cinco años. Recientemente no se conocen estudios sobre la frecuencia viral en las IRA de la ciudad de Cali.