Metodología y algoritmo para la construcción de una matriz de sustitución generalizada para alfabetos arbitrarios que describen secuencias biológicas

dc.contributor.advisorTischer, Irene
dc.contributor.authorGonzalez Muñoz, Yerminson Doney
dc.date.accessioned2020-06-05T13:35:23Z
dc.date.available2020-06-05T13:35:23Z
dc.date.issued2015
dc.description.abstractEn este documento se presenta una propuesta para desarrollar e implementar una metodología para la construcción de una matriz de sustitución generalizada para alfabetos arbitrarios que describen secuencias biológicas. El desarrollo de esta propuesta se realiza mediante el seguimiento de un conjunto de pasos que van desde el entendimiento conceptual del problema, el desarrollo de la metodología, y la implementación de los algoritmos correspondientes que permitan la construcción de una matriz de sustitución generalizada, la cual se utilizará en un algoritmo de alineamiento que sirva para probar algunos casos de estudio. A partir de la base de datos BLOCKS se obtuvieron nuevas bases de datos que representan tuplas y tripletas formadas a partir de las secuencias de proteínas pertenecientes a cada uno de los bloques. Mediante el uso del algoritmo BLOSUM se obtuvieron matrices de sustitución generalizadas mostrando así que es posible desarrollar una metodología y construirlas mientras se tenga claridad sobre el alfabeto que se va a utilizar.spa
dc.description.degreelevelPregradospa
dc.description.degreenameINGENIERO(A) DE SISTEMASspa
dc.format.extent1 recurso en línea (46 páginas)spa
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/10893/15651
dc.language.isospaspa
dc.publisherUniversidad del Vallespa
dc.publisher.facultyFACULTAD DE INGENIERÍAspa
dc.publisher.placeColombiaspa
dc.publisher.programINGENIERIA DE SISTEMASspa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessspa
dc.subject.ddcAlgoritmos
dc.subject.ddcMatriz de sustitución
dc.subject.ddcAminoácidos
dc.subject.ddcBases de datos
dc.subject.ddcBioinformática
dc.titleMetodología y algoritmo para la construcción de una matriz de sustitución generalizada para alfabetos arbitrarios que describen secuencias biológicasspa
dc.typeTrabajo de grado - Pregradospa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fspa
dc.type.contentTextspa
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisspa
dc.type.redcolhttps://purl.org/redcol/resource_type/TPspa
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersionspa
dspace.entity.typePublication
oaire.accessrightshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2spa
oaire.versionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85spa
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